MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG400

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006392	AG	3	6	218	223	50 %	0 %	50 %	0 %	55376229
2	NC_006392	AC	3	6	386	391	50 %	0 %	0 %	50 %	55376229
3	NC_006392	CG	3	6	546	551	0 %	0 %	50 %	50 %	55376229
4	NC_006392	TG	3	6	2167	2172	0 %	50 %	50 %	0 %	55376231
5	NC_006392	GT	3	6	3133	3138	0 %	50 %	50 %	0 %	55376232
6	NC_006392	CA	3	6	4531	4536	50 %	0 %	0 %	50 %	55376234
7	NC_006392	CA	3	6	4955	4960	50 %	0 %	0 %	50 %	55376235
8	NC_006392	GA	3	6	5129	5134	50 %	0 %	50 %	0 %	55376236
9	NC_006392	GA	3	6	5161	5166	50 %	0 %	50 %	0 %	55376236
10	NC_006392	TG	3	6	5943	5948	0 %	50 %	50 %	0 %	55376236
11	NC_006392	GA	3	6	7088	7093	50 %	0 %	50 %	0 %	55376238
12	NC_006392	AT	3	6	7494	7499	50 %	50 %	0 %	0 %	55376239
13	NC_006392	GA	3	6	8010	8015	50 %	0 %	50 %	0 %	55376239
14	NC_006392	AG	3	6	8273	8278	50 %	0 %	50 %	0 %	55376239
15	NC_006392	CA	3	6	8378	8383	50 %	0 %	0 %	50 %	55376240
16	NC_006392	AC	3	6	8440	8445	50 %	0 %	0 %	50 %	55376240
17	NC_006392	CT	3	6	10158	10163	0 %	50 %	0 %	50 %	55376242
18	NC_006392	AC	3	6	11094	11099	50 %	0 %	0 %	50 %	55376244
19	NC_006392	TC	3	6	11283	11288	0 %	50 %	0 %	50 %	55376244
20	NC_006392	GC	3	6	12459	12464	0 %	0 %	50 %	50 %	55376245
21	NC_006392	CG	3	6	12841	12846	0 %	0 %	50 %	50 %	55376245
22	NC_006392	TA	3	6	13032	13037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006392	GC	3	6	13520	13525	0 %	0 %	50 %	50 %	55376246
24	NC_006392	AC	3	6	15127	15132	50 %	0 %	0 %	50 %	55376249
25	NC_006392	AG	3	6	15134	15139	50 %	0 %	50 %	0 %	55376249
26	NC_006392	CG	3	6	15294	15299	0 %	0 %	50 %	50 %	55376249
27	NC_006392	CG	3	6	15658	15663	0 %	0 %	50 %	50 %	55376250
28	NC_006392	GA	3	6	15690	15695	50 %	0 %	50 %	0 %	55376250
29	NC_006392	TA	3	6	15810	15815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006392	GC	3	6	16193	16198	0 %	0 %	50 %	50 %	55376251
31	NC_006392	GA	3	6	16467	16472	50 %	0 %	50 %	0 %	55376252
32	NC_006392	CT	3	6	16863	16868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_006392	CT	3	6	17281	17286	0 %	50 %	0 %	50 %	55376254
34	NC_006392	CG	4	8	17557	17564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_006392	TA	3	6	17664	17669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006392	CA	3	6	17786	17791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006392	GA	3	6	17941	17946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006392	GT	3	6	18857	18862	0 %	50 %	50 %	0 %	55376255
39	NC_006392	GA	3	6	19417	19422	50 %	0 %	50 %	0 %	55376255
40	NC_006392	TC	3	6	19486	19491	0 %	50 %	0 %	50 %	55376255
41	NC_006392	TG	3	6	19618	19623	0 %	50 %	50 %	0 %	55376256
42	NC_006392	AC	3	6	19841	19846	50 %	0 %	0 %	50 %	55376256
43	NC_006392	TG	3	6	20126	20131	0 %	50 %	50 %	0 %	55376257
44	NC_006392	GT	3	6	20229	20234	0 %	50 %	50 %	0 %	55376257
45	NC_006392	AT	3	6	20876	20881	50 %	50 %	0 %	0 %	55376258
46	NC_006392	TC	3	6	21313	21318	0 %	50 %	0 %	50 %	55376259
47	NC_006392	GA	3	6	21466	21471	50 %	0 %	50 %	0 %	55376259
48	NC_006392	GC	3	6	21686	21691	0 %	0 %	50 %	50 %	55376259
49	NC_006392	GT	3	6	23287	23292	0 %	50 %	50 %	0 %	55376260
50	NC_006392	TC	3	6	23335	23340	0 %	50 %	0 %	50 %	55376260
51	NC_006392	GT	3	6	23351	23356	0 %	50 %	50 %	0 %	55376260
52	NC_006392	TG	3	6	23364	23369	0 %	50 %	50 %	0 %	55376260
53	NC_006392	AT	3	6	23427	23432	50 %	50 %	0 %	0 %	55376260
54	NC_006392	GA	3	6	23459	23464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006392	AG	3	6	23562	23567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006392	AC	3	6	23936	23941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006392	AC	3	6	23955	23960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006392	AG	4	8	24399	24406	50 %	0 %	50 %	0 %	55376261
59	NC_006392	CA	3	6	25024	25029	50 %	0 %	0 %	50 %	55376262
60	NC_006392	CT	3	6	25968	25973	0 %	50 %	0 %	50 %	55376263
61	NC_006392	CG	3	6	26246	26251	0 %	0 %	50 %	50 %	55376263
62	NC_006392	TC	3	6	27925	27930	0 %	50 %	0 %	50 %	55376263
63	NC_006392	CT	3	6	28935	28940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006392	GT	3	6	29016	29021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006392	CT	3	6	29070	29075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006392	TG	3	6	29285	29290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006392	CG	3	6	29327	29332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_006392	GT	4	8	30691	30698	0 %	50 %	50 %	0 %	55376267
69	NC_006392	AC	3	6	30892	30897	50 %	0 %	0 %	50 %	55376267
70	NC_006392	GT	3	6	31832	31837	0 %	50 %	50 %	0 %	55376267
71	NC_006392	TG	3	6	32398	32403	0 %	50 %	50 %	0 %	55376267
72	NC_006392	TG	3	6	32457	32462	0 %	50 %	50 %	0 %	55376267
73	NC_006392	CA	3	6	32572	32577	50 %	0 %	0 %	50 %	55376268
74	NC_006392	TG	3	6	33205	33210	0 %	50 %	50 %	0 %	55376269
75	NC_006392	CG	3	6	33448	33453	0 %	0 %	50 %	50 %	55376269
76	NC_006392	TG	3	6	33616	33621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006392	AG	3	6	34156	34161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006392	AC	3	6	34273	34278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006392	CA	3	6	35600	35605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006392	CG	3	6	36131	36136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006392	AG	3	6	36999	37004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006392	CT	3	6	37320	37325	0 %	50 %	0 %	50 %	55376272
83	NC_006392	AC	3	6	39355	39360	50 %	0 %	0 %	50 %	55376273
84	NC_006392	CG	3	6	39695	39700	0 %	0 %	50 %	50 %	55376273
85	NC_006392	GC	3	6	40912	40917	0 %	0 %	50 %	50 %	55376274
86	NC_006392	AT	3	6	41834	41839	50 %	50 %	0 %	0 %	55376275
87	NC_006392	GC	3	6	42216	42221	0 %	0 %	50 %	50 %	55376276
88	NC_006392	CT	3	6	42743	42748	0 %	50 %	0 %	50 %	55376276
89	NC_006392	GC	3	6	43303	43308	0 %	0 %	50 %	50 %	55376276
90	NC_006392	GT	3	6	44028	44033	0 %	50 %	50 %	0 %	55376276
91	NC_006392	GA	3	6	47159	47164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006392	GA	3	6	47629	47634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006392	CG	3	6	47752	47757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_006392	TG	3	6	48559	48564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.