MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG400

Total Repeats: 627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006392	TCG	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376229
2	NC_006392	CGA	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376229
3	NC_006392	GAA	2	6	496	501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376229
4	NC_006392	AGC	2	6	566	571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376229
5	NC_006392	TCA	2	6	588	593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376229
6	NC_006392	CGA	2	6	651	656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376229
7	NC_006392	CTG	2	6	665	670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376229
8	NC_006392	CAG	2	6	680	685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376229
9	NC_006392	GAC	2	6	740	745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376229
10	NC_006392	CGT	2	6	763	768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376229
11	NC_006392	CGA	2	6	790	795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376229
12	NC_006392	GCC	2	6	1575	1580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376230
13	NC_006392	CGC	2	6	1625	1630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376230
14	NC_006392	CAG	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376230
15	NC_006392	CGC	2	6	1678	1683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376230
16	NC_006392	GTC	2	6	1695	1700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376230
17	NC_006392	TCG	2	6	1737	1742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376230
18	NC_006392	CAG	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376230
19	NC_006392	ACG	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376230
20	NC_006392	GCA	2	6	1780	1785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376230
21	NC_006392	CGT	3	9	1837	1845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376230
22	NC_006392	GTC	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376230
23	NC_006392	TCG	2	6	1878	1883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376230
24	NC_006392	TAG	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376230
25	NC_006392	CGG	2	6	2080	2085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376231
26	NC_006392	TCG	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376231
27	NC_006392	CTC	2	6	2234	2239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376231
28	NC_006392	TCA	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376231
29	NC_006392	TGC	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376231
30	NC_006392	CGT	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376231
31	NC_006392	AGT	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376231
32	NC_006392	CTG	2	6	2453	2458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376231
33	NC_006392	GCG	2	6	2484	2489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376231
34	NC_006392	CAG	2	6	2504	2509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376231
35	NC_006392	CCG	2	6	2512	2517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376231
36	NC_006392	CGG	2	6	2520	2525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376231
37	NC_006392	AGC	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376231
38	NC_006392	GAT	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376231
39	NC_006392	TCG	2	6	3084	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376232
40	NC_006392	CAG	2	6	3123	3128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376232
41	NC_006392	CGA	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376232
42	NC_006392	GAC	2	6	3183	3188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376232
43	NC_006392	GTC	2	6	3231	3236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376232
44	NC_006392	CAG	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376232
45	NC_006392	CCG	2	6	3286	3291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376232
46	NC_006392	AAG	2	6	3295	3300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376232
47	NC_006392	ACG	3	9	3307	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376232
48	NC_006392	CAG	2	6	3330	3335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376232
49	NC_006392	CCA	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376232
50	NC_006392	AAC	2	6	3376	3381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376232
51	NC_006392	CGA	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376232
52	NC_006392	ACG	2	6	3680	3685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376233
53	NC_006392	CGC	2	6	3697	3702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376233
54	NC_006392	CTC	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376233
55	NC_006392	CAT	2	6	3732	3737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376233
56	NC_006392	ACA	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376233
57	NC_006392	ACG	2	6	3845	3850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376233
58	NC_006392	CTG	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376233
59	NC_006392	GAG	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376233
60	NC_006392	CGG	2	6	3972	3977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376233
61	NC_006392	TCG	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376233
62	NC_006392	CTG	2	6	4062	4067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376233
63	NC_006392	ACG	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376234
64	NC_006392	CTG	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376234
65	NC_006392	ACG	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376234
66	NC_006392	TGC	2	6	4523	4528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376234
67	NC_006392	TGA	2	6	4547	4552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376234
68	NC_006392	ACC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376235
69	NC_006392	AAC	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376235
70	NC_006392	AGG	2	6	4908	4913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376235
71	NC_006392	CGA	2	6	4968	4973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376235
72	NC_006392	TCG	2	6	5031	5036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376235
73	NC_006392	GTC	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376235
74	NC_006392	TCG	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376236
75	NC_006392	GCT	2	6	5319	5324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376236
76	NC_006392	CCA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376236
77	NC_006392	CAG	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376236
78	NC_006392	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376236
79	NC_006392	GTT	2	6	5476	5481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376236
80	NC_006392	TCT	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376236
81	NC_006392	AGT	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376236
82	NC_006392	TAG	2	6	5574	5579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376236
83	NC_006392	AAG	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376236
84	NC_006392	CTT	2	6	5932	5937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376236
85	NC_006392	TTC	2	6	6050	6055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376236
86	NC_006392	AAG	2	6	6056	6061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376236
87	NC_006392	CGG	2	6	6096	6101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376236
88	NC_006392	ATC	2	6	6125	6130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376236
89	NC_006392	TAG	2	6	6165	6170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376236
90	NC_006392	TGT	2	6	6307	6312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376236
91	NC_006392	GAG	2	6	6462	6467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376237
92	NC_006392	GTC	3	9	6480	6488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376237
93	NC_006392	AGA	2	6	6626	6631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376237
94	NC_006392	AGT	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376237
95	NC_006392	CGA	2	6	6680	6685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376237
96	NC_006392	CAG	2	6	6849	6854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376238
97	NC_006392	AAG	2	6	6886	6891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376238
98	NC_006392	ACT	2	6	6923	6928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376238
99	NC_006392	TGT	2	6	7426	7431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376239
100	NC_006392	GAA	2	6	7544	7549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376239
101	NC_006392	CAT	2	6	7598	7603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376239
102	NC_006392	GCG	2	6	7656	7661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376239
103	NC_006392	ACT	2	6	7818	7823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376239
104	NC_006392	GCT	2	6	7833	7838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376239
105	NC_006392	GCA	2	6	7926	7931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376239
106	NC_006392	GGT	2	6	8036	8041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376239
107	NC_006392	TAC	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376239
108	NC_006392	CCA	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376239
109	NC_006392	TGA	2	6	8197	8202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376239
110	NC_006392	ATG	2	6	8284	8289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376239
111	NC_006392	GCC	2	6	8356	8361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376240
112	NC_006392	TCG	2	6	8459	8464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376240
113	NC_006392	CGA	2	6	8478	8483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376240
114	NC_006392	TGA	2	6	8523	8528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376240
115	NC_006392	TCC	2	6	8537	8542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376240
116	NC_006392	ACA	2	6	8546	8551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376240
117	NC_006392	CTG	2	6	8560	8565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376240
118	NC_006392	ACA	2	6	8636	8641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376240
119	NC_006392	TCG	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376240
120	NC_006392	TCG	2	6	8702	8707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376240
121	NC_006392	ACA	2	6	8753	8758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376240
122	NC_006392	GTC	2	6	8791	8796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376240
123	NC_006392	GGA	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376240
124	NC_006392	ATC	2	6	8902	8907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376240
125	NC_006392	CGA	2	6	8909	8914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376240
126	NC_006392	TCG	2	6	8981	8986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376240
127	NC_006392	CCG	2	6	9005	9010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376240
128	NC_006392	GAC	2	6	9058	9063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376240
129	NC_006392	CTG	2	6	9121	9126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376240
130	NC_006392	GAC	2	6	9159	9164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376241
131	NC_006392	ACT	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376241
132	NC_006392	CAA	2	6	9228	9233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376241
133	NC_006392	CGT	2	6	9253	9258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376241
134	NC_006392	GGA	2	6	9260	9265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376241
135	NC_006392	GAA	2	6	9285	9290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376241
136	NC_006392	CGA	2	6	9362	9367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376241
137	NC_006392	GCT	2	6	9458	9463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376241
138	NC_006392	CGT	2	6	9746	9751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376242
139	NC_006392	GAA	2	6	9865	9870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376242
140	NC_006392	GCG	2	6	9935	9940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376242
141	NC_006392	CCA	2	6	10089	10094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376242
142	NC_006392	ACC	2	6	10101	10106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376242
143	NC_006392	ACG	2	6	10195	10200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376242
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161	NC_006392	TCA	2	6	11924	11929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376245
162	NC_006392	TCG	2	6	12059	12064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376245
163	NC_006392	CAA	2	6	12133	12138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376245
164	NC_006392	CCG	3	9	12160	12168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376245
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224	NC_006392	TTC	2	6	16569	16574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376252
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226	NC_006392	ACT	2	6	16906	16911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376253
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234	NC_006392	AGC	2	6	18550	18555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376255
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237	NC_006392	ACG	2	6	18642	18647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376255
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239	NC_006392	TGG	2	6	18705	18710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376255
240	NC_006392	CGC	2	6	18722	18727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376255
241	NC_006392	GTG	2	6	18826	18831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376255
242	NC_006392	TCG	2	6	18913	18918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376255
243	NC_006392	ACG	2	6	19011	19016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376255
244	NC_006392	CTG	3	9	19195	19203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376255
245	NC_006392	GAT	2	6	19215	19220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376255
246	NC_006392	TCG	2	6	19261	19266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376255
247	NC_006392	CTC	2	6	19440	19445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376255
248	NC_006392	ATC	2	6	19467	19472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376255
249	NC_006392	GCA	2	6	19573	19578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376256
250	NC_006392	TCG	3	9	19585	19593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376256
251	NC_006392	TCG	2	6	19714	19719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376256
252	NC_006392	GCG	2	6	19739	19744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376256
253	NC_006392	CGG	2	6	19766	19771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376256
254	NC_006392	TCA	2	6	19825	19830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376256
255	NC_006392	CAG	2	6	20010	20015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376256
256	NC_006392	GCT	2	6	20133	20138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376257
257	NC_006392	CGA	2	6	20220	20225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376257
258	NC_006392	CGA	2	6	20235	20240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376257
259	NC_006392	CGC	2	6	20412	20417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376258
260	NC_006392	ACC	2	6	20488	20493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376258
261	NC_006392	TCA	2	6	20657	20662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376258
262	NC_006392	GCA	2	6	20744	20749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376258
263	NC_006392	TCA	2	6	20825	20830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376258
264	NC_006392	CCG	2	6	20844	20849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376258
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268	NC_006392	GGA	2	6	21044	21049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376259
269	NC_006392	CGC	2	6	21075	21080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376259
270	NC_006392	CGG	2	6	21090	21095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376259
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272	NC_006392	CAA	2	6	21135	21140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376259
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277	NC_006392	CCG	2	6	21296	21301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376259
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280	NC_006392	GTC	2	6	21345	21350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376259
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284	NC_006392	CGT	2	6	21590	21595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376259
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380	NC_006392	CGA	2	6	29483	29488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376264
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383	NC_006392	CGA	2	6	29605	29610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376264
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496	NC_006392	GGT	2	6	39416	39421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376273
497	NC_006392	CGA	4	12	39447	39458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376273
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499	NC_006392	GCG	2	6	39506	39511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376273
500	NC_006392	GCT	2	6	39531	39536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376273

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