MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	GCAAC	2	10	6208	6217	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_006393	CATCT	2	10	13543	13552	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_006393	TCCGT	2	10	19797	19806	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_006393	GCAAC	2	10	24971	24980	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_006393	AACGA	2	10	25114	25123	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006393	CTAGA	2	10	27420	27429	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006393	AACGA	2	10	27874	27883	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_006393	CGGGC	2	10	31805	31814	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_006393	AGTTT	2	10	34854	34863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006393	GCCAG	2	10	37298	37307	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_006393	AACAG	2	10	43196	43205	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006393	TCAGG	2	10	43211	43220	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_006393	CTTCG	2	10	47958	47967	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_006393	TGGCG	2	10	58942	58951	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_006393	CCATT	2	10	58955	58964	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_006393	ACCGC	2	10	66078	66087	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_006393	AGTCC	2	10	69852	69861	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_006393	AAGTC	2	10	71301	71310	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_006393	AAACC	2	10	71576	71585	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_006393	TAGTT	2	10	72139	72148	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006393	CTCAC	2	10	84974	84983	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_006393	AGCGC	2	10	85379	85388	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_006393	GAGCG	2	10	86736	86745	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_006393	CTGCC	2	10	88249	88258	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_006393	AAAAT	2	10	98221	98230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006393	CGACA	2	10	98821	98830	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_006393	TACCC	2	10	105661	105670	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_006393	GAGTC	2	10	105677	105686	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_006393	AAACC	2	10	105899	105908	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_006393	AGCTG	2	10	109597	109606	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006393	GAGAA	2	10	109796	109805	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006393	AGATA	2	10	113229	113238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006393	CAGCT	2	10	120555	120564	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_006393	TGGTT	2	10	124575	124584	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006393	TGCGG	2	10	125600	125609	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_006393	GCGGT	2	10	128671	128680	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.