MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG400

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006392	GTTGTG	2	12	1202	1213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006392	TCGCCT	2	12	1788	1799	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55376230
3	NC_006392	TCACAC	2	12	5361	5372	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	55376236
4	NC_006392	AAAAAC	2	12	7784	7795	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	55376239
5	NC_006392	TCGCTG	2	12	8366	8377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376240
6	NC_006392	GAGTTC	2	12	12256	12267	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55376245
7	NC_006392	TTGTCG	2	12	13867	13878	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55376247
8	NC_006392	GACGGC	2	12	18033	18044	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376255
9	NC_006392	AGTTCC	2	12	19165	19176	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55376255
10	NC_006392	CTTTCT	2	12	20676	20687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376258
11	NC_006392	GTAGCG	2	12	20926	20937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376259
12	NC_006392	CGATAT	2	12	24541	24552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55376261
13	NC_006392	CGTCGA	2	12	26110	26121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376263
14	NC_006392	ATCGGG	2	12	26663	26674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376263
15	NC_006392	CCGTCG	2	12	27114	27125	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55376263
16	NC_006392	ACGGTC	2	12	31773	31784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376267
17	NC_006392	GTGGTC	2	12	33460	33471	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55376269
18	NC_006392	GCTGGC	2	12	34822	34833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006392	GACGCT	2	12	43021	43032	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376276
20	NC_006392	GAGGAA	2	12	46448	46459	50 %	0 %	50 %	0 %	55376279
21	NC_006392	AGCACG	2	12	46764	46775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.