MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006396	GGGACC	2	12	25496	25507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006396	AGCCGA	2	12	89715	89726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006396	GCAGTC	2	12	90149	90160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006396	CACACG	3	18	118328	118345	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006396	AACGTC	2	12	132547	132558	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006396	TCCGTC	2	12	166455	166466	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006396	CTCGCC	2	12	166469	166480	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_006396	GCGACG	2	12	193441	193452	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006396	TTGCCG	2	12	243748	243759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006396	CGAACA	2	12	292390	292401	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006396	ACACCA	2	12	310426	310437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_006396	AGTCTG	3	18	330142	330159	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_006396	CAGTGA	2	12	331483	331494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_006396	TACCGA	2	12	417833	417844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006396	CCGGTC	2	12	445120	445131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006396	GACGCG	2	12	445144	445155	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006396	TTTCAC	2	12	457474	457485	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006396	GCCACG	2	12	465303	465314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006396	GGGTGG	2	12	474845	474856	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006396	GTCGGA	2	12	528799	528810	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_006396	CGCCGA	2	12	538148	538159	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006396	CGCGCT	2	12	581445	581456	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006396	CGCTGG	2	12	672979	672990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006396	GCGACC	2	12	727588	727599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006396	ACGGTG	2	12	744466	744477	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_006396	CAGGTA	2	12	770010	770021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_006396	ACGACT	2	12	808321	808332	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006396	CGAAAC	2	12	810130	810141	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006396	CCGATT	2	12	818807	818818	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006396	GCTATG	2	12	899592	899603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006396	AATATC	2	12	901655	901666	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_006396	CACCGA	2	12	948923	948934	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_006396	TGGGGG	3	18	985247	985264	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006396	ACTACG	2	12	1107197	1107208	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006396	CCGGCA	2	12	1150617	1150628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_006396	CTCCCC	2	12	1248776	1248787	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
37	NC_006396	GGCGTG	2	12	1269397	1269408	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_006396	GTCGGC	2	12	1312353	1312364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006396	GACCGC	2	12	1364974	1364985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006396	GCGGTG	2	12	1379060	1379071	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_006396	AAAGCC	2	12	1386699	1386710	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006396	CGTGTC	2	12	1392023	1392034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006396	CGATCA	2	12	1392212	1392223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006396	CGAACC	2	12	1397709	1397720	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006396	TACCGC	2	12	1398681	1398692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006396	ATCCAG	2	12	1414217	1414228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006396	GAGGTC	2	12	1416370	1416381	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_006396	AATTTA	2	12	1419049	1419060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006396	CGATCT	2	12	1420393	1420404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006396	CGAACG	2	12	1437752	1437763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006396	GTTCGG	2	12	1449756	1449767	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_006396	TTTCAC	2	12	1450662	1450673	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006396	CGGATT	2	12	1454051	1454062	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_006396	GAACGA	2	12	1479917	1479928	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_006396	ATTCCG	2	12	1484159	1484170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006396	AAACGA	2	12	1487122	1487133	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_006396	CGGTAT	2	12	1490225	1490236	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_006396	GGTCGG	2	12	1526258	1526269	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_006396	AGTGAA	3	18	1618239	1618256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006396	GTTTTT	2	12	1635675	1635686	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006396	ACTCAT	2	12	1638253	1638264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006396	AGCGGT	2	12	1639628	1639639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_006396	TTTCGG	2	12	1649915	1649926	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_006396	TACTGT	2	12	1716930	1716941	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_006396	GCCTCC	2	12	1727135	1727146	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_006396	GTGATC	2	12	1733331	1733342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_006396	CGCCGT	2	12	1736134	1736145	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_006396	ACGGCG	3	18	1823725	1823742	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006396	CTCCAG	2	12	1857361	1857372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_006396	CTGTCG	2	12	1908728	1908739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006396	CCCCCA	2	12	1929175	1929186	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
72	NC_006396	TTGGTG	2	12	1937927	1937938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006396	TGACAG	2	12	1995092	1995103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_006396	TTCTAT	2	12	2003105	2003116	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_006396	GAGCTA	2	12	2006026	2006037	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_006396	CGTCAG	2	12	2032136	2032147	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006396	GGCAAC	2	12	2052462	2052473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006396	TTTCAC	2	12	2055066	2055077	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006396	AGGCCG	2	12	2063306	2063317	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006396	ATGGGA	2	12	2076004	2076015	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006396	GCCTCG	2	12	2101558	2101569	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006396	CACGCA	2	12	2122337	2122348	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_006396	GGGTGA	2	12	2125390	2125401	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006396	CACGAG	2	12	2145985	2145996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006396	TTTGCG	2	12	2180323	2180334	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_006396	CAGCGC	2	12	2217133	2217144	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_006396	GTGAAA	2	12	2239769	2239780	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006396	CTGTCG	2	12	2306785	2306796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006396	TCGGCC	2	12	2323758	2323769	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006396	AATCTG	2	12	2329087	2329098	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_006396	GCGCTC	2	12	2351767	2351778	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006396	GTGGCC	2	12	2355537	2355548	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006396	ACCTCA	2	12	2377795	2377806	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_006396	TTCACT	2	12	2442349	2442360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006396	TCACAG	2	12	2445293	2445304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006396	CCACTC	2	12	2456464	2456475	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_006396	TGATAC	2	12	2460137	2460148	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_006396	CCCGGA	2	12	2464497	2464508	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006396	GTACCG	2	12	2481772	2481783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006396	CTGCTA	2	12	2485530	2485541	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006396	TGCTCG	2	12	2501043	2501054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006396	GCGAGC	2	12	2510799	2510810	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006396	CGCTCG	2	12	2510943	2510954	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_006396	CCCGGT	2	12	2547301	2547312	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_006396	ACTTTC	2	12	2577858	2577869	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006396	CGTCTC	2	12	2590988	2590999	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_006396	CGTAGT	2	12	2633591	2633602	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_006396	ATGTGT	2	12	2696683	2696694	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006396	ACCCGA	2	12	2702629	2702640	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_006396	GGCGAC	2	12	2713319	2713330	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006396	GTCGGG	2	12	2751076	2751087	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_006396	GGTGAC	2	12	2758616	2758627	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_006396	CTGCGG	2	12	2758633	2758644	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006396	CGAGTA	2	12	2797631	2797642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_006396	GACACC	2	12	2797854	2797865	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_006396	TGGGAG	2	12	2812096	2812107	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006396	GACAGG	2	12	2821492	2821503	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_006396	CACCAG	2	12	2829911	2829922	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_006396	ACTGTG	2	12	2834609	2834620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_006396	CTGTCG	2	12	2834689	2834700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006396	CGACGG	2	12	2888665	2888676	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006396	TGGCCG	2	12	2900760	2900771	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006396	TTCGTC	2	12	2950855	2950866	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006396	GACGCA	2	12	2970064	2970075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006396	CGATGT	2	12	3047363	3047374	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_006396	GATGTG	2	12	3073736	3073747	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006396	TCGCCG	2	12	3124077	3124088	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.