MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006397	GA	3	6	320	325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006397	TC	3	6	328	333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006397	CT	3	6	800	805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006397	AC	3	6	881	886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006397	GC	3	6	1227	1232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006397	AC	3	6	2570	2575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006397	AC	3	6	2895	2900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006397	CG	3	6	2965	2970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006397	AG	3	6	3417	3422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006397	AC	3	6	3597	3602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006397	GT	3	6	4075	4080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006397	CG	3	6	4104	4109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006397	TC	3	6	4739	4744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006397	TC	3	6	4817	4822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006397	CT	3	6	5239	5244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006397	TA	3	6	5698	5703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006397	AC	3	6	5759	5764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006397	CG	3	6	6130	6135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006397	TG	3	6	6136	6141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006397	GA	3	6	6430	6435	50 %	0 %	50 %	0 %	55380075
21	NC_006397	TG	3	6	6811	6816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006397	GA	3	6	7025	7030	50 %	0 %	50 %	0 %	55380076
23	NC_006397	GC	3	6	7045	7050	0 %	0 %	50 %	50 %	55380076
24	NC_006397	CA	3	6	7353	7358	50 %	0 %	0 %	50 %	55380076
25	NC_006397	AG	3	6	7473	7478	50 %	0 %	50 %	0 %	55380076
26	NC_006397	AT	3	6	8156	8161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006397	TA	3	6	8240	8245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006397	TA	3	6	8300	8305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006397	AC	3	6	8326	8331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006397	AT	3	6	8925	8930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006397	CT	3	6	9479	9484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006397	TC	3	6	9745	9750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_006397	TC	3	6	10117	10122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006397	AG	3	6	10131	10136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006397	TA	3	6	10137	10142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006397	GA	3	6	10210	10215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006397	TC	3	6	10644	10649	0 %	50 %	0 %	50 %	55380078
38	NC_006397	GA	3	6	11175	11180	50 %	0 %	50 %	0 %	55380078
39	NC_006397	GA	3	6	11348	11353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006397	AT	3	6	11445	11450	50 %	50 %	0 %	0 %	55380079
41	NC_006397	GC	3	6	12224	12229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_006397	TC	3	6	12403	12408	0 %	50 %	0 %	50 %	55380080
43	NC_006397	AG	4	8	13639	13646	50 %	0 %	50 %	0 %	55380081
44	NC_006397	TC	3	6	14079	14084	0 %	50 %	0 %	50 %	55380081
45	NC_006397	CT	3	6	14650	14655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006397	TA	3	6	15128	15133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006397	AC	3	6	16190	16195	50 %	0 %	0 %	50 %	55380084
48	NC_006397	CG	3	6	16281	16286	0 %	0 %	50 %	50 %	55380084
49	NC_006397	AG	3	6	16372	16377	50 %	0 %	50 %	0 %	55380084
50	NC_006397	CT	3	6	17616	17621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006397	TG	3	6	17622	17627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006397	TA	3	6	18629	18634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006397	TA	3	6	18655	18660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006397	AG	3	6	19587	19592	50 %	0 %	50 %	0 %	55380090
55	NC_006397	AG	3	6	20088	20093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006397	AT	3	6	20591	20596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006397	CT	3	6	21006	21011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006397	CG	3	6	21069	21074	0 %	0 %	50 %	50 %	55380092
59	NC_006397	AG	3	6	22030	22035	50 %	0 %	50 %	0 %	55380093
60	NC_006397	AC	3	6	22263	22268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_006397	GC	3	6	22368	22373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_006397	AG	3	6	22416	22421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006397	TC	3	6	22491	22496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006397	AG	3	6	22531	22536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006397	GA	3	6	22663	22668	50 %	0 %	50 %	0 %	55380094
66	NC_006397	AC	3	6	23031	23036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_006397	GT	3	6	23283	23288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006397	AC	3	6	23599	23604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006397	CG	3	6	23703	23708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_006397	CT	3	6	23721	23726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_006397	TA	3	6	25565	25570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006397	CT	3	6	25921	25926	0 %	50 %	0 %	50 %	55380098
73	NC_006397	CT	3	6	26263	26268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006397	GA	3	6	27228	27233	50 %	0 %	50 %	0 %	55380099
75	NC_006397	AC	3	6	27541	27546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006397	TG	5	10	28386	28395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006397	TG	3	6	28713	28718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006397	TA	3	6	29272	29277	50 %	50 %	0 %	0 %	55380101
79	NC_006397	CG	3	6	30438	30443	0 %	0 %	50 %	50 %	55380102
80	NC_006397	AC	3	6	30661	30666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006397	CG	3	6	30808	30813	0 %	0 %	50 %	50 %	55380103
82	NC_006397	TG	3	6	31672	31677	0 %	50 %	50 %	0 %	55380105
83	NC_006397	CT	3	6	32099	32104	0 %	50 %	0 %	50 %	55380105
84	NC_006397	CT	4	8	33261	33268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_006397	GC	3	6	33520	33525	0 %	0 %	50 %	50 %	55380106
86	NC_006397	TG	3	6	33792	33797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006397	CT	3	6	34432	34437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006397	GT	3	6	34787	34792	0 %	50 %	50 %	0 %	55380108
89	NC_006397	AC	3	6	37826	37831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006397	CT	3	6	38965	38970	0 %	50 %	0 %	50 %	55380112
91	NC_006397	GT	3	6	40860	40865	0 %	50 %	50 %	0 %	55380114
92	NC_006397	AT	3	6	41950	41955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006397	AT	3	6	42090	42095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006397	CG	3	6	42641	42646	0 %	0 %	50 %	50 %	55380116
95	NC_006397	CG	3	6	42820	42825	0 %	0 %	50 %	50 %	55380116
96	NC_006397	AC	3	6	46839	46844	50 %	0 %	0 %	50 %	55380123
97	NC_006397	TC	3	6	46915	46920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_006397	CA	3	6	47385	47390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006397	TG	3	6	47841	47846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006397	TG	3	6	48048	48053	0 %	50 %	50 %	0 %	55380125
101	NC_006397	CG	3	6	48885	48890	0 %	0 %	50 %	50 %	55380127
102	NC_006397	TG	3	6	49728	49733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006397	CA	3	6	49828	49833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_006397	CG	3	6	50295	50300	0 %	0 %	50 %	50 %	55380128
105	NC_006397	AG	3	6	50522	50527	50 %	0 %	50 %	0 %	55380128
106	NC_006397	CA	3	6	50717	50722	50 %	0 %	0 %	50 %	55380128
107	NC_006397	GA	3	6	51464	51469	50 %	0 %	50 %	0 %	55380128
108	NC_006397	AG	3	6	51653	51658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006397	AG	3	6	51666	51671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006397	GA	3	6	51844	51849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006397	GA	3	6	51971	51976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006397	CA	3	6	52466	52471	50 %	0 %	0 %	50 %	55380129
113	NC_006397	GC	3	6	52611	52616	0 %	0 %	50 %	50 %	55380129
114	NC_006397	GT	3	6	53733	53738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006397	CT	3	6	54923	54928	0 %	50 %	0 %	50 %	55380131
116	NC_006397	CT	3	6	56080	56085	0 %	50 %	0 %	50 %	55380131
117	NC_006397	CG	3	6	56491	56496	0 %	0 %	50 %	50 %	55380132
118	NC_006397	GA	3	6	56768	56773	50 %	0 %	50 %	0 %	55380132
119	NC_006397	AC	3	6	57430	57435	50 %	0 %	0 %	50 %	55380133
120	NC_006397	GT	3	6	57689	57694	0 %	50 %	50 %	0 %	55380133
121	NC_006397	CG	3	6	57852	57857	0 %	0 %	50 %	50 %	55380134
122	NC_006397	CG	3	6	58182	58187	0 %	0 %	50 %	50 %	55380134
123	NC_006397	TG	4	8	58761	58768	0 %	50 %	50 %	0 %	55380134
124	NC_006397	GT	4	8	59656	59663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006397	CT	3	6	60199	60204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_006397	AG	3	6	60219	60224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006397	GA	3	6	60743	60748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006397	TA	3	6	61161	61166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006397	CT	3	6	61419	61424	0 %	50 %	0 %	50 %	55380135
130	NC_006397	CA	3	6	62143	62148	50 %	0 %	0 %	50 %	55380135
131	NC_006397	TA	3	6	62538	62543	50 %	50 %	0 %	0 %	55380137
132	NC_006397	TG	3	6	62705	62710	0 %	50 %	50 %	0 %	55380136
133	NC_006397	GC	3	6	62968	62973	0 %	0 %	50 %	50 %	55380136
134	NC_006397	GT	3	6	63830	63835	0 %	50 %	50 %	0 %	55380136
135	NC_006397	CT	3	6	64131	64136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_006397	GA	4	8	64573	64580	50 %	0 %	50 %	0 %	55380140
137	NC_006397	GA	3	6	65140	65145	50 %	0 %	50 %	0 %	55380141
138	NC_006397	TC	3	6	65282	65287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_006397	TC	3	6	67014	67019	0 %	50 %	0 %	50 %	55380143
140	NC_006397	AG	3	6	67139	67144	50 %	0 %	50 %	0 %	55380144
141	NC_006397	AG	3	6	69522	69527	50 %	0 %	50 %	0 %	55380147
142	NC_006397	CA	3	6	70346	70351	50 %	0 %	0 %	50 %	55380149
143	NC_006397	GT	3	6	70433	70438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006397	AC	3	6	70501	70506	50 %	0 %	0 %	50 %	55380150
145	NC_006397	GA	3	6	70765	70770	50 %	0 %	50 %	0 %	55380150
146	NC_006397	TC	3	6	71550	71555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_006397	CA	3	6	71633	71638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_006397	AT	3	6	71785	71790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006397	AG	3	6	71808	71813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006397	GA	3	6	73401	73406	50 %	0 %	50 %	0 %	55380152
151	NC_006397	AT	3	6	74212	74217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_006397	TC	3	6	74473	74478	0 %	50 %	0 %	50 %	55380153
153	NC_006397	CT	3	6	74576	74581	0 %	50 %	0 %	50 %	55380153
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