MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 49878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006396	CGT	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
2	NC_006396	CGA	2	6	192	197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376943
3	NC_006396	TTC	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376943
4	NC_006396	TCG	2	6	294	299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
5	NC_006396	CTG	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
6	NC_006396	ACG	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376943
7	NC_006396	CTC	2	6	421	426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376943
8	NC_006396	CGT	2	6	447	452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
9	NC_006396	GCC	2	6	491	496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376943
10	NC_006396	CCG	2	6	584	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376943
11	NC_006396	GCC	2	6	625	630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376943
12	NC_006396	TCG	2	6	638	643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
13	NC_006396	CAC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376943
14	NC_006396	CGT	2	6	804	809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
15	NC_006396	TCG	2	6	884	889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
16	NC_006396	CGT	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
17	NC_006396	GCC	2	6	1091	1096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
18	NC_006396	TCG	2	6	1167	1172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
19	NC_006396	CCT	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376944
20	NC_006396	CGG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376944
21	NC_006396	TGG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376944
22	NC_006396	GCC	2	6	1250	1255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
23	NC_006396	CGA	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376944
24	NC_006396	CTT	2	6	1471	1476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376944
25	NC_006396	TCG	2	6	1500	1505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
26	NC_006396	CTC	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376944
27	NC_006396	CCG	2	6	1647	1652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
28	NC_006396	TGA	2	6	1657	1662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376944
29	NC_006396	ATC	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376944
30	NC_006396	GTC	2	6	1697	1702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
31	NC_006396	CGT	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
32	NC_006396	CGG	2	6	1745	1750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376944
33	NC_006396	GCC	2	6	1769	1774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
34	NC_006396	GTC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
35	NC_006396	GCG	2	6	1797	1802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376944
36	NC_006396	CGT	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
37	NC_006396	CCT	2	6	1987	1992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376944
38	NC_006396	CGA	2	6	2032	2037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376944
39	NC_006396	GTA	2	6	2060	2065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376944
40	NC_006396	CGC	2	6	2080	2085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
41	NC_006396	TCT	2	6	2104	2109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376944
42	NC_006396	CTC	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376944
43	NC_006396	TGG	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376944
44	NC_006396	GTG	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376944
45	NC_006396	TTC	2	6	2330	2335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376944
46	NC_006396	CTT	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376944
47	NC_006396	GCC	2	6	2372	2377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
48	NC_006396	ACC	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376944
49	NC_006396	CGA	2	6	2431	2436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376944
50	NC_006396	TCT	2	6	2518	2523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376944
51	NC_006396	CTC	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376944
52	NC_006396	CGA	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376944
53	NC_006396	CGT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376945
54	NC_006396	GCC	2	6	3148	3153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376945
55	NC_006396	GCC	2	6	3157	3162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376945
56	NC_006396	GCT	2	6	3169	3174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376945
57	NC_006396	AGC	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376945
58	NC_006396	CGT	2	6	3245	3250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376945
59	NC_006396	GCG	2	6	3259	3264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376945
60	NC_006396	GCC	2	6	3307	3312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376945
61	NC_006396	GGA	2	6	3370	3375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376946
62	NC_006396	GTC	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
63	NC_006396	TCG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
64	NC_006396	TCG	2	6	3483	3488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
65	NC_006396	GGC	2	6	3499	3504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376946
66	NC_006396	CGT	2	6	3514	3519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
67	NC_006396	TCC	2	6	3525	3530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376946
68	NC_006396	TCG	3	9	3534	3542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
69	NC_006396	CGG	2	6	3586	3591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376946
70	NC_006396	CGT	2	6	3640	3645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
71	NC_006396	CCG	2	6	3651	3656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376946
72	NC_006396	TGA	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376946
73	NC_006396	TGA	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376946
74	NC_006396	CGA	2	6	3784	3789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376946
75	NC_006396	GAA	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376946
76	NC_006396	TCG	2	6	3984	3989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
77	NC_006396	CGA	2	6	4000	4005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376946
78	NC_006396	GTC	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
79	NC_006396	CGG	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376946
80	NC_006396	GTT	2	6	4115	4120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376946
81	NC_006396	GAG	2	6	4136	4141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376946
82	NC_006396	GTC	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
83	NC_006396	CGG	2	6	4174	4179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376946
84	NC_006396	CGC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376946
85	NC_006396	TCG	2	6	4233	4238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
86	NC_006396	CCT	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376946
87	NC_006396	TGA	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376946
88	NC_006396	CGC	2	6	4351	4356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376946
89	NC_006396	ATG	2	6	4371	4376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376946
90	NC_006396	GAC	2	6	4391	4396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376946
91	NC_006396	CCT	2	6	4456	4461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376946
92	NC_006396	CGG	2	6	4474	4479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376946
93	NC_006396	CCG	2	6	4569	4574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376946
94	NC_006396	CGA	3	9	4633	4641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376946
95	NC_006396	GCG	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376947
96	NC_006396	TCC	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376947
97	NC_006396	GTC	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376947
98	NC_006396	CGA	4	12	5515	5526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376947
99	NC_006396	CGC	2	6	5573	5578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376947
100	NC_006396	ACG	2	6	5607	5612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376947
101	NC_006396	TCG	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376948
102	NC_006396	GTC	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376948
103	NC_006396	CAG	2	6	5811	5816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376948
104	NC_006396	CGT	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376948
105	NC_006396	ATC	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376948
106	NC_006396	CCG	2	6	5930	5935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376948
107	NC_006396	CGG	2	6	5987	5992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376948
108	NC_006396	GCC	2	6	6200	6205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376948
109	NC_006396	GAG	2	6	6225	6230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376948
110	NC_006396	GAT	2	6	6324	6329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376948
111	NC_006396	GCC	2	6	6364	6369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376948
112	NC_006396	CGC	2	6	6721	6726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376949
113	NC_006396	TCG	2	6	6756	6761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376949
114	NC_006396	CGC	2	6	6789	6794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376949
115	NC_006396	TCG	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376949
116	NC_006396	CGC	2	6	6823	6828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376949
117	NC_006396	TGT	2	6	6847	6852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376949
118	NC_006396	TCG	2	6	6957	6962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376949
119	NC_006396	CAG	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376949
120	NC_006396	ATC	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376949
121	NC_006396	CGC	2	6	7033	7038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376949
122	NC_006396	CGA	2	6	7051	7056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376949
123	NC_006396	CGG	2	6	7072	7077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376949
124	NC_006396	TCG	2	6	7113	7118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376949
125	NC_006396	GCG	2	6	7190	7195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376949
126	NC_006396	GGT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376949
127	NC_006396	CGG	2	6	7222	7227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376949
128	NC_006396	CGC	3	9	7270	7278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376949
129	NC_006396	CGG	2	6	7323	7328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376949
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131	NC_006396	CTG	2	6	7355	7360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376949
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