MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG300

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006391	CCGCG	2	10	384	393	0 %	0 %	40 %	60 %	55376188
2	NC_006391	CAAAC	2	10	1784	1793	60 %	0 %	0 %	40 %	55376188
3	NC_006391	CGGCG	2	10	3760	3769	0 %	0 %	60 %	40 %	55376188
4	NC_006391	GGTTC	2	10	7341	7350	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006391	CATCG	2	10	13524	13533	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_006391	ACTGG	2	10	14103	14112	20 %	20 %	40 %	20 %	55376202
7	NC_006391	GAACC	2	10	14284	14293	40 %	0 %	20 %	40 %	55376203
8	NC_006391	CGCAG	2	10	16809	16818	20 %	0 %	40 %	40 %	55376209
9	NC_006391	GACCC	2	10	17264	17273	20 %	0 %	20 %	60 %	55376209
10	NC_006391	AGTGT	2	10	18218	18227	20 %	40 %	40 %	0 %	55376209
11	NC_006391	TGGCA	2	10	20498	20507	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006391	ACGCT	2	10	21221	21230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_006391	AAACC	2	10	21613	21622	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_006391	ATCAC	2	10	24618	24627	40 %	20 %	0 %	40 %	55376211
15	NC_006391	ATCCA	2	10	24726	24735	40 %	20 %	0 %	40 %	55376211
16	NC_006391	GCTGG	2	10	29303	29312	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_006391	CGCCA	2	10	29998	30007	20 %	0 %	20 %	60 %	55376218
18	NC_006391	CGGCA	2	10	35487	35496	20 %	0 %	40 %	40 %	55376224
19	NC_006391	CTGGA	2	10	36084	36093	20 %	20 %	40 %	20 %	55376226
20	NC_006391	CGGAC	2	10	36926	36935	20 %	0 %	40 %	40 %	55376226

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.