MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG700

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006395	GACT	2	8	143	150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006395	TAAA	2	8	283	290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006395	ACTT	2	8	300	307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_006395	GTCT	2	8	6824	6831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006395	AATC	2	8	6911	6918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_006395	ACTG	2	8	7129	7136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006395	AGCG	2	8	13377	13384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006395	TGTC	2	8	15950	15957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_006395	GACA	2	8	17421	17428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006395	AACA	2	8	18981	18988	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006395	TTAC	2	8	20161	20168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006395	TATT	2	8	20504	20511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006395	CCTG	2	8	23650	23657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006395	ACTC	2	8	27249	27256	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006395	TTGC	2	8	27428	27435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_006395	CGCA	2	8	27593	27600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006395	CGGT	2	8	27727	27734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006395	CAGT	2	8	28126	28133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006395	AAGG	2	8	29508	29515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006395	TCGC	2	8	34227	34234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006395	ACCC	2	8	39745	39752	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_006395	GGAA	2	8	40892	40899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006395	GTTA	2	8	42387	42394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006395	CCGA	2	8	42546	42553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006395	GCGG	2	8	48961	48968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_006395	CGGC	2	8	52776	52783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006395	GGGT	2	8	54164	54171	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006395	GATA	2	8	59180	59187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006395	AGTG	2	8	61521	61528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006395	ACTT	2	8	61987	61994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_006395	CCAG	2	8	71794	71801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006395	AGCA	2	8	82206	82213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006395	TCAA	2	8	85776	85783	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006395	GAAA	2	8	86626	86633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006395	CAAG	2	8	91100	91107	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_006395	GTTG	2	8	91854	91861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006395	GAAC	2	8	95523	95530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006395	CTAC	2	8	95592	95599	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006395	AGGA	2	8	96132	96139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006395	ACTG	2	8	97340	97347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006395	CGTT	2	8	104276	104283	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006395	GATA	2	8	107183	107190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006395	TATT	2	8	107710	107717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006395	CCAT	2	8	112775	112782	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006395	AGTG	2	8	112885	112892	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006395	TTGC	2	8	115385	115392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006395	AGGA	2	8	115401	115408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006395	TCCG	2	8	115443	115450	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_006395	GGGA	2	8	120546	120553	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006395	GTCA	2	8	120763	120770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_006395	GAGC	2	8	134146	134153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006395	CTGC	2	8	134730	134737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006395	GACA	2	8	134780	134787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_006395	TAAA	2	8	135737	135744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006395	CGAA	2	8	135855	135862	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_006395	GGTG	2	8	138823	138830	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006395	CGAG	2	8	142909	142916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_006395	GCCA	2	8	142973	142980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006395	TAGA	2	8	145373	145380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006395	AGCC	2	8	145382	145389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_006395	TGGC	2	8	147038	147045	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006395	TTTA	2	8	147081	147088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006395	AGGT	2	8	147593	147600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006395	CCAC	2	8	147653	147660	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_006395	GTGA	2	8	147959	147966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006395	GTAA	2	8	148502	148509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006395	GTTG	2	8	156280	156287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006395	GGTG	2	8	160100	160107	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006395	TAAG	2	8	167534	167541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006395	TCAC	2	8	167958	167965	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_006395	GCTT	2	8	170908	170915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006395	GGTC	2	8	172990	172997	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006395	TAGC	2	8	173280	173287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_006395	AGTT	2	8	177017	177024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006395	TGTT	2	8	177953	177960	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006395	TCTG	2	8	178058	178065	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_006395	GGAT	2	8	178473	178480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006395	GCTC	2	8	178758	178765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006395	TTCC	2	8	179909	179916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006395	GCTA	2	8	180167	180174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_006395	ACAG	2	8	181659	181666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_006395	AGCG	2	8	186686	186693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_006395	GTGA	2	8	186706	186713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006395	CATA	2	8	188306	188313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_006395	CAAT	2	8	188772	188779	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_006395	TCGG	2	8	189209	189216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_006395	GGAA	2	8	190507	190514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006395	ACAA	2	8	190758	190765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_006395	CCTG	2	8	190808	190815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006395	TGCT	2	8	191188	191195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_006395	CTAT	2	8	192316	192323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_006395	CTTG	2	8	194551	194558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_006395	TGAC	2	8	194568	194575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_006395	AAGA	2	8	194714	194721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006395	AGTC	2	8	196556	196563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006395	ACAA	2	8	196588	196595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006395	AGCG	2	8	197021	197028	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_006395	CAGC	2	8	199028	199035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006395	AGTA	2	8	199118	199125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006395	GCGT	2	8	199200	199207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_006395	CTGT	2	8	199319	199326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_006395	GACG	2	8	200244	200251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_006395	GATT	2	8	202363	202370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006395	ACTC	2	8	202539	202546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_006395	ACCG	2	8	215875	215882	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_006395	CAGT	2	8	215975	215982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_006395	GGAA	2	8	220723	220730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006395	AGGA	2	8	220797	220804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006395	TGTC	2	8	222539	222546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_006395	GTTC	2	8	224126	224133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_006395	TGTT	2	8	224203	224210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006395	CTGC	2	8	225506	225513	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_006395	AACT	2	8	225675	225682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_006395	ACCC	2	8	227193	227200	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_006395	TCGG	2	8	227232	227239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_006395	AAAG	2	8	227271	227278	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006395	AAGG	2	8	227641	227648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006395	TAGC	2	8	227757	227764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_006395	TGTA	2	8	228919	228926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006395	AATT	2	8	229084	229091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006395	TACT	2	8	229344	229351	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_006395	CGTC	2	8	229462	229469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_006395	TCAG	2	8	230229	230236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_006395	AATA	2	8	231041	231048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006395	GTAG	2	8	235176	235183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006395	CTTG	2	8	238085	238092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_006395	CCCT	2	8	239142	239149	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_006395	ATGC	2	8	239376	239383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_006395	CTGT	3	12	240297	240308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_006395	GGCT	2	8	243412	243419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_006395	CGCT	2	8	246627	246634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_006395	ACCG	2	8	250660	250667	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006395	CGAC	2	8	252863	252870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_006395	TTGC	2	8	253119	253126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_006395	GACA	2	8	257006	257013	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_006395	GACA	2	8	258367	258374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_006395	GACC	2	8	260193	260200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_006395	CGAA	2	8	261462	261469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_006395	TAAC	2	8	262738	262745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_006395	GGCA	2	8	274030	274037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_006395	TAGA	2	8	276124	276131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006395	CAGA	2	8	277104	277111	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_006395	ACGG	2	8	284456	284463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_006395	CATC	2	8	284543	284550	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_006395	ATGA	2	8	289137	289144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006395	CCGA	2	8	289288	289295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_006395	GTCG	2	8	289357	289364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_006395	TGAC	2	8	291320	291327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_006395	TGAT	2	8	293375	293382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006395	ATCA	2	8	301295	301302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_006395	TCCG	2	8	304833	304840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_006395	CGAG	2	8	305132	305139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_006395	TCCG	2	8	305371	305378	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_006395	GGTT	2	8	313034	313041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_006395	TCCA	2	8	317676	317683	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_006395	ACTA	2	8	320055	320062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_006395	CTGA	2	8	320072	320079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_006395	ACGC	2	8	321708	321715	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
159	NC_006395	CGGT	2	8	321755	321762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_006395	TGGC	2	8	323955	323962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_006395	GAGC	2	8	324516	324523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_006395	CTGC	2	8	324641	324648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_006395	CCAG	2	8	324859	324866	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
164	NC_006395	CGGG	2	8	325175	325182	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
165	NC_006395	AGTG	2	8	325223	325230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_006395	ATAA	2	8	330327	330334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_006395	CTCC	2	8	342191	342198	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
168	NC_006395	GACT	2	8	342226	342233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_006395	TCAC	2	8	342290	342297	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_006395	CCTG	2	8	346276	346283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
171	NC_006395	CAGT	2	8	346343	346350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_006395	CAAA	2	8	358401	358408	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_006395	ACGT	2	8	362569	362576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_006395	CAAA	2	8	366839	366846	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_006395	ACTG	2	8	367177	367184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
176	NC_006395	TATT	2	8	369969	369976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_006395	AAAC	2	8	370124	370131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
178	NC_006395	TGTA	2	8	370201	370208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_006395	CATA	2	8	373854	373861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_006395	GCTG	3	12	373939	373950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
181	NC_006395	TGGG	2	8	374922	374929	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
182	NC_006395	AAAT	2	8	386762	386769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_006395	ACCG	2	8	389636	389643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
184	NC_006395	GCCC	2	8	389665	389672	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
185	NC_006395	ATAC	2	8	389692	389699	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
186	NC_006395	TGTC	2	8	395681	395688	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
187	NC_006395	ACAA	2	8	396588	396595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
188	NC_006395	ATAG	2	8	399026	399033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.