MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	CATCG	2	10	312	321	20 %	20 %	20 %	40 %	55376281
2	NC_006393	AGCGA	2	10	1192	1201	40 %	0 %	40 %	20 %	55376281
3	NC_006393	GCGCC	2	10	1269	1278	0 %	0 %	40 %	60 %	55376281
4	NC_006393	GACCA	2	10	5660	5669	40 %	0 %	20 %	40 %	55376286
5	NC_006393	TTGTC	2	10	13186	13195	0 %	60 %	20 %	20 %	55376291
6	NC_006393	GGGAC	2	10	14725	14734	20 %	0 %	60 %	20 %	55376293
7	NC_006393	AGTCG	2	10	14739	14748	20 %	20 %	40 %	20 %	55376293
8	NC_006393	AGAGC	2	10	19397	19406	40 %	0 %	40 %	20 %	55376295
9	NC_006393	GATCG	2	10	19566	19575	20 %	20 %	40 %	20 %	55376295
10	NC_006393	TCACG	2	10	22164	22173	20 %	20 %	20 %	40 %	55376299
11	NC_006393	TCGAT	2	10	22722	22731	20 %	40 %	20 %	20 %	55376300
12	NC_006393	CCACG	2	10	23007	23016	20 %	0 %	20 %	60 %	55376300
13	NC_006393	ACCAC	2	10	25955	25964	40 %	0 %	0 %	60 %	55376302
14	NC_006393	ACCAC	2	10	25991	26000	40 %	0 %	0 %	60 %	55376302
15	NC_006393	GGCTG	2	10	32095	32104	0 %	20 %	60 %	20 %	55376311
16	NC_006393	AAAAT	2	10	32691	32700	80 %	20 %	0 %	0 %	55376313
17	NC_006393	TGGCT	2	10	38018	38027	0 %	40 %	40 %	20 %	55376318
18	NC_006393	GTCTC	2	10	43701	43710	0 %	40 %	20 %	40 %	55376326
19	NC_006393	TTCAT	2	10	44205	44214	20 %	60 %	0 %	20 %	55376326
20	NC_006393	TCACC	2	10	44497	44506	20 %	20 %	0 %	60 %	55376326
21	NC_006393	GCATC	2	10	46037	46046	20 %	20 %	20 %	40 %	55376329
22	NC_006393	TGAGT	2	10	55509	55518	20 %	40 %	40 %	0 %	55376337
23	NC_006393	TCAAA	2	10	63981	63990	60 %	20 %	0 %	20 %	55376343
24	NC_006393	CGTCG	2	10	64587	64596	0 %	20 %	40 %	40 %	55376344
25	NC_006393	CGAGG	2	10	65956	65965	20 %	0 %	60 %	20 %	55376347
26	NC_006393	ACACG	2	10	66731	66740	40 %	0 %	20 %	40 %	55376348
27	NC_006393	TCGGC	2	10	67445	67454	0 %	20 %	40 %	40 %	55376349
28	NC_006393	TGTTC	2	10	68926	68935	0 %	60 %	20 %	20 %	55376350
29	NC_006393	CATCT	2	10	69010	69019	20 %	40 %	0 %	40 %	55376350
30	NC_006393	CCCAG	2	10	72975	72984	20 %	0 %	20 %	60 %	55376354
31	NC_006393	GTTGG	2	10	76070	76079	0 %	40 %	60 %	0 %	55376356
32	NC_006393	TCCGC	2	10	77009	77018	0 %	20 %	20 %	60 %	55376356
33	NC_006393	CAGCG	2	10	82537	82546	20 %	0 %	40 %	40 %	55376361
34	NC_006393	CGAAC	2	10	87225	87234	40 %	0 %	20 %	40 %	55376365
35	NC_006393	TGCTG	2	10	88648	88657	0 %	40 %	40 %	20 %	55376366
36	NC_006393	CGACT	2	10	88973	88982	20 %	20 %	20 %	40 %	55376366
37	NC_006393	TCCAT	2	10	92206	92215	20 %	40 %	0 %	40 %	55376371
38	NC_006393	GTTCG	2	10	96399	96408	0 %	40 %	40 %	20 %	55376376
39	NC_006393	GGACG	2	10	96534	96543	20 %	0 %	60 %	20 %	55376376
40	NC_006393	GGCGT	2	10	111404	111413	0 %	20 %	60 %	20 %	55376393
41	NC_006393	CTGTC	2	10	112119	112128	0 %	40 %	20 %	40 %	55376394
42	NC_006393	ACGGC	2	10	112341	112350	20 %	0 %	40 %	40 %	55376394
43	NC_006393	GGTCG	2	10	112351	112360	0 %	20 %	60 %	20 %	55376394
44	NC_006393	GTAGG	2	10	112972	112981	20 %	20 %	60 %	0 %	55376394
45	NC_006393	CGGCA	2	10	114570	114579	20 %	0 %	40 %	40 %	55376395
46	NC_006393	CTTCT	2	10	120058	120067	0 %	60 %	0 %	40 %	55376402
47	NC_006393	ACAAA	2	10	121130	121139	80 %	0 %	0 %	20 %	55376403
48	NC_006393	GACCT	2	10	121838	121847	20 %	20 %	20 %	40 %	55376403
49	NC_006393	ATTCA	2	10	125523	125532	40 %	40 %	0 %	20 %	55376404
50	NC_006393	TCGTC	2	10	130120	130129	0 %	40 %	20 %	40 %	55376408
51	NC_006393	AGACG	2	10	131909	131918	40 %	0 %	40 %	20 %	55376411

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.