MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	CCGGAA	2	12	2853	2864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
2	NC_006393	CTGGTG	2	12	3338	3349	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_006393	AAACCG	2	12	8607	8618	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55376288
4	NC_006393	GGGCTT	2	12	10202	10213	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55376288
5	NC_006393	AGCCGT	2	12	11135	11146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376289
6	NC_006393	TCTCTT	2	12	12686	12697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006393	TCTGAA	2	12	17538	17549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55376294
8	NC_006393	TCGGGA	2	12	18919	18930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376295
9	NC_006393	GCCGAG	2	12	20359	20370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376296
10	NC_006393	CGTCGC	2	12	21937	21948	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55376299
11	NC_006393	TCCCGA	2	12	25696	25707	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376302
12	NC_006393	TGGCTC	2	12	26830	26841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376304
13	NC_006393	TCGGCG	2	12	29524	29535	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006393	GTAGCG	2	12	35729	35740	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376317
15	NC_006393	AGCGCT	2	12	41744	41755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006393	GTGCTG	2	12	42544	42555	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55376325
17	NC_006393	CCAGAT	2	12	43637	43648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376326
18	NC_006393	AACCAA	2	12	43871	43882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376326
19	NC_006393	GTAAAT	2	12	44220	44231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	55376326
20	NC_006393	CAACCC	2	12	48349	48360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376333
21	NC_006393	CAACCC	2	12	48379	48390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376333
22	NC_006393	CAACCC	2	12	48409	48420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376333
23	NC_006393	CAACCC	2	12	48439	48450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376333
24	NC_006393	CAACCC	2	12	48469	48480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376333
25	NC_006393	CAACGG	2	12	50168	50179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376335
26	NC_006393	AATCCC	2	12	54649	54660	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	55376337
27	NC_006393	CCGTTT	2	12	62735	62746	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	55376342
28	NC_006393	CACTAA	2	12	67896	67907	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	55376350
29	NC_006393	ACCGTC	2	12	68861	68872	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376350
30	NC_006393	CAGAGA	2	12	68970	68981	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	55376350
31	NC_006393	ACAACC	2	12	73352	73363	50 %	0 %	0 %	50 %	55376354
32	NC_006393	ACGGAG	2	12	75768	75779	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55376355
33	NC_006393	TTCATC	2	12	76385	76396	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	55376356
34	NC_006393	GGTCGA	2	12	77847	77858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376357
35	NC_006393	AGTCGT	2	12	87974	87985	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55376365
36	NC_006393	TGCGGT	2	12	88459	88470	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_006393	GCCGAC	2	12	90591	90602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55376368
38	NC_006393	TGAGGA	2	12	95907	95918	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	55376376
39	NC_006393	TAACGC	2	12	96929	96940	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006393	CATAGT	2	12	105035	105046	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55376387
41	NC_006393	TCGTTG	2	12	105374	105385	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55376387
42	NC_006393	AGCCGT	2	12	109172	109183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376391
43	NC_006393	GACGAG	2	12	116926	116937	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_006393	AGGTGA	2	12	118762	118773	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	55376400
45	NC_006393	CGATGG	2	12	122335	122346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376403
46	NC_006393	TGACGA	2	12	122950	122961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55376403
47	NC_006393	GCCGGA	2	12	123541	123552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
48	NC_006393	GCCGGA	2	12	123562	123573	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
49	NC_006393	GCCGGA	2	12	123583	123594	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
50	NC_006393	GCCGGA	2	12	123604	123615	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
51	NC_006393	GCCGGA	2	12	123625	123636	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
52	NC_006393	GCCGAC	2	12	125890	125901	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006393	GACCGT	2	12	126981	126992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376406

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.