MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	TATC	2	8	28	35	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006393	TCGG	2	8	3560	3567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_006393	GCAC	2	8	3692	3699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006393	AAAG	2	8	4169	4176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006393	GCTC	2	8	4254	4261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006393	AGAA	2	8	4456	4463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006393	AGAA	2	8	5393	5400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006393	AGAA	2	8	5528	5535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006393	TAAA	2	8	6233	6240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006393	TGTA	2	8	6308	6315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006393	ACAA	2	8	6323	6330	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006393	ACGT	2	8	6414	6421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006393	TTCT	2	8	6441	6448	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006393	CCCA	2	8	6545	6552	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_006393	AAAT	2	8	6702	6709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006393	TCAG	2	8	6716	6723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_006393	CAGT	2	8	6922	6929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006393	AATT	2	8	13660	13667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006393	CCCG	2	8	14336	14343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_006393	TCGA	2	8	19690	19697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006393	TTCT	2	8	19748	19755	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006393	GCCT	2	8	22496	22503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006393	CCAA	2	8	23711	23718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006393	GTGA	2	8	23876	23883	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006393	TTTG	2	8	24161	24168	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006393	CAGA	2	8	24646	24653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_006393	ACGT	2	8	24709	24716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006393	TCGT	2	8	25043	25050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_006393	GGAA	2	8	25078	25085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006393	CAGG	2	8	25434	25441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_006393	AACC	2	8	27669	27676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006393	GTTA	2	8	27703	27710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006393	GGAA	2	8	27841	27848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006393	GTAG	2	8	29080	29087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006393	GACC	2	8	29866	29873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_006393	CGTA	2	8	30792	30799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006393	TGGC	2	8	30803	30810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006393	GACG	2	8	31032	31039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006393	GCCG	2	8	32588	32595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006393	CTGT	2	8	34017	34024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006393	CAGT	2	8	34125	34132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006393	TGCG	2	8	34278	34285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_006393	GTAC	2	8	34381	34388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006393	ATAG	2	8	34743	34750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006393	CCGA	2	8	37123	37130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006393	TGGG	2	8	37337	37344	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006393	CGCA	2	8	37724	37731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006393	ATCA	2	8	41768	41775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006393	CCGT	2	8	41814	41821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006393	ATTT	2	8	42623	42630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006393	TGCT	2	8	42900	42907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006393	GGCG	2	8	42943	42950	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_006393	ACCG	2	8	43077	43084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_006393	CAAC	2	8	46581	46588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_006393	TTTC	2	8	48044	48051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_006393	CGCC	2	8	49503	49510	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_006393	TCAC	2	8	51444	51451	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006393	TGAG	2	8	51576	51583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006393	TTCG	2	8	53208	53215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_006393	CGGG	2	8	53250	53257	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_006393	AATC	2	8	57428	57435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006393	GACA	2	8	57578	57585	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_006393	GAAT	2	8	57927	57934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006393	CTAA	2	8	59562	59569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_006393	CTGC	2	8	63574	63581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006393	GGGC	2	8	66016	66023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_006393	GGTC	2	8	66034	66041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_006393	AAGC	2	8	66315	66322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_006393	CGGG	2	8	66337	66344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_006393	TGAC	2	8	67330	67337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_006393	TCGG	2	8	69737	69744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006393	ACGG	2	8	71012	71019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006393	TGAT	2	8	71058	71065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006393	ACGA	2	8	71264	71271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_006393	GGCA	2	8	71472	71479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_006393	TCAT	2	8	72196	72203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_006393	GCAA	2	8	72390	72397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_006393	GGCG	2	8	84849	84856	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_006393	CACG	2	8	85053	85060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006393	CGGC	2	8	85502	85509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006393	TGTC	2	8	86016	86023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_006393	CGTA	2	8	88283	88290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_006393	ACTG	2	8	89624	89631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_006393	CAGT	2	8	90169	90176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_006393	GGTC	2	8	90223	90230	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_006393	CGAG	2	8	90276	90283	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_006393	GCCA	2	8	93238	93245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006393	ATTC	2	8	95661	95668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_006393	GATT	2	8	95739	95746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006393	GTTA	2	8	98152	98159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006393	ACCG	2	8	98746	98753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006393	AGTG	2	8	100608	100615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006393	TAAG	2	8	103873	103880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006393	TTCT	2	8	109877	109884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_006393	CCGT	2	8	110061	110068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_006393	AGCG	2	8	111185	111192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006393	CCGA	2	8	111193	111200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_006393	AGGG	2	8	111216	111223	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006393	TGCT	2	8	116556	116563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_006393	CAAG	2	8	116581	116588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_006393	TGAG	2	8	120375	120382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006393	CGCT	2	8	120760	120767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_006393	TGAG	2	8	124038	124045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006393	TGTC	2	8	124337	124344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_006393	ACCA	2	8	124350	124357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_006393	GACA	2	8	124380	124387	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_006393	CCAG	2	8	124531	124538	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_006393	GACG	2	8	124758	124765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_006393	CAGA	2	8	125037	125044	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_006393	CTTC	2	8	125111	125118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_006393	AACC	2	8	126592	126599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_006393	AGCG	2	8	127512	127519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_006393	TCGC	2	8	128480	128487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_006393	CGAC	2	8	128716	128723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_006393	CTTC	2	8	129867	129874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_006393	CGGT	2	8	129919	129926	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_006393	TTCC	2	8	130359	130366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006393	ACTA	2	8	130410	130417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_006393	GGCG	2	8	130472	130479	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_006393	GCCA	2	8	132171	132178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.