MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	CCGGAA	2	12	2853	2864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
2	NC_006393	AAACCG	2	12	8607	8618	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55376288
3	NC_006393	GGGCTT	2	12	10202	10213	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55376288
4	NC_006393	AGCCGT	2	12	11135	11146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376289
5	NC_006393	TCTGAA	2	12	17538	17549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55376294
6	NC_006393	TCGGGA	2	12	18919	18930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376295
7	NC_006393	GCCGAG	2	12	20359	20370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376296
8	NC_006393	CGTCGC	2	12	21937	21948	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55376299
9	NC_006393	TCCCGA	2	12	25696	25707	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376302
10	NC_006393	TGGCTC	2	12	26830	26841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376304
11	NC_006393	GTAGCG	2	12	35729	35740	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376317
12	NC_006393	GTGCTG	2	12	42544	42555	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55376325
13	NC_006393	CCAGAT	2	12	43637	43648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55376326
14	NC_006393	AACCAA	2	12	43871	43882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376326
15	NC_006393	GTAAAT	2	12	44220	44231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	55376326
16	NC_006393	CAACCC	2	12	48349	48360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376333
17	NC_006393	CAACCC	2	12	48379	48390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376333
18	NC_006393	CAACCC	2	12	48409	48420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376333
19	NC_006393	CAACCC	2	12	48439	48450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376333
20	NC_006393	CAACCC	2	12	48469	48480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376333
21	NC_006393	CAACGG	2	12	50168	50179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376335
22	NC_006393	AATCCC	2	12	54649	54660	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	55376337
23	NC_006393	CCGTTT	2	12	62735	62746	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	55376342
24	NC_006393	CACTAA	2	12	67896	67907	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	55376350
25	NC_006393	ACCGTC	2	12	68861	68872	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376350
26	NC_006393	CAGAGA	2	12	68970	68981	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	55376350
27	NC_006393	ACAACC	2	12	73352	73363	50 %	0 %	0 %	50 %	55376354
28	NC_006393	ACGGAG	2	12	75768	75779	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55376355
29	NC_006393	TTCATC	2	12	76385	76396	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	55376356
30	NC_006393	GGTCGA	2	12	77847	77858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376357
31	NC_006393	AGTCGT	2	12	87974	87985	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55376365
32	NC_006393	GCCGAC	2	12	90591	90602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55376368
33	NC_006393	TGAGGA	2	12	95907	95918	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	55376376
34	NC_006393	CATAGT	2	12	105035	105046	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55376387
35	NC_006393	TCGTTG	2	12	105374	105385	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55376387
36	NC_006393	AGCCGT	2	12	109172	109183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376391
37	NC_006393	AGGTGA	2	12	118762	118773	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	55376400
38	NC_006393	CGATGG	2	12	122335	122346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376403
39	NC_006393	TGACGA	2	12	122950	122961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55376403
40	NC_006393	GCCGGA	2	12	123541	123552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
41	NC_006393	GCCGGA	2	12	123562	123573	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
42	NC_006393	GCCGGA	2	12	123583	123594	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
43	NC_006393	GCCGGA	2	12	123604	123615	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
44	NC_006393	GCCGGA	2	12	123625	123636	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
45	NC_006393	GACCGT	2	12	126981	126992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376406

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.