MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG600

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006394	CT	3	6	579	584	0 %	50 %	0 %	50 %	55376413
2	NC_006394	CT	3	6	1408	1413	0 %	50 %	0 %	50 %	55376414
3	NC_006394	TG	3	6	1574	1579	0 %	50 %	50 %	0 %	55376414
4	NC_006394	AG	3	6	1867	1872	50 %	0 %	50 %	0 %	55376414
5	NC_006394	TG	3	6	2473	2478	0 %	50 %	50 %	0 %	55376415
6	NC_006394	AT	3	6	3319	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	55376415
7	NC_006394	TC	3	6	3863	3868	0 %	50 %	0 %	50 %	55376416
8	NC_006394	CT	4	8	3950	3957	0 %	50 %	0 %	50 %	55376416
9	NC_006394	AC	3	6	4633	4638	50 %	0 %	0 %	50 %	55376417
10	NC_006394	GT	3	6	4973	4978	0 %	50 %	50 %	0 %	55376417
11	NC_006394	GC	3	6	5078	5083	0 %	0 %	50 %	50 %	55376417
12	NC_006394	AG	3	6	6793	6798	50 %	0 %	50 %	0 %	55376420
13	NC_006394	CT	3	6	7109	7114	0 %	50 %	0 %	50 %	55376421
14	NC_006394	TC	3	6	7709	7714	0 %	50 %	0 %	50 %	55376422
15	NC_006394	CG	3	6	7863	7868	0 %	0 %	50 %	50 %	55376422
16	NC_006394	TC	3	6	8173	8178	0 %	50 %	0 %	50 %	55376422
17	NC_006394	CT	3	6	8860	8865	0 %	50 %	0 %	50 %	55376423
18	NC_006394	CT	3	6	9933	9938	0 %	50 %	0 %	50 %	55376424
19	NC_006394	CG	3	6	12874	12879	0 %	0 %	50 %	50 %	55376427
20	NC_006394	GC	3	6	13308	13313	0 %	0 %	50 %	50 %	55376427
21	NC_006394	GC	3	6	13530	13535	0 %	0 %	50 %	50 %	55376427
22	NC_006394	GC	3	6	13590	13595	0 %	0 %	50 %	50 %	55376427
23	NC_006394	CG	3	6	15128	15133	0 %	0 %	50 %	50 %	55376430
24	NC_006394	CG	3	6	15454	15459	0 %	0 %	50 %	50 %	55376430
25	NC_006394	GC	3	6	15501	15506	0 %	0 %	50 %	50 %	55376430
26	NC_006394	GT	3	6	18977	18982	0 %	50 %	50 %	0 %	55376432
27	NC_006394	CA	3	6	20936	20941	50 %	0 %	0 %	50 %	55376437
28	NC_006394	GA	3	6	20971	20976	50 %	0 %	50 %	0 %	55376437
29	NC_006394	AG	3	6	21867	21872	50 %	0 %	50 %	0 %	55376438
30	NC_006394	GA	3	6	22357	22362	50 %	0 %	50 %	0 %	55376439
31	NC_006394	TC	3	6	24173	24178	0 %	50 %	0 %	50 %	55376441
32	NC_006394	TG	3	6	25009	25014	0 %	50 %	50 %	0 %	55376442
33	NC_006394	GT	3	6	27262	27267	0 %	50 %	50 %	0 %	55376446
34	NC_006394	TA	3	6	28164	28169	50 %	50 %	0 %	0 %	55376447
35	NC_006394	GA	3	6	28408	28413	50 %	0 %	50 %	0 %	55376447
36	NC_006394	TC	3	6	28440	28445	0 %	50 %	0 %	50 %	55376447
37	NC_006394	TG	3	6	30258	30263	0 %	50 %	50 %	0 %	55376450
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39	NC_006394	AG	3	6	31143	31148	50 %	0 %	50 %	0 %	55376451
40	NC_006394	TA	3	6	31299	31304	50 %	50 %	0 %	0 %	55376451
41	NC_006394	GT	3	6	31933	31938	0 %	50 %	50 %	0 %	55376452
42	NC_006394	GC	3	6	32249	32254	0 %	0 %	50 %	50 %	55376452
43	NC_006394	TC	3	6	35639	35644	0 %	50 %	0 %	50 %	55376455
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45	NC_006394	CG	3	6	37030	37035	0 %	0 %	50 %	50 %	55376457
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47	NC_006394	CG	3	6	38290	38295	0 %	0 %	50 %	50 %	55376457
48	NC_006394	TC	3	6	38462	38467	0 %	50 %	0 %	50 %	55376457
49	NC_006394	TC	3	6	39130	39135	0 %	50 %	0 %	50 %	55376457
50	NC_006394	GC	3	6	39987	39992	0 %	0 %	50 %	50 %	55376459
51	NC_006394	AC	3	6	40815	40820	50 %	0 %	0 %	50 %	55376460
52	NC_006394	CT	3	6	41254	41259	0 %	50 %	0 %	50 %	55376460
53	NC_006394	GT	3	6	41434	41439	0 %	50 %	50 %	0 %	55376460
54	NC_006394	CG	3	6	43508	43513	0 %	0 %	50 %	50 %	55376462
55	NC_006394	TC	3	6	44872	44877	0 %	50 %	0 %	50 %	55376463
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60	NC_006394	AC	3	6	48182	48187	50 %	0 %	0 %	50 %	55376465
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63	NC_006394	GT	3	6	49660	49665	0 %	50 %	50 %	0 %	55376467
64	NC_006394	AG	3	6	50116	50121	50 %	0 %	50 %	0 %	55376467
65	NC_006394	AC	3	6	51755	51760	50 %	0 %	0 %	50 %	55376470
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68	NC_006394	TC	3	6	55847	55852	0 %	50 %	0 %	50 %	55376475
69	NC_006394	AT	3	6	56001	56006	50 %	50 %	0 %	0 %	55376475
70	NC_006394	AG	4	8	56264	56271	50 %	0 %	50 %	0 %	55376475
71	NC_006394	TG	3	6	56540	56545	0 %	50 %	50 %	0 %	55376475
72	NC_006394	GT	3	6	56902	56907	0 %	50 %	50 %	0 %	55376476
73	NC_006394	AT	3	6	58099	58104	50 %	50 %	0 %	0 %	55376477
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76	NC_006394	TC	3	6	60628	60633	0 %	50 %	0 %	50 %	55376481
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92	NC_006394	TG	3	6	68475	68480	0 %	50 %	50 %	0 %	55376490
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108	NC_006394	CT	3	6	84842	84847	0 %	50 %	0 %	50 %	55376509
109	NC_006394	CT	3	6	90863	90868	0 %	50 %	0 %	50 %	55376511
110	NC_006394	GT	3	6	91082	91087	0 %	50 %	50 %	0 %	55376511
111	NC_006394	AG	3	6	91957	91962	50 %	0 %	50 %	0 %	55376511
112	NC_006394	CA	3	6	93593	93598	50 %	0 %	0 %	50 %	55376512
113	NC_006394	CA	3	6	93947	93952	50 %	0 %	0 %	50 %	55376513
114	NC_006394	TG	3	6	94381	94386	0 %	50 %	50 %	0 %	55376514
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126	NC_006394	GA	3	6	108967	108972	50 %	0 %	50 %	0 %	55376533
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128	NC_006394	AT	3	6	111401	111406	50 %	50 %	0 %	0 %	55376536
129	NC_006394	GA	3	6	111931	111936	50 %	0 %	50 %	0 %	55376537
130	NC_006394	TG	3	6	112201	112206	0 %	50 %	50 %	0 %	55376537
131	NC_006394	TC	3	6	114174	114179	0 %	50 %	0 %	50 %	55376540
132	NC_006394	AT	3	6	116317	116322	50 %	50 %	0 %	0 %	55376544
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134	NC_006394	CA	3	6	118304	118309	50 %	0 %	0 %	50 %	55376546
135	NC_006394	CA	3	6	118997	119002	50 %	0 %	0 %	50 %	55376548
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141	NC_006394	TC	3	6	122822	122827	0 %	50 %	0 %	50 %	55376552
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143	NC_006394	GT	3	6	125198	125203	0 %	50 %	50 %	0 %	55376554
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.