MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 1990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	CAC	2	6	5	10	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_006393	GCT	2	6	65	70	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006393	GAT	2	6	144	149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006393	ACC	2	6	381	386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376281
5	NC_006393	AGC	2	6	532	537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376281
6	NC_006393	TGA	2	6	569	574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376281
7	NC_006393	CTG	2	6	582	587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376281
8	NC_006393	GCT	2	6	632	637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376281
9	NC_006393	GAG	2	6	778	783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376281
10	NC_006393	CTT	2	6	794	799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376281
11	NC_006393	CCT	2	6	923	928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376281
12	NC_006393	GCT	2	6	943	948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376281
13	NC_006393	GGC	2	6	978	983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376281
14	NC_006393	CGA	2	6	1205	1210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376281
15	NC_006393	GAA	2	6	1293	1298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006393	CGA	2	6	1395	1400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
17	NC_006393	CGT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
18	NC_006393	TCG	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
19	NC_006393	GCG	2	6	1426	1431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376282
20	NC_006393	TCG	2	6	1436	1441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
21	NC_006393	TCG	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
22	NC_006393	TGA	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376282
23	NC_006393	GCT	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
24	NC_006393	TCG	2	6	1562	1567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
25	NC_006393	CAG	2	6	1651	1656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
26	NC_006393	CAG	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
27	NC_006393	CAG	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
28	NC_006393	CAG	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
29	NC_006393	CCG	2	6	1934	1939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376282
30	NC_006393	CAC	2	6	2000	2005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376283
31	NC_006393	GCG	2	6	2013	2018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376283
32	NC_006393	ACG	2	6	2032	2037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
33	NC_006393	GCA	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
34	NC_006393	CTG	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
35	NC_006393	GTC	2	6	2181	2186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
36	NC_006393	CGA	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
37	NC_006393	AGT	2	6	2288	2293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376283
38	NC_006393	CGT	2	6	2463	2468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
39	NC_006393	CGG	2	6	2471	2476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376283
40	NC_006393	CTT	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376283
41	NC_006393	ACG	2	6	2612	2617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
42	NC_006393	GCG	2	6	2654	2659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376283
43	NC_006393	GTC	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
44	NC_006393	CGT	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
45	NC_006393	GTC	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
46	NC_006393	ACG	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
47	NC_006393	TGC	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006393	ACT	2	6	3291	3296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006393	AAT	2	6	3415	3420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006393	ACA	2	6	3424	3429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006393	AGG	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006393	GAG	2	6	3628	3633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006393	CCT	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_006393	GTA	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006393	ATC	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006393	GTT	2	6	4011	4016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006393	GCG	2	6	4018	4023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006393	TGC	2	6	4059	4064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006393	GAA	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006393	TGA	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006393	AGC	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006393	GAA	2	6	4273	4278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006393	CGG	2	6	4312	4317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006393	AAG	2	6	4325	4330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006393	CTA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006393	CGG	2	6	4489	4494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006393	CGT	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
68	NC_006393	CTG	2	6	4825	4830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
69	NC_006393	GCA	3	9	4842	4850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376285
70	NC_006393	CGC	2	6	4866	4871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376285
71	NC_006393	TTC	2	6	4885	4890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376285
72	NC_006393	CCG	2	6	4893	4898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376285
73	NC_006393	TCA	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376285
74	NC_006393	TAC	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376285
75	NC_006393	GAC	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376285
76	NC_006393	GTC	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
77	NC_006393	GAC	2	6	5062	5067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376285
78	NC_006393	CTG	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
79	NC_006393	GTT	2	6	5451	5456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006393	GCC	2	6	5569	5574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_006393	CGA	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006393	GCG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006393	CCG	2	6	5823	5828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376286
84	NC_006393	GAA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376286
85	NC_006393	GAA	2	6	5870	5875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376286
86	NC_006393	TCG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376286
87	NC_006393	GGC	2	6	5935	5940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376286
88	NC_006393	GAC	2	6	5945	5950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376286
89	NC_006393	TTC	2	6	6041	6046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376286
90	NC_006393	ACC	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376286
91	NC_006393	ATT	2	6	6117	6122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376286
92	NC_006393	ACT	2	6	6130	6135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006393	TGG	2	6	6247	6252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006393	CTT	2	6	6455	6460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006393	AGG	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006393	GTG	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006393	CAA	2	6	6951	6956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006393	AGC	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006393	TGC	2	6	7039	7044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006393	AAC	2	6	7125	7130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006393	GAC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376287
102	NC_006393	CAA	2	6	7299	7304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376287
103	NC_006393	GAA	2	6	7319	7324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376287
104	NC_006393	GTT	2	6	7343	7348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376287
105	NC_006393	AAC	2	6	7349	7354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376287
106	NC_006393	CTC	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376287
107	NC_006393	ATT	2	6	7619	7624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376287
108	NC_006393	TTG	2	6	7728	7733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376287
109	NC_006393	GGC	2	6	7780	7785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376287
110	NC_006393	GCA	2	6	7820	7825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376287
111	NC_006393	GTG	2	6	7827	7832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376287
112	NC_006393	ACC	2	6	7913	7918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376287
113	NC_006393	ATT	2	6	7985	7990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376287
114	NC_006393	GGT	2	6	8019	8024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376287
115	NC_006393	CGA	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
116	NC_006393	ACA	2	6	8232	8237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
117	NC_006393	GAC	2	6	8272	8277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
118	NC_006393	GCA	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
119	NC_006393	CCA	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376288
120	NC_006393	CAA	2	6	8577	8582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
121	NC_006393	AGC	2	6	8633	8638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
122	NC_006393	CAA	2	6	8666	8671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
123	NC_006393	TTG	2	6	8682	8687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376288
124	NC_006393	CGG	2	6	8695	8700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376288
125	NC_006393	TCA	2	6	8744	8749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
126	NC_006393	TAG	2	6	8772	8777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
127	NC_006393	ATC	2	6	8813	8818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
128	NC_006393	TCG	2	6	9060	9065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376288
129	NC_006393	ACT	2	6	9086	9091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
130	NC_006393	TGC	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376288
131	NC_006393	TCG	2	6	9150	9155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376288
132	NC_006393	GGA	2	6	9280	9285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376288
133	NC_006393	ACT	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
134	NC_006393	AGC	2	6	9331	9336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
135	NC_006393	GAT	2	6	9422	9427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
136	NC_006393	GAA	2	6	9440	9445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376288
137	NC_006393	AAC	2	6	9508	9513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
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139	NC_006393	GAT	2	6	9587	9592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
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143	NC_006393	ATG	2	6	9789	9794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
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147	NC_006393	CCT	2	6	10105	10110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376288
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391	NC_006393	GCA	2	6	25666	25671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376302
392	NC_006393	CTG	2	6	25673	25678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376302
393	NC_006393	CTT	2	6	25720	25725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376302
394	NC_006393	TCG	3	9	25758	25766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376302
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402	NC_006393	CTC	2	6	26354	26359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376304
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432	NC_006393	ACA	2	6	28001	28006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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499	NC_006393	GTG	2	6	31819	31824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_006393	GCC	2	6	31925	31930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376311

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