MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG600

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006394	CT	3	6	579	584	0 %	50 %	0 %	50 %	55376413
2	NC_006394	CT	3	6	1408	1413	0 %	50 %	0 %	50 %	55376414
3	NC_006394	TG	3	6	1574	1579	0 %	50 %	50 %	0 %	55376414
4	NC_006394	AG	3	6	1867	1872	50 %	0 %	50 %	0 %	55376414
5	NC_006394	TG	3	6	2473	2478	0 %	50 %	50 %	0 %	55376415
6	NC_006394	AT	3	6	3319	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	55376415
7	NC_006394	TA	3	6	3557	3562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006394	TA	3	6	3676	3681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006394	TC	3	6	3863	3868	0 %	50 %	0 %	50 %	55376416
10	NC_006394	CT	4	8	3950	3957	0 %	50 %	0 %	50 %	55376416
11	NC_006394	AC	3	6	4633	4638	50 %	0 %	0 %	50 %	55376417
12	NC_006394	GT	3	6	4973	4978	0 %	50 %	50 %	0 %	55376417
13	NC_006394	GC	3	6	5078	5083	0 %	0 %	50 %	50 %	55376417
14	NC_006394	AG	3	6	6793	6798	50 %	0 %	50 %	0 %	55376420
15	NC_006394	CT	3	6	7109	7114	0 %	50 %	0 %	50 %	55376421
16	NC_006394	TC	3	6	7709	7714	0 %	50 %	0 %	50 %	55376422
17	NC_006394	CG	3	6	7863	7868	0 %	0 %	50 %	50 %	55376422
18	NC_006394	TC	3	6	8173	8178	0 %	50 %	0 %	50 %	55376422
19	NC_006394	TC	3	6	8427	8432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006394	GA	3	6	8754	8759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006394	CT	3	6	8860	8865	0 %	50 %	0 %	50 %	55376423
22	NC_006394	CT	3	6	9933	9938	0 %	50 %	0 %	50 %	55376424
23	NC_006394	CG	3	6	12874	12879	0 %	0 %	50 %	50 %	55376427
24	NC_006394	GC	3	6	13308	13313	0 %	0 %	50 %	50 %	55376427
25	NC_006394	GC	3	6	13530	13535	0 %	0 %	50 %	50 %	55376427
26	NC_006394	GC	3	6	13590	13595	0 %	0 %	50 %	50 %	55376427
27	NC_006394	CG	3	6	15128	15133	0 %	0 %	50 %	50 %	55376430
28	NC_006394	CG	3	6	15454	15459	0 %	0 %	50 %	50 %	55376430
29	NC_006394	GC	3	6	15501	15506	0 %	0 %	50 %	50 %	55376430
30	NC_006394	GT	3	6	18977	18982	0 %	50 %	50 %	0 %	55376432
31	NC_006394	AG	3	6	19183	19188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006394	CA	3	6	20936	20941	50 %	0 %	0 %	50 %	55376437
33	NC_006394	GA	3	6	20971	20976	50 %	0 %	50 %	0 %	55376437
34	NC_006394	AG	3	6	21867	21872	50 %	0 %	50 %	0 %	55376438
35	NC_006394	GA	3	6	22357	22362	50 %	0 %	50 %	0 %	55376439
36	NC_006394	TC	3	6	24173	24178	0 %	50 %	0 %	50 %	55376441
37	NC_006394	AC	3	6	24494	24499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006394	TG	3	6	25009	25014	0 %	50 %	50 %	0 %	55376442
39	NC_006394	TA	3	6	25587	25592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006394	GT	3	6	27262	27267	0 %	50 %	50 %	0 %	55376446
41	NC_006394	TA	3	6	28164	28169	50 %	50 %	0 %	0 %	55376447
42	NC_006394	GA	3	6	28408	28413	50 %	0 %	50 %	0 %	55376447
43	NC_006394	TC	3	6	28440	28445	0 %	50 %	0 %	50 %	55376447
44	NC_006394	GC	3	6	29122	29127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006394	TG	3	6	30258	30263	0 %	50 %	50 %	0 %	55376450
46	NC_006394	AT	3	6	31102	31107	50 %	50 %	0 %	0 %	55376451
47	NC_006394	AG	3	6	31143	31148	50 %	0 %	50 %	0 %	55376451
48	NC_006394	TA	3	6	31299	31304	50 %	50 %	0 %	0 %	55376451
49	NC_006394	GT	3	6	31933	31938	0 %	50 %	50 %	0 %	55376452
50	NC_006394	GC	3	6	32249	32254	0 %	0 %	50 %	50 %	55376452
51	NC_006394	TC	3	6	35639	35644	0 %	50 %	0 %	50 %	55376455
52	NC_006394	AC	3	6	36197	36202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006394	TC	3	6	36800	36805	0 %	50 %	0 %	50 %	55376457
54	NC_006394	CG	3	6	37030	37035	0 %	0 %	50 %	50 %	55376457
55	NC_006394	TC	3	6	38244	38249	0 %	50 %	0 %	50 %	55376457
56	NC_006394	CG	3	6	38290	38295	0 %	0 %	50 %	50 %	55376457
57	NC_006394	TC	3	6	38462	38467	0 %	50 %	0 %	50 %	55376457
58	NC_006394	TC	3	6	39130	39135	0 %	50 %	0 %	50 %	55376457
59	NC_006394	GC	3	6	39987	39992	0 %	0 %	50 %	50 %	55376459
60	NC_006394	AC	3	6	40815	40820	50 %	0 %	0 %	50 %	55376460
61	NC_006394	CT	3	6	41254	41259	0 %	50 %	0 %	50 %	55376460
62	NC_006394	GT	3	6	41434	41439	0 %	50 %	50 %	0 %	55376460
63	NC_006394	AG	3	6	41738	41743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006394	CG	3	6	41966	41971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006394	CG	3	6	43508	43513	0 %	0 %	50 %	50 %	55376462
66	NC_006394	TC	3	6	44872	44877	0 %	50 %	0 %	50 %	55376463
67	NC_006394	TG	3	6	45735	45740	0 %	50 %	50 %	0 %	55376464
68	NC_006394	TC	3	6	45985	45990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006394	GC	3	6	46190	46195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_006394	CT	3	6	46556	46561	0 %	50 %	0 %	50 %	55376465
71	NC_006394	AC	3	6	46619	46624	50 %	0 %	0 %	50 %	55376465
72	NC_006394	CG	3	6	48002	48007	0 %	0 %	50 %	50 %	55376465
73	NC_006394	AC	3	6	48182	48187	50 %	0 %	0 %	50 %	55376465
74	NC_006394	AT	3	6	48929	48934	50 %	50 %	0 %	0 %	55376466
75	NC_006394	AG	3	6	49128	49133	50 %	0 %	50 %	0 %	55376467
76	NC_006394	GT	3	6	49660	49665	0 %	50 %	50 %	0 %	55376467
77	NC_006394	AG	3	6	50116	50121	50 %	0 %	50 %	0 %	55376467
78	NC_006394	AG	3	6	50212	50217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006394	AC	3	6	51755	51760	50 %	0 %	0 %	50 %	55376470
80	NC_006394	CT	3	6	52380	52385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006394	GT	3	6	53229	53234	0 %	50 %	50 %	0 %	55376472
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83	NC_006394	TC	3	6	55847	55852	0 %	50 %	0 %	50 %	55376475
84	NC_006394	AT	3	6	56001	56006	50 %	50 %	0 %	0 %	55376475
85	NC_006394	AG	4	8	56264	56271	50 %	0 %	50 %	0 %	55376475
86	NC_006394	TG	3	6	56540	56545	0 %	50 %	50 %	0 %	55376475
87	NC_006394	GT	3	6	56902	56907	0 %	50 %	50 %	0 %	55376476
88	NC_006394	AC	3	6	57362	57367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006394	AT	3	6	58099	58104	50 %	50 %	0 %	0 %	55376477
90	NC_006394	CA	3	6	58267	58272	50 %	0 %	0 %	50 %	55376477
91	NC_006394	CA	3	6	59710	59715	50 %	0 %	0 %	50 %	55376481
92	NC_006394	TC	3	6	60628	60633	0 %	50 %	0 %	50 %	55376481
93	NC_006394	GT	3	6	60967	60972	0 %	50 %	50 %	0 %	55376482
94	NC_006394	TG	3	6	61156	61161	0 %	50 %	50 %	0 %	55376482
95	NC_006394	AG	3	6	62403	62408	50 %	0 %	50 %	0 %	55376484
96	NC_006394	GA	3	6	62613	62618	50 %	0 %	50 %	0 %	55376485
97	NC_006394	CG	3	6	63037	63042	0 %	0 %	50 %	50 %	55376485
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100	NC_006394	GA	3	6	65908	65913	50 %	0 %	50 %	0 %	55376487
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104	NC_006394	CT	3	6	67826	67831	0 %	50 %	0 %	50 %	55376489
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106	NC_006394	TC	3	6	68194	68199	0 %	50 %	0 %	50 %	55376489
107	NC_006394	GA	3	6	68247	68252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006394	GC	3	6	68354	68359	0 %	0 %	50 %	50 %	55376490
109	NC_006394	TG	3	6	68475	68480	0 %	50 %	50 %	0 %	55376490
110	NC_006394	GA	3	6	69324	69329	50 %	0 %	50 %	0 %	55376490
111	NC_006394	TC	3	6	70826	70831	0 %	50 %	0 %	50 %	55376492
112	NC_006394	CT	3	6	71934	71939	0 %	50 %	0 %	50 %	55376492
113	NC_006394	GC	3	6	72424	72429	0 %	0 %	50 %	50 %	55376493
114	NC_006394	CT	3	6	72711	72716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_006394	AC	3	6	73122	73127	50 %	0 %	0 %	50 %	55376494
116	NC_006394	AG	4	8	73250	73257	50 %	0 %	50 %	0 %	55376495
117	NC_006394	CT	3	6	73270	73275	0 %	50 %	0 %	50 %	55376495
118	NC_006394	AC	3	6	73294	73299	50 %	0 %	0 %	50 %	55376495
119	NC_006394	TC	3	6	74037	74042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_006394	TA	3	6	74105	74110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006394	TC	3	6	75640	75645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_006394	TC	3	6	76016	76021	0 %	50 %	0 %	50 %	55376500
123	NC_006394	AT	3	6	76798	76803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006394	TG	3	6	76912	76917	0 %	50 %	50 %	0 %	55376503
125	NC_006394	GC	3	6	77719	77724	0 %	0 %	50 %	50 %	55376504
126	NC_006394	CT	4	8	78619	78626	0 %	50 %	0 %	50 %	55376504
127	NC_006394	GT	3	6	78803	78808	0 %	50 %	50 %	0 %	55376504
128	NC_006394	CT	3	6	80486	80491	0 %	50 %	0 %	50 %	55376506
129	NC_006394	GA	3	6	82654	82659	50 %	0 %	50 %	0 %	55376508
130	NC_006394	CT	3	6	84842	84847	0 %	50 %	0 %	50 %	55376509
131	NC_006394	CT	3	6	90863	90868	0 %	50 %	0 %	50 %	55376511
132	NC_006394	GT	3	6	91082	91087	0 %	50 %	50 %	0 %	55376511
133	NC_006394	AG	3	6	91957	91962	50 %	0 %	50 %	0 %	55376511
134	NC_006394	TA	3	6	92834	92839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006394	CA	3	6	93593	93598	50 %	0 %	0 %	50 %	55376512
136	NC_006394	CA	3	6	93947	93952	50 %	0 %	0 %	50 %	55376513
137	NC_006394	TG	3	6	94381	94386	0 %	50 %	50 %	0 %	55376514
138	NC_006394	GA	3	6	94911	94916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006394	GT	3	6	95340	95345	0 %	50 %	50 %	0 %	55376516
140	NC_006394	GC	3	6	95550	95555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_006394	GC	3	6	95583	95588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_006394	GC	3	6	95633	95638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_006394	TC	3	6	96116	96121	0 %	50 %	0 %	50 %	55376517
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145	NC_006394	AG	3	6	96793	96798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006394	TC	4	8	97572	97579	0 %	50 %	0 %	50 %	55376518
147	NC_006394	AT	3	6	98573	98578	50 %	50 %	0 %	0 %	55376519
148	NC_006394	CT	3	6	99565	99570	0 %	50 %	0 %	50 %	55376520
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.