MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 261

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	CTCG	2	8	204	211	0 %	25 %	25 %	50 %	55376281
2	NC_006393	CGAG	2	8	602	609	25 %	0 %	50 %	25 %	55376281
3	NC_006393	TGAG	2	8	647	654	25 %	25 %	50 %	0 %	55376281
4	NC_006393	GAAC	2	8	735	742	50 %	0 %	25 %	25 %	55376281
5	NC_006393	GCTT	2	8	1047	1054	0 %	50 %	25 %	25 %	55376281
6	NC_006393	TCGT	2	8	1253	1260	0 %	50 %	25 %	25 %	55376281
7	NC_006393	GTCG	2	8	1581	1588	0 %	25 %	50 %	25 %	55376282
8	NC_006393	TCCG	2	8	2230	2237	0 %	25 %	25 %	50 %	55376283
9	NC_006393	GCCC	2	8	2402	2409	0 %	0 %	25 %	75 %	55376283
10	NC_006393	GGAC	2	8	2450	2457	25 %	0 %	50 %	25 %	55376283
11	NC_006393	CGTC	2	8	2540	2547	0 %	25 %	25 %	50 %	55376283
12	NC_006393	ACCG	2	8	2799	2806	25 %	0 %	25 %	50 %	55376283
13	NC_006393	GGCG	2	8	4817	4824	0 %	0 %	75 %	25 %	55376285
14	NC_006393	GCTC	2	8	5258	5265	0 %	25 %	25 %	50 %	55376285
15	NC_006393	CGAT	2	8	6072	6079	25 %	25 %	25 %	25 %	55376286
16	NC_006393	CGAC	2	8	7259	7266	25 %	0 %	25 %	50 %	55376287
17	NC_006393	TGGC	2	8	8008	8015	0 %	25 %	50 %	25 %	55376287
18	NC_006393	CAGC	2	8	8562	8569	25 %	0 %	25 %	50 %	55376288
19	NC_006393	CACT	2	8	8649	8656	25 %	25 %	0 %	50 %	55376288
20	NC_006393	GGCA	2	8	8902	8909	25 %	0 %	50 %	25 %	55376288
21	NC_006393	TCCC	2	8	8937	8944	0 %	25 %	0 %	75 %	55376288
22	NC_006393	GATT	2	8	8962	8969	25 %	50 %	25 %	0 %	55376288
23	NC_006393	GCAA	2	8	9206	9213	50 %	0 %	25 %	25 %	55376288
24	NC_006393	TGGC	2	8	9309	9316	0 %	25 %	50 %	25 %	55376288
25	NC_006393	TCTT	2	8	10047	10054	0 %	75 %	0 %	25 %	55376288
26	NC_006393	GGCC	2	8	10079	10086	0 %	0 %	50 %	50 %	55376288
27	NC_006393	CACT	2	8	10287	10294	25 %	25 %	0 %	50 %	55376288
28	NC_006393	CGTG	2	8	10729	10736	0 %	25 %	50 %	25 %	55376289
29	NC_006393	GCGT	2	8	10750	10757	0 %	25 %	50 %	25 %	55376289
30	NC_006393	GTTC	2	8	10792	10799	0 %	50 %	25 %	25 %	55376289
31	NC_006393	TCGA	2	8	11349	11356	25 %	25 %	25 %	25 %	55376289
32	NC_006393	TCAA	2	8	12300	12307	50 %	25 %	0 %	25 %	55376290
33	NC_006393	CCTG	2	8	13280	13287	0 %	25 %	25 %	50 %	55376291
34	NC_006393	CATT	2	8	13315	13322	25 %	50 %	0 %	25 %	55376291
35	NC_006393	GGAT	2	8	15068	15075	25 %	25 %	50 %	0 %	55376293
36	NC_006393	ACCG	2	8	15411	15418	25 %	0 %	25 %	50 %	55376293
37	NC_006393	AGCG	2	8	16618	16625	25 %	0 %	50 %	25 %	55376294
38	NC_006393	CGCC	2	8	16741	16748	0 %	0 %	25 %	75 %	55376294
39	NC_006393	CAGC	2	8	16758	16765	25 %	0 %	25 %	50 %	55376294
40	NC_006393	GCTT	2	8	17178	17185	0 %	50 %	25 %	25 %	55376294
41	NC_006393	CTTG	2	8	18326	18333	0 %	50 %	25 %	25 %	55376295
42	NC_006393	TCGA	2	8	18748	18755	25 %	25 %	25 %	25 %	55376295
43	NC_006393	TCGA	2	8	19041	19048	25 %	25 %	25 %	25 %	55376295
44	NC_006393	AGCC	2	8	19363	19370	25 %	0 %	25 %	50 %	55376295
45	NC_006393	ATCG	2	8	19597	19604	25 %	25 %	25 %	25 %	55376295
46	NC_006393	ACTC	2	8	20414	20421	25 %	25 %	0 %	50 %	55376296
47	NC_006393	AAAC	2	8	20820	20827	75 %	0 %	0 %	25 %	55376297
48	NC_006393	CTCA	2	8	22095	22102	25 %	25 %	0 %	50 %	55376299
49	NC_006393	TCAA	2	8	22277	22284	50 %	25 %	0 %	25 %	55376299
50	NC_006393	GAGC	2	8	22732	22739	25 %	0 %	50 %	25 %	55376300
51	NC_006393	CATC	2	8	22757	22764	25 %	25 %	0 %	50 %	55376300
52	NC_006393	CAGC	2	8	22816	22823	25 %	0 %	25 %	50 %	55376300
53	NC_006393	TATT	2	8	22954	22961	25 %	75 %	0 %	0 %	55376300
54	NC_006393	GGTG	2	8	23074	23081	0 %	25 %	75 %	0 %	55376301
55	NC_006393	CGAC	2	8	23320	23327	25 %	0 %	25 %	50 %	55376301
56	NC_006393	AGTC	2	8	25488	25495	25 %	25 %	25 %	25 %	55376302
57	NC_006393	TCAG	2	8	25512	25519	25 %	25 %	25 %	25 %	55376302
58	NC_006393	TCTG	2	8	25679	25686	0 %	50 %	25 %	25 %	55376302
59	NC_006393	CCCG	2	8	26059	26066	0 %	0 %	25 %	75 %	55376302
60	NC_006393	GAGC	2	8	26487	26494	25 %	0 %	50 %	25 %	55376304
61	NC_006393	CCCA	2	8	27187	27194	25 %	0 %	0 %	75 %	55376304
62	NC_006393	TGTT	2	8	28101	28108	0 %	75 %	25 %	0 %	55376305
63	NC_006393	GTTC	2	8	28870	28877	0 %	50 %	25 %	25 %	55376305
64	NC_006393	CTGG	2	8	29456	29463	0 %	25 %	50 %	25 %	55376306
65	NC_006393	ACTC	2	8	29594	29601	25 %	25 %	0 %	50 %	55376307
66	NC_006393	CGGC	2	8	30160	30167	0 %	0 %	50 %	50 %	55376308
67	NC_006393	GTTC	2	8	30367	30374	0 %	50 %	25 %	25 %	55376308
68	NC_006393	CTTG	2	8	31428	31435	0 %	50 %	25 %	25 %	55376310
69	NC_006393	ACCA	2	8	32805	32812	50 %	0 %	0 %	50 %	55376313
70	NC_006393	GAGC	2	8	32999	33006	25 %	0 %	50 %	25 %	55376314
71	NC_006393	TGCT	2	8	33409	33416	0 %	50 %	25 %	25 %	55376314
72	NC_006393	CTGT	2	8	35550	35557	0 %	50 %	25 %	25 %	55376316
73	NC_006393	CTCG	2	8	36906	36913	0 %	25 %	25 %	50 %	55376317
74	NC_006393	ATCC	2	8	37898	37905	25 %	25 %	0 %	50 %	55376318
75	NC_006393	CGAC	2	8	38627	38634	25 %	0 %	25 %	50 %	55376319
76	NC_006393	CGTC	2	8	39715	39722	0 %	25 %	25 %	50 %	55376322
77	NC_006393	AAAT	2	8	41096	41103	75 %	25 %	0 %	0 %	55376324
78	NC_006393	GATG	2	8	41328	41335	25 %	25 %	50 %	0 %	55376324
79	NC_006393	TGAT	2	8	41409	41416	25 %	50 %	25 %	0 %	55376324
80	NC_006393	GGAA	2	8	43955	43962	50 %	0 %	50 %	0 %	55376326
81	NC_006393	GTCG	2	8	43971	43978	0 %	25 %	50 %	25 %	55376326
82	NC_006393	GATC	2	8	44196	44203	25 %	25 %	25 %	25 %	55376326
83	NC_006393	ATCC	2	8	44326	44333	25 %	25 %	0 %	50 %	55376326
84	NC_006393	TCAA	2	8	44816	44823	50 %	25 %	0 %	25 %	55376326
85	NC_006393	TCGA	2	8	45291	45298	25 %	25 %	25 %	25 %	55376327
86	NC_006393	GATT	2	8	45320	45327	25 %	50 %	25 %	0 %	55376327
87	NC_006393	CGGA	2	8	45672	45679	25 %	0 %	50 %	25 %	55376328
88	NC_006393	CGTC	2	8	45866	45873	0 %	25 %	25 %	50 %	55376329
89	NC_006393	TCGA	2	8	47385	47392	25 %	25 %	25 %	25 %	55376331
90	NC_006393	GCAG	2	8	48899	48906	25 %	0 %	50 %	25 %	55376333
91	NC_006393	CTCG	2	8	48987	48994	0 %	25 %	25 %	50 %	55376334
92	NC_006393	CGAG	2	8	49068	49075	25 %	0 %	50 %	25 %	55376334
93	NC_006393	GCTG	2	8	50060	50067	0 %	25 %	50 %	25 %	55376335
94	NC_006393	TTCC	2	8	50499	50506	0 %	50 %	0 %	50 %	55376335
95	NC_006393	ATCG	2	8	51056	51063	25 %	25 %	25 %	25 %	55376335
96	NC_006393	AAGA	2	8	51893	51900	75 %	0 %	25 %	0 %	55376336
97	NC_006393	GTAC	2	8	52045	52052	25 %	25 %	25 %	25 %	55376336
98	NC_006393	CCAA	2	8	52170	52177	50 %	0 %	0 %	50 %	55376336
99	NC_006393	AAGC	2	8	54009	54016	50 %	0 %	25 %	25 %	55376337
100	NC_006393	GCGA	2	8	54173	54180	25 %	0 %	50 %	25 %	55376337
101	NC_006393	ACTG	2	8	54260	54267	25 %	25 %	25 %	25 %	55376337
102	NC_006393	GGAA	2	8	54383	54390	50 %	0 %	50 %	0 %	55376337
103	NC_006393	GAAG	2	8	54403	54410	50 %	0 %	50 %	0 %	55376337
104	NC_006393	ACGA	2	8	55294	55301	50 %	0 %	25 %	25 %	55376337
105	NC_006393	AGTC	2	8	55605	55612	25 %	25 %	25 %	25 %	55376337
106	NC_006393	GGTA	2	8	55941	55948	25 %	25 %	50 %	0 %	55376338
107	NC_006393	ATCT	2	8	57115	57122	25 %	50 %	0 %	25 %	55376338
108	NC_006393	CGGG	2	8	58510	58517	0 %	0 %	75 %	25 %	55376339
109	NC_006393	ATCC	2	8	58547	58554	25 %	25 %	0 %	50 %	55376339
110	NC_006393	CAGA	2	8	58594	58601	50 %	0 %	25 %	25 %	55376339
111	NC_006393	GACT	2	8	59669	59676	25 %	25 %	25 %	25 %	55376341
112	NC_006393	CGAT	2	8	60178	60185	25 %	25 %	25 %	25 %	55376341
113	NC_006393	GTCT	2	8	60384	60391	0 %	50 %	25 %	25 %	55376341
114	NC_006393	TCCA	2	8	60504	60511	25 %	25 %	0 %	50 %	55376341
115	NC_006393	GAAT	2	8	60634	60641	50 %	25 %	25 %	0 %	55376341
116	NC_006393	GGGA	2	8	60829	60836	25 %	0 %	75 %	0 %	55376341
117	NC_006393	ATCG	2	8	61636	61643	25 %	25 %	25 %	25 %	55376341
118	NC_006393	CACT	2	8	62124	62131	25 %	25 %	0 %	50 %	55376342
119	NC_006393	CGTT	2	8	62232	62239	0 %	50 %	25 %	25 %	55376342
120	NC_006393	TCGT	2	8	62597	62604	0 %	50 %	25 %	25 %	55376342
121	NC_006393	TCGC	2	8	62703	62710	0 %	25 %	25 %	50 %	55376342
122	NC_006393	CGTT	2	8	62934	62941	0 %	50 %	25 %	25 %	55376342
123	NC_006393	TACC	2	8	63012	63019	25 %	25 %	0 %	50 %	55376342
124	NC_006393	AAGC	2	8	63503	63510	50 %	0 %	25 %	25 %	55376342
125	NC_006393	CGCA	2	8	64188	64195	25 %	0 %	25 %	50 %	55376344
126	NC_006393	TCCA	2	8	64363	64370	25 %	25 %	0 %	50 %	55376344
127	NC_006393	TTGA	2	8	65531	65538	25 %	50 %	25 %	0 %	55376346
128	NC_006393	CGAC	2	8	66446	66453	25 %	0 %	25 %	50 %	55376348
129	NC_006393	CACT	2	8	66498	66505	25 %	25 %	0 %	50 %	55376348
130	NC_006393	GGCG	2	8	66529	66536	0 %	0 %	75 %	25 %	55376348
131	NC_006393	ATTT	2	8	68134	68141	25 %	75 %	0 %	0 %	55376350
132	NC_006393	CACT	2	8	68436	68443	25 %	25 %	0 %	50 %	55376350
133	NC_006393	GATT	2	8	68553	68560	25 %	50 %	25 %	0 %	55376350
134	NC_006393	TCTG	2	8	68670	68677	0 %	50 %	25 %	25 %	55376350
135	NC_006393	TGAC	2	8	68892	68899	25 %	25 %	25 %	25 %	55376350
136	NC_006393	GTTC	2	8	69036	69043	0 %	50 %	25 %	25 %	55376350
137	NC_006393	GTTG	2	8	69066	69073	0 %	50 %	50 %	0 %	55376350
138	NC_006393	ATTG	2	8	69496	69503	25 %	50 %	25 %	0 %	55376350
139	NC_006393	GTTT	2	8	70558	70565	0 %	75 %	25 %	0 %	55376351
140	NC_006393	CTGG	2	8	72648	72655	0 %	25 %	50 %	25 %	55376353
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142	NC_006393	GTCC	2	8	73681	73688	0 %	25 %	25 %	50 %	55376354
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.