MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG700

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006395	TTAAG	2	10	245	254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006395	TCGAA	2	10	4537	4546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_006395	TGAAA	2	10	7169	7178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006395	TCAAT	2	10	14648	14657	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006395	CGTCG	2	10	17457	17466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_006395	CTGGT	2	10	20628	20637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006395	CTCGT	2	10	27365	27374	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_006395	ACAGA	2	10	29248	29257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_006395	GGGTC	2	10	30625	30634	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006395	CGCGA	2	10	40929	40938	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_006395	CCGGT	2	10	54980	54989	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_006395	TTCGG	2	10	60557	60566	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_006395	GTGCT	2	10	61511	61520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_006395	TGATT	2	10	62005	62014	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006395	CACAG	2	10	66021	66030	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_006395	AACGG	2	10	79143	79152	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_006395	GAGGC	2	10	82656	82665	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006395	GGCAA	2	10	85788	85797	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_006395	TTGAC	2	10	86208	86217	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_006395	GTGGG	2	10	90961	90970	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006395	AATAC	2	10	97247	97256	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_006395	CTTAT	2	10	120573	120582	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_006395	GTATT	2	10	127446	127455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006395	GAGCC	2	10	127664	127673	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_006395	CGAGA	2	10	129986	129995	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_006395	GTCGT	2	10	134718	134727	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_006395	TGTGG	2	10	142931	142940	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006395	TAGGC	2	10	147093	147102	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_006395	TGGGG	2	10	147699	147708	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006395	GGGCA	2	10	147980	147989	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006395	GCACC	2	10	148165	148174	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_006395	GCTCT	2	10	173064	173073	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_006395	ATTTT	2	10	175518	175527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006395	TCTTT	2	10	177891	177900	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_006395	CTGCC	2	10	180908	180917	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_006395	CCCAC	2	10	190592	190601	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_006395	GTAAT	2	10	190693	190702	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006395	TTCAA	2	10	190769	190778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_006395	GTGGG	2	10	190832	190841	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006395	TCTCC	2	10	190943	190952	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_006395	TTGAA	2	10	200073	200082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006395	TCCGG	2	10	220883	220892	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_006395	GGTAA	2	10	227720	227729	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006395	TCCGA	2	10	231091	231100	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_006395	TACTG	2	10	231466	231475	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_006395	CCCGA	2	10	235233	235242	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_006395	TTTAT	2	10	239045	239054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006395	TCTTG	2	10	239226	239235	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006395	AGCGC	2	10	247334	247343	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_006395	GGAAC	2	10	257062	257071	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_006395	GCGCC	2	10	293048	293057	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_006395	TGTCG	2	10	305475	305484	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_006395	GCCAA	2	10	308465	308474	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_006395	CGCGG	2	10	310255	310264	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_006395	GGTTC	2	10	317792	317801	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_006395	GATCA	2	10	321570	321579	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_006395	TCGCT	2	10	346304	346313	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_006395	TGTGT	2	10	355138	355147	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006395	TTCGA	2	10	358502	358511	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_006395	AGAGC	2	10	364025	364034	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_006395	TCTGT	2	10	366956	366965	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_006395	CAGAC	2	10	373880	373889	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_006395	GTGTC	2	10	373929	373938	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_006395	ACCGG	2	10	399082	399091	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.