MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG600

Total Repeats: 427

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006394	ACAG	2	8	7	14	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006394	TGAT	2	8	525	532	25 %	50 %	25 %	0 %	55376413
3	NC_006394	CTCA	2	8	726	733	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006394	ACCT	2	8	1255	1262	25 %	25 %	0 %	50 %	55376414
5	NC_006394	CCGT	2	8	1351	1358	0 %	25 %	25 %	50 %	55376414
6	NC_006394	TGGA	2	8	1936	1943	25 %	25 %	50 %	0 %	55376414
7	NC_006394	TCCT	2	8	2029	2036	0 %	50 %	0 %	50 %	55376414
8	NC_006394	GGGC	2	8	2229	2236	0 %	0 %	75 %	25 %	55376415
9	NC_006394	TACT	2	8	2371	2378	25 %	50 %	0 %	25 %	55376415
10	NC_006394	TTCG	2	8	2594	2601	0 %	50 %	25 %	25 %	55376415
11	NC_006394	GAGT	2	8	4646	4653	25 %	25 %	50 %	0 %	55376417
12	NC_006394	AAGA	2	8	5211	5218	75 %	0 %	25 %	0 %	55376417
13	NC_006394	CTCC	2	8	5670	5677	0 %	25 %	0 %	75 %	55376418
14	NC_006394	ACAG	2	8	7019	7026	50 %	0 %	25 %	25 %	55376421
15	NC_006394	GTCC	2	8	7892	7899	0 %	25 %	25 %	50 %	55376422
16	NC_006394	CGAC	2	8	8020	8027	25 %	0 %	25 %	50 %	55376422
17	NC_006394	ACGT	2	8	8107	8114	25 %	25 %	25 %	25 %	55376422
18	NC_006394	GAAT	2	8	8524	8531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006394	GAAC	2	8	8547	8554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006394	AACG	2	8	8588	8595	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006394	AACG	2	8	8733	8740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006394	TCAT	2	8	8840	8847	25 %	50 %	0 %	25 %	55376423
23	NC_006394	ACCG	2	8	8953	8960	25 %	0 %	25 %	50 %	55376423
24	NC_006394	CGAG	2	8	9664	9671	25 %	0 %	50 %	25 %	55376424
25	NC_006394	ACGA	2	8	9735	9742	50 %	0 %	25 %	25 %	55376424
26	NC_006394	TACC	2	8	9830	9837	25 %	25 %	0 %	50 %	55376424
27	NC_006394	AGCG	2	8	10627	10634	25 %	0 %	50 %	25 %	55376425
28	NC_006394	GTTC	2	8	10850	10857	0 %	50 %	25 %	25 %	55376425
29	NC_006394	CTCG	2	8	10940	10947	0 %	25 %	25 %	50 %	55376425
30	NC_006394	GCCG	2	8	11904	11911	0 %	0 %	50 %	50 %	55376426
31	NC_006394	GACC	2	8	12961	12968	25 %	0 %	25 %	50 %	55376427
32	NC_006394	CCGT	2	8	13013	13020	0 %	25 %	25 %	50 %	55376427
33	NC_006394	GCGA	2	8	13100	13107	25 %	0 %	50 %	25 %	55376427
34	NC_006394	GATC	2	8	13200	13207	25 %	25 %	25 %	25 %	55376427
35	NC_006394	CGGC	2	8	13395	13402	0 %	0 %	50 %	50 %	55376427
36	NC_006394	CCCG	2	8	13666	13673	0 %	0 %	25 %	75 %	55376427
37	NC_006394	GACG	2	8	13740	13747	25 %	0 %	50 %	25 %	55376427
38	NC_006394	CCAC	2	8	13973	13980	25 %	0 %	0 %	75 %	55376427
39	NC_006394	TTGT	2	8	14122	14129	0 %	75 %	25 %	0 %	55376427
40	NC_006394	GACA	2	8	14492	14499	50 %	0 %	25 %	25 %	55376429
41	NC_006394	CGGA	2	8	14723	14730	25 %	0 %	50 %	25 %	55376429
42	NC_006394	ACGT	2	8	15020	15027	25 %	25 %	25 %	25 %	55376429
43	NC_006394	CGTT	2	8	15051	15058	0 %	50 %	25 %	25 %	55376429
44	NC_006394	GTCG	2	8	15819	15826	0 %	25 %	50 %	25 %	55376430
45	NC_006394	TGGT	2	8	16090	16097	0 %	50 %	50 %	0 %	55376430
46	NC_006394	GCCT	2	8	16243	16250	0 %	25 %	25 %	50 %	55376430
47	NC_006394	GGCG	2	8	17380	17387	0 %	0 %	75 %	25 %	55376431
48	NC_006394	CGAC	2	8	17439	17446	25 %	0 %	25 %	50 %	55376431
49	NC_006394	TTCA	2	8	17675	17682	25 %	50 %	0 %	25 %	55376431
50	NC_006394	GGCG	2	8	17989	17996	0 %	0 %	75 %	25 %	55376431
51	NC_006394	GTTC	2	8	18468	18475	0 %	50 %	25 %	25 %	55376432
52	NC_006394	GATG	2	8	18735	18742	25 %	25 %	50 %	0 %	55376432
53	NC_006394	GATC	2	8	18880	18887	25 %	25 %	25 %	25 %	55376432
54	NC_006394	CTAT	2	8	19027	19034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006394	TGGA	2	8	19342	19349	25 %	25 %	50 %	0 %	55376433
56	NC_006394	TGGA	2	8	19390	19397	25 %	25 %	50 %	0 %	55376433
57	NC_006394	GTGC	2	8	20185	20192	0 %	25 %	50 %	25 %	55376435
58	NC_006394	GGTC	2	8	21579	21586	0 %	25 %	50 %	25 %	55376438
59	NC_006394	AGTA	2	8	22251	22258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006394	ACGG	2	8	22404	22411	25 %	0 %	50 %	25 %	55376439
61	NC_006394	CATC	2	8	23245	23252	25 %	25 %	0 %	50 %	55376440
62	NC_006394	GTCA	2	8	23811	23818	25 %	25 %	25 %	25 %	55376441
63	NC_006394	GATT	2	8	24026	24033	25 %	50 %	25 %	0 %	55376441
64	NC_006394	CCGT	2	8	24233	24240	0 %	25 %	25 %	50 %	55376441
65	NC_006394	GTCA	2	8	24813	24820	25 %	25 %	25 %	25 %	55376442
66	NC_006394	GACG	2	8	25064	25071	25 %	0 %	50 %	25 %	55376442
67	NC_006394	ACGG	2	8	25081	25088	25 %	0 %	50 %	25 %	55376442
68	NC_006394	GGGT	2	8	25212	25219	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006394	TCCA	2	8	25674	25681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_006394	TTCT	2	8	25719	25726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_006394	CGCC	2	8	26550	26557	0 %	0 %	25 %	75 %	55376444
72	NC_006394	GCTC	2	8	26566	26573	0 %	25 %	25 %	50 %	55376444
73	NC_006394	CTCG	2	8	28270	28277	0 %	25 %	25 %	50 %	55376447
74	NC_006394	GGAT	2	8	28534	28541	25 %	25 %	50 %	0 %	55376447
75	NC_006394	TGAC	2	8	28806	28813	25 %	25 %	25 %	25 %	55376447
76	NC_006394	GTTC	2	8	29103	29110	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_006394	GCCC	2	8	29387	29394	0 %	0 %	25 %	75 %	55376448
78	NC_006394	GGAT	2	8	30082	30089	25 %	25 %	50 %	0 %	55376449
79	NC_006394	CAAA	2	8	30497	30504	75 %	0 %	0 %	25 %	55376451
80	NC_006394	GTTG	2	8	31119	31126	0 %	50 %	50 %	0 %	55376451
81	NC_006394	CGTG	2	8	32424	32431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_006394	GCTG	2	8	32708	32715	0 %	25 %	50 %	25 %	55376453
83	NC_006394	AGGA	2	8	33281	33288	50 %	0 %	50 %	0 %	55376454
84	NC_006394	GTCA	2	8	33806	33813	25 %	25 %	25 %	25 %	55376454
85	NC_006394	ACCG	2	8	34082	34089	25 %	0 %	25 %	50 %	55376454
86	NC_006394	AGCC	2	8	35068	35075	25 %	0 %	25 %	50 %	55376454
87	NC_006394	TGGT	2	8	35199	35206	0 %	50 %	50 %	0 %	55376454
88	NC_006394	GGAC	2	8	35616	35623	25 %	0 %	50 %	25 %	55376455
89	NC_006394	ACGG	2	8	35725	35732	25 %	0 %	50 %	25 %	55376455
90	NC_006394	ACGT	2	8	35811	35818	25 %	25 %	25 %	25 %	55376455
91	NC_006394	AATA	2	8	35946	35953	75 %	25 %	0 %	0 %	55376455
92	NC_006394	CGTC	2	8	37311	37318	0 %	25 %	25 %	50 %	55376457
93	NC_006394	ACAT	2	8	38572	38579	50 %	25 %	0 %	25 %	55376457
94	NC_006394	ACGC	2	8	38642	38649	25 %	0 %	25 %	50 %	55376457
95	NC_006394	CGAC	2	8	38678	38685	25 %	0 %	25 %	50 %	55376457
96	NC_006394	CGAC	2	8	38888	38895	25 %	0 %	25 %	50 %	55376457
97	NC_006394	TGGC	2	8	38960	38967	0 %	25 %	50 %	25 %	55376457
98	NC_006394	GCCG	2	8	39270	39277	0 %	0 %	50 %	50 %	55376457
99	NC_006394	GGCG	2	8	39380	39387	0 %	0 %	75 %	25 %	55376458
100	NC_006394	CCGT	2	8	39472	39479	0 %	25 %	25 %	50 %	55376458
101	NC_006394	GACC	2	8	40536	40543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006394	GACT	2	8	40801	40808	25 %	25 %	25 %	25 %	55376460
103	NC_006394	GGCT	2	8	40929	40936	0 %	25 %	50 %	25 %	55376460
104	NC_006394	GGGT	2	8	41337	41344	0 %	25 %	75 %	0 %	55376460
105	NC_006394	GTCG	2	8	41513	41520	0 %	25 %	50 %	25 %	55376460
106	NC_006394	GGAA	2	8	41784	41791	50 %	0 %	50 %	0 %	55376461
107	NC_006394	TGAC	2	8	41849	41856	25 %	25 %	25 %	25 %	55376461
108	NC_006394	CGGT	2	8	42732	42739	0 %	25 %	50 %	25 %	55376462
109	NC_006394	GTGA	2	8	42834	42841	25 %	25 %	50 %	0 %	55376462
110	NC_006394	CCGG	2	8	42869	42876	0 %	0 %	50 %	50 %	55376462
111	NC_006394	GGCT	2	8	43134	43141	0 %	25 %	50 %	25 %	55376462
112	NC_006394	CGCA	2	8	43255	43262	25 %	0 %	25 %	50 %	55376462
113	NC_006394	CGAC	2	8	43561	43568	25 %	0 %	25 %	50 %	55376462
114	NC_006394	CGGC	2	8	44167	44174	0 %	0 %	50 %	50 %	55376462
115	NC_006394	GTCG	2	8	44672	44679	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_006394	CTGC	2	8	44813	44820	0 %	25 %	25 %	50 %	55376463
117	NC_006394	GGGA	2	8	45142	45149	25 %	0 %	75 %	0 %	55376463
118	NC_006394	TGAG	2	8	45533	45540	25 %	25 %	50 %	0 %	55376463
119	NC_006394	TGAT	2	8	45831	45838	25 %	50 %	25 %	0 %	55376464
120	NC_006394	GATG	2	8	46258	46265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006394	GGGC	2	8	46352	46359	0 %	0 %	75 %	25 %	55376465
122	NC_006394	CTTT	2	8	46403	46410	0 %	75 %	0 %	25 %	55376465
123	NC_006394	GGAG	2	8	46606	46613	25 %	0 %	75 %	0 %	55376465
124	NC_006394	AGCA	2	8	47092	47099	50 %	0 %	25 %	25 %	55376465
125	NC_006394	GCGA	2	8	47100	47107	25 %	0 %	50 %	25 %	55376465
126	NC_006394	GAGT	2	8	47265	47272	25 %	25 %	50 %	0 %	55376465
127	NC_006394	ATCG	2	8	47407	47414	25 %	25 %	25 %	25 %	55376465
128	NC_006394	GTCA	2	8	47484	47491	25 %	25 %	25 %	25 %	55376465
129	NC_006394	GATG	2	8	47763	47770	25 %	25 %	50 %	0 %	55376465
130	NC_006394	CCCA	2	8	47834	47841	25 %	0 %	0 %	75 %	55376465
131	NC_006394	GAGC	2	8	48054	48061	25 %	0 %	50 %	25 %	55376465
132	NC_006394	GGCA	2	8	48306	48313	25 %	0 %	50 %	25 %	55376465
133	NC_006394	TGGT	2	8	48359	48366	0 %	50 %	50 %	0 %	55376465
134	NC_006394	GAAC	2	8	48371	48378	50 %	0 %	25 %	25 %	55376465
135	NC_006394	TGAG	2	8	50084	50091	25 %	25 %	50 %	0 %	55376467
136	NC_006394	GGGA	2	8	50157	50164	25 %	0 %	75 %	0 %	55376467
137	NC_006394	CTGA	2	8	50228	50235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_006394	CCGG	2	8	50553	50560	0 %	0 %	50 %	50 %	55376468
139	NC_006394	GGTC	2	8	51392	51399	0 %	25 %	50 %	25 %	55376469
140	NC_006394	TTCG	2	8	51900	51907	0 %	50 %	25 %	25 %	55376470
141	NC_006394	ACCG	2	8	52162	52169	25 %	0 %	25 %	50 %	55376470
142	NC_006394	TCGG	2	8	52254	52261	0 %	25 %	50 %	25 %	55376470
143	NC_006394	GTTG	2	8	53080	53087	0 %	50 %	50 %	0 %	55376472
144	NC_006394	CCCA	2	8	53924	53931	25 %	0 %	0 %	75 %	55376472
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264	NC_006394	CGGG	2	8	95539	95546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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422	NC_006394	CGAC	2	8	153788	153795	25 %	0 %	25 %	50 %	55376577
423	NC_006394	CGAA	2	8	153816	153823	50 %	0 %	25 %	25 %	55376577
424	NC_006394	ACGA	2	8	153855	153862	50 %	0 %	25 %	25 %	55376577
425	NC_006394	CCCG	2	8	154538	154545	0 %	0 %	25 %	75 %	55376577
426	NC_006394	CGAG	2	8	154611	154618	25 %	0 %	50 %	25 %	55376577
427	NC_006394	CAGA	2	8	154727	154734	50 %	0 %	25 %	25 %	55376577

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.