MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG400

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006392	TTGA	2	8	2100	2107	25 %	50 %	25 %	0 %	55376231
2	NC_006392	CAAT	2	8	3247	3254	50 %	25 %	0 %	25 %	55376232
3	NC_006392	GACT	2	8	3562	3569	25 %	25 %	25 %	25 %	55376232
4	NC_006392	TTTG	2	8	4027	4034	0 %	75 %	25 %	0 %	55376233
5	NC_006392	ATGG	2	8	4278	4285	25 %	25 %	50 %	0 %	55376234
6	NC_006392	CGAG	2	8	4294	4301	25 %	0 %	50 %	25 %	55376234
7	NC_006392	CGAT	2	8	4310	4317	25 %	25 %	25 %	25 %	55376234
8	NC_006392	GCCA	2	8	4877	4884	25 %	0 %	25 %	50 %	55376235
9	NC_006392	AACA	2	8	5769	5776	75 %	0 %	0 %	25 %	55376236
10	NC_006392	GAAT	2	8	6501	6508	50 %	25 %	25 %	0 %	55376237
11	NC_006392	GGTT	2	8	7443	7450	0 %	50 %	50 %	0 %	55376239
12	NC_006392	CATC	2	8	7880	7887	25 %	25 %	0 %	50 %	55376239
13	NC_006392	GGGC	2	8	7894	7901	0 %	0 %	75 %	25 %	55376239
14	NC_006392	CATC	2	8	8167	8174	25 %	25 %	0 %	50 %	55376239
15	NC_006392	CGAC	2	8	8582	8589	25 %	0 %	25 %	50 %	55376240
16	NC_006392	TCGT	2	8	8944	8951	0 %	50 %	25 %	25 %	55376240
17	NC_006392	GGAC	2	8	9896	9903	25 %	0 %	50 %	25 %	55376242
18	NC_006392	CAGC	2	8	9954	9961	25 %	0 %	25 %	50 %	55376242
19	NC_006392	GTCG	2	8	10439	10446	0 %	25 %	50 %	25 %	55376242
20	NC_006392	TCGT	2	8	11549	11556	0 %	50 %	25 %	25 %	55376244
21	NC_006392	GTTC	2	8	11655	11662	0 %	50 %	25 %	25 %	55376244
22	NC_006392	CAGT	2	8	11818	11825	25 %	25 %	25 %	25 %	55376245
23	NC_006392	GCAG	2	8	12084	12091	25 %	0 %	50 %	25 %	55376245
24	NC_006392	GTCG	2	8	12829	12836	0 %	25 %	50 %	25 %	55376245
25	NC_006392	TAGA	2	8	13510	13517	50 %	25 %	25 %	0 %	55376246
26	NC_006392	CGTT	2	8	14489	14496	0 %	50 %	25 %	25 %	55376248
27	NC_006392	CGAC	2	8	15000	15007	25 %	0 %	25 %	50 %	55376249
28	NC_006392	CGGC	2	8	15085	15092	0 %	0 %	50 %	50 %	55376249
29	NC_006392	AGAA	2	8	15917	15924	75 %	0 %	25 %	0 %	55376251
30	NC_006392	GGAA	2	8	15929	15936	50 %	0 %	50 %	0 %	55376251
31	NC_006392	CTTG	2	8	16483	16490	0 %	50 %	25 %	25 %	55376252
32	NC_006392	CTCA	2	8	16919	16926	25 %	25 %	0 %	50 %	55376253
33	NC_006392	GCCT	2	8	16973	16980	0 %	25 %	25 %	50 %	55376253
34	NC_006392	ATCA	2	8	17129	17136	50 %	25 %	0 %	25 %	55376253
35	NC_006392	ACTC	2	8	17266	17273	25 %	25 %	0 %	50 %	55376253
36	NC_006392	CCAG	2	8	17984	17991	25 %	0 %	25 %	50 %	55376255
37	NC_006392	GCGA	2	8	18358	18365	25 %	0 %	50 %	25 %	55376255
38	NC_006392	TGGA	2	8	18462	18469	25 %	25 %	50 %	0 %	55376255
39	NC_006392	AGGC	2	8	18835	18842	25 %	0 %	50 %	25 %	55376255
40	NC_006392	CAAG	2	8	19049	19056	50 %	0 %	25 %	25 %	55376255
41	NC_006392	CGGA	2	8	19387	19394	25 %	0 %	50 %	25 %	55376255
42	NC_006392	GGCA	2	8	19808	19815	25 %	0 %	50 %	25 %	55376256
43	NC_006392	CAGG	2	8	19881	19888	25 %	0 %	50 %	25 %	55376256
44	NC_006392	TGGC	2	8	20514	20521	0 %	25 %	50 %	25 %	55376258
45	NC_006392	CTCG	2	8	22103	22110	0 %	25 %	25 %	50 %	55376259
46	NC_006392	TCGA	2	8	22391	22398	25 %	25 %	25 %	25 %	55376260
47	NC_006392	CACT	2	8	22401	22408	25 %	25 %	0 %	50 %	55376260
48	NC_006392	GATG	2	8	23144	23151	25 %	25 %	50 %	0 %	55376260
49	NC_006392	TGGC	2	8	24407	24414	0 %	25 %	50 %	25 %	55376261
50	NC_006392	ACCA	2	8	24617	24624	50 %	0 %	0 %	50 %	55376261
51	NC_006392	TCGG	2	8	24959	24966	0 %	25 %	50 %	25 %	55376262
52	NC_006392	GATC	2	8	25180	25187	25 %	25 %	25 %	25 %	55376262
53	NC_006392	GGCC	2	8	25810	25817	0 %	0 %	50 %	50 %	55376263
54	NC_006392	GCTC	2	8	25852	25859	0 %	25 %	25 %	50 %	55376263
55	NC_006392	GTCG	2	8	26233	26240	0 %	25 %	50 %	25 %	55376263
56	NC_006392	AGCC	2	8	26880	26887	25 %	0 %	25 %	50 %	55376263
57	NC_006392	TTTG	2	8	26890	26897	0 %	75 %	25 %	0 %	55376263
58	NC_006392	GCCC	2	8	27052	27059	0 %	0 %	25 %	75 %	55376263
59	NC_006392	GAAC	2	8	27961	27968	50 %	0 %	25 %	25 %	55376263
60	NC_006392	CGTT	2	8	28076	28083	0 %	50 %	25 %	25 %	55376263
61	NC_006392	CATC	2	8	29640	29647	25 %	25 %	0 %	50 %	55376264
62	NC_006392	CGCT	2	8	30572	30579	0 %	25 %	25 %	50 %	55376267
63	NC_006392	GGCC	2	8	30598	30605	0 %	0 %	50 %	50 %	55376267
64	NC_006392	CTTC	2	8	30901	30908	0 %	50 %	0 %	50 %	55376267
65	NC_006392	CGCC	2	8	31255	31262	0 %	0 %	25 %	75 %	55376267
66	NC_006392	GACA	2	8	31536	31543	50 %	0 %	25 %	25 %	55376267
67	NC_006392	GAAC	2	8	32081	32088	50 %	0 %	25 %	25 %	55376267
68	NC_006392	TCCC	2	8	32099	32106	0 %	25 %	0 %	75 %	55376267
69	NC_006392	GGTT	2	8	32167	32174	0 %	50 %	50 %	0 %	55376267
70	NC_006392	CCGA	2	8	32475	32482	25 %	0 %	25 %	50 %	55376267
71	NC_006392	GTCA	2	8	32624	32631	25 %	25 %	25 %	25 %	55376268
72	NC_006392	CCGT	2	8	33095	33102	0 %	25 %	25 %	50 %	55376269
73	NC_006392	GTAC	2	8	33112	33119	25 %	25 %	25 %	25 %	55376269
74	NC_006392	GTCA	2	8	33307	33314	25 %	25 %	25 %	25 %	55376269
75	NC_006392	GGTG	2	8	33925	33932	0 %	25 %	75 %	0 %	55376270
76	NC_006392	AGCG	2	8	34572	34579	25 %	0 %	50 %	25 %	55376271
77	NC_006392	ACGA	2	8	37489	37496	50 %	0 %	25 %	25 %	55376272
78	NC_006392	CACG	2	8	37553	37560	25 %	0 %	25 %	50 %	55376272
79	NC_006392	GCTG	2	8	38142	38149	0 %	25 %	50 %	25 %	55376273
80	NC_006392	GCTC	2	8	38183	38190	0 %	25 %	25 %	50 %	55376273
81	NC_006392	AGGC	2	8	38267	38274	25 %	0 %	50 %	25 %	55376273
82	NC_006392	CGAC	2	8	38345	38352	25 %	0 %	25 %	50 %	55376273
83	NC_006392	GTAC	2	8	39002	39009	25 %	25 %	25 %	25 %	55376273
84	NC_006392	CAGT	2	8	39612	39619	25 %	25 %	25 %	25 %	55376273
85	NC_006392	GACA	2	8	39642	39649	50 %	0 %	25 %	25 %	55376273
86	NC_006392	ATCA	2	8	39951	39958	50 %	25 %	0 %	25 %	55376273
87	NC_006392	GACA	2	8	40237	40244	50 %	0 %	25 %	25 %	55376274
88	NC_006392	ACTC	2	8	40870	40877	25 %	25 %	0 %	50 %	55376274
89	NC_006392	CGGG	2	8	41196	41203	0 %	0 %	75 %	25 %	55376274
90	NC_006392	CGAG	2	8	41499	41506	25 %	0 %	50 %	25 %	55376275
91	NC_006392	CGGT	2	8	41784	41791	0 %	25 %	50 %	25 %	55376275
92	NC_006392	GCGG	2	8	41989	41996	0 %	0 %	75 %	25 %	55376275
93	NC_006392	GACG	2	8	42082	42089	25 %	0 %	50 %	25 %	55376275
94	NC_006392	AGTC	2	8	42926	42933	25 %	25 %	25 %	25 %	55376276
95	NC_006392	GTTC	2	8	43327	43334	0 %	50 %	25 %	25 %	55376276
96	NC_006392	ACCG	2	8	43616	43623	25 %	0 %	25 %	50 %	55376276
97	NC_006392	CGGC	2	8	43910	43917	0 %	0 %	50 %	50 %	55376276
98	NC_006392	GAAC	2	8	44596	44603	50 %	0 %	25 %	25 %	55376276
99	NC_006392	AACG	2	8	44667	44674	50 %	0 %	25 %	25 %	55376276
100	NC_006392	GACA	2	8	44730	44737	50 %	0 %	25 %	25 %	55376277
101	NC_006392	GCGA	2	8	45638	45645	25 %	0 %	50 %	25 %	55376278
102	NC_006392	CTCG	2	8	45977	45984	0 %	25 %	25 %	50 %	55376278
103	NC_006392	CCGA	2	8	46021	46028	25 %	0 %	25 %	50 %	55376278
104	NC_006392	ACGG	2	8	46111	46118	25 %	0 %	50 %	25 %	55376278
105	NC_006392	CACG	2	8	46363	46370	25 %	0 %	25 %	50 %	55376279
106	NC_006392	CAAT	2	8	46436	46443	50 %	25 %	0 %	25 %	55376279

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.