MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG600

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006394	TACCAG	2	12	494	505	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376413
2	NC_006394	CGTACT	2	12	2515	2526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55376415
3	NC_006394	TGGGGT	2	12	3301	3312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376415
4	NC_006394	CATTCT	2	12	4219	4230	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	55376416
5	NC_006394	GACTAC	2	12	9148	9159	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376423
6	NC_006394	CTTCGG	2	12	9471	9482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376423
7	NC_006394	ATCGAC	2	12	11280	11291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376425
8	NC_006394	CCGGAA	2	12	11733	11744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376426
9	NC_006394	CAGTCG	2	12	12161	12172	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376426
10	NC_006394	GTTGTG	2	12	12188	12199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006394	ACGGTC	2	12	12326	12337	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376427
12	NC_006394	CGAGGA	2	12	13989	14000	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55376427
13	NC_006394	AGTCGA	2	12	14314	14325	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55376428
14	NC_006394	TCCCGT	2	12	16404	16415	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55376430
15	NC_006394	CACGAT	2	12	18275	18286	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376431
16	NC_006394	GATGGG	2	12	20519	20530	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55376436
17	NC_006394	ACCGTC	2	12	22855	22866	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376439
18	NC_006394	TCGGTT	2	12	27324	27335	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55376446
19	NC_006394	CACCGA	2	12	32145	32156	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	55376452
20	NC_006394	CACCGA	2	12	32936	32947	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	55376454
21	NC_006394	GTCGGC	2	12	33434	33445	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55376454
22	NC_006394	TCGACG	2	12	36596	36607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376457
23	NC_006394	GAAGCG	2	12	37252	37263	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55376457
24	NC_006394	CCCCAG	2	12	39565	39576	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55376458
25	NC_006394	GAGGCC	2	12	40030	40041	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376459
26	NC_006394	TTGCGA	2	12	41302	41313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55376460
27	NC_006394	CTCATC	2	12	45270	45281	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	55376463
28	NC_006394	ACGTCG	2	12	47714	47725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376465
29	NC_006394	GAGAAT	2	12	56758	56769	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	55376476
30	NC_006394	GACTGC	2	12	62704	62715	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376485
31	NC_006394	CCAGTA	2	12	63738	63749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376485
32	NC_006394	CGTCTC	2	12	69032	69043	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55376490
33	NC_006394	TCGAAC	2	12	70102	70113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376491
34	NC_006394	GTCATC	2	12	70933	70944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55376492
35	NC_006394	GATTGA	2	12	71139	71150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376492
36	NC_006394	CACGAA	2	12	75288	75299	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55376498
37	NC_006394	GACGTC	2	12	78417	78428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376504
38	NC_006394	TCGCCG	2	12	81377	81388	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55376507
39	NC_006394	AGGACG	2	12	84914	84925	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55376509
40	NC_006394	CTCATC	2	12	91190	91201	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	55376511
41	NC_006394	TCCATC	2	12	92268	92279	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	55376511
42	NC_006394	CCTCAC	2	12	92293	92304	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55376511
43	NC_006394	CGAGCG	2	12	99336	99347	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376520
44	NC_006394	CTCAAG	2	12	103646	103657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376527
45	NC_006394	GCGACG	2	12	105023	105034	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376529
46	NC_006394	CGGTGG	2	12	106546	106557	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55376530
47	NC_006394	CGCCGT	2	12	106757	106768	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55376530
48	NC_006394	ATCGCC	2	12	107211	107222	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376530
49	NC_006394	GTCGAA	2	12	112593	112604	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55376537
50	NC_006394	CTCGAA	2	12	112800	112811	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376537
51	NC_006394	CCGTCA	2	12	114475	114486	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376540
52	NC_006394	GATCGA	2	12	117542	117553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55376545
53	NC_006394	TCGCCG	2	12	119160	119171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55376548
54	NC_006394	ATCGGC	2	12	121113	121124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376550
55	NC_006394	ATCGGT	2	12	124121	124132	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55376552
56	NC_006394	ATCTGG	2	12	127211	127222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55376556
57	NC_006394	TCGACG	2	12	127641	127652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376556
58	NC_006394	ACGATC	2	12	131566	131577	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376561
59	NC_006394	CTCCGC	2	12	133590	133601	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_006394	GGGGTG	2	12	133855	133866	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006394	ATTCGA	2	12	138217	138228	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55376566
62	NC_006394	TCAGAT	2	12	151142	151153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55376575
63	NC_006394	TCCTCT	2	12	152449	152460	0 %	50 %	0 %	50 %	55376577
64	NC_006394	TCCTCT	2	12	153715	153726	0 %	50 %	0 %	50 %	55376577

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.