MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG400

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006392	AGTCC	2	10	1140	1149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_006392	CAGCG	2	10	2753	2762	20 %	0 %	40 %	40 %	55376231
3	NC_006392	TCCAG	2	10	4755	4764	20 %	20 %	20 %	40 %	55376235
4	NC_006392	ACGGC	2	10	4937	4946	20 %	0 %	40 %	40 %	55376235
5	NC_006392	GAACT	2	10	7992	8001	40 %	20 %	20 %	20 %	55376239
6	NC_006392	ACGAT	2	10	9990	9999	40 %	20 %	20 %	20 %	55376242
7	NC_006392	CAGTC	2	10	10165	10174	20 %	20 %	20 %	40 %	55376242
8	NC_006392	TACCC	2	10	10978	10987	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_006392	ACCAG	2	10	11147	11156	40 %	0 %	20 %	40 %	55376244
10	NC_006392	TACAC	2	10	27347	27356	40 %	20 %	0 %	40 %	55376263
11	NC_006392	GGGTC	2	10	28302	28311	0 %	20 %	60 %	20 %	55376263
12	NC_006392	CGCTG	2	10	28755	28764	0 %	20 %	40 %	40 %	55376263
13	NC_006392	GGCCG	2	10	31941	31950	0 %	0 %	60 %	40 %	55376267
14	NC_006392	CAATC	2	10	34365	34374	40 %	20 %	0 %	40 %	55376271
15	NC_006392	AGTGA	2	10	34962	34971	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006392	CAGAA	2	10	35256	35265	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_006392	TGAAG	2	10	35637	35646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006392	AGCCA	2	10	36374	36383	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_006392	AAGAA	2	10	40022	40031	80 %	0 %	20 %	0 %	55376273
20	NC_006392	TCGAC	2	10	41029	41038	20 %	20 %	20 %	40 %	55376274
21	NC_006392	GACGA	2	10	44552	44561	40 %	0 %	40 %	20 %	55376276
22	NC_006392	CTCGT	2	10	45444	45453	0 %	40 %	20 %	40 %	55376278
23	NC_006392	AGTGA	2	10	46603	46612	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006392	CCCTC	2	10	46820	46829	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_006392	GACGG	2	10	49218	49227	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.