MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG300

Total Repeats: 497

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006391	TGA	2	6	160	165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376188
2	NC_006391	AAC	2	6	183	188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
3	NC_006391	GTC	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
4	NC_006391	CGC	2	6	232	237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376188
5	NC_006391	CGA	2	6	313	318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
6	NC_006391	CGA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
7	NC_006391	CGG	2	6	471	476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
8	NC_006391	CGA	2	6	538	543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
9	NC_006391	CGT	2	6	616	621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
10	NC_006391	AAG	2	6	654	659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376188
11	NC_006391	CGA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
12	NC_006391	CGG	2	6	727	732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
13	NC_006391	CGA	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
14	NC_006391	ACG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
15	NC_006391	ACG	2	6	968	973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
16	NC_006391	CAA	2	6	1080	1085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
17	NC_006391	CGA	2	6	1128	1133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
18	NC_006391	AAC	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
19	NC_006391	GTC	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
20	NC_006391	CAA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
21	NC_006391	GTG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376188
22	NC_006391	TCA	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
23	NC_006391	CTG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
24	NC_006391	ACG	2	6	1737	1742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
25	NC_006391	GCA	2	6	1745	1750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
26	NC_006391	CAG	2	6	1809	1814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
27	NC_006391	CAA	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
28	NC_006391	GCG	2	6	2136	2141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
29	NC_006391	GAC	2	6	2254	2259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
30	NC_006391	ACG	2	6	2292	2297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
31	NC_006391	TCG	2	6	2391	2396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
32	NC_006391	TCA	3	9	2466	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
33	NC_006391	GAC	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
34	NC_006391	AGC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
35	NC_006391	AAC	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
36	NC_006391	CGT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
37	NC_006391	ACC	2	6	2637	2642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376188
38	NC_006391	GAC	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
39	NC_006391	CAT	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
40	NC_006391	CGG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
41	NC_006391	CGG	2	6	2887	2892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
42	NC_006391	CGG	2	6	3105	3110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
43	NC_006391	CCA	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376188
44	NC_006391	ACA	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
45	NC_006391	GGT	2	6	3445	3450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376188
46	NC_006391	CGG	2	6	3487	3492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
47	NC_006391	CGA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
48	NC_006391	TCG	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
49	NC_006391	GCC	2	6	3582	3587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376188
50	NC_006391	GCC	2	6	3641	3646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376188
51	NC_006391	CGG	2	6	3664	3669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
52	NC_006391	TCG	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
53	NC_006391	GTC	2	6	3686	3691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
54	NC_006391	TGG	2	6	3774	3779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376188
55	NC_006391	ACG	2	6	3890	3895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
56	NC_006391	CTG	2	6	3962	3967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
57	NC_006391	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
58	NC_006391	GAC	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
59	NC_006391	ATC	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
60	NC_006391	GGC	2	6	4109	4114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
61	NC_006391	GAC	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
62	NC_006391	CGT	2	6	4499	4504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376189
63	NC_006391	CGG	2	6	4508	4513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376189
64	NC_006391	ATC	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376189
65	NC_006391	TGG	2	6	4552	4557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376189
66	NC_006391	GAT	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376189
67	NC_006391	GAC	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376190
68	NC_006391	GGC	2	6	4780	4785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376190
69	NC_006391	TGG	2	6	4824	4829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376190
70	NC_006391	ACG	2	6	4839	4844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376190
71	NC_006391	AGG	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376190
72	NC_006391	CGA	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376190
73	NC_006391	GGA	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376190
74	NC_006391	CAG	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
75	NC_006391	CTG	2	6	5321	5326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376191
76	NC_006391	AGC	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
77	NC_006391	CAC	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376191
78	NC_006391	GTC	2	6	5464	5469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376191
79	NC_006391	CCT	2	6	5556	5561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376191
80	NC_006391	GAT	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376191
81	NC_006391	ATC	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376191
82	NC_006391	CAG	3	9	5735	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
83	NC_006391	CTG	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376191
84	NC_006391	GTA	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376191
85	NC_006391	GAC	2	6	5800	5805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
86	NC_006391	CGA	2	6	6004	6009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376193
87	NC_006391	TCG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376193
88	NC_006391	CTG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376193
89	NC_006391	TGC	2	6	7380	7385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376194
90	NC_006391	GTC	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376194
91	NC_006391	TGT	2	6	7440	7445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376194
92	NC_006391	CTG	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376195
93	NC_006391	TTG	2	6	8024	8029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376195
94	NC_006391	ACA	2	6	8080	8085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376195
95	NC_006391	TCA	2	6	8107	8112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376195
96	NC_006391	GAT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376195
97	NC_006391	AAC	2	6	8172	8177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376195
98	NC_006391	CGA	2	6	8475	8480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376195
99	NC_006391	ACA	2	6	8581	8586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376195
100	NC_006391	AAT	2	6	8622	8627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376195
101	NC_006391	CCA	2	6	8668	8673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376195
102	NC_006391	CAA	2	6	8738	8743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376195
103	NC_006391	ACT	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376195
104	NC_006391	ATT	2	6	8890	8895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376195
105	NC_006391	GCT	2	6	8896	8901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376195
106	NC_006391	AGA	2	6	8907	8912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376195
107	NC_006391	CAG	2	6	8918	8923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376195
108	NC_006391	TCG	2	6	9120	9125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376196
109	NC_006391	CAG	2	6	9190	9195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376196
110	NC_006391	CCG	2	6	9281	9286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376196
111	NC_006391	CGA	2	6	9423	9428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376196
112	NC_006391	CGA	2	6	9447	9452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376196
113	NC_006391	GTC	2	6	9520	9525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376196
114	NC_006391	GAT	2	6	9532	9537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376196
115	NC_006391	TCG	2	6	9581	9586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376196
116	NC_006391	CGA	2	6	9618	9623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376196
117	NC_006391	GCC	2	6	9754	9759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376196
118	NC_006391	CGA	2	6	9807	9812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376196
119	NC_006391	CAT	2	6	9871	9876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376196
120	NC_006391	GAC	2	6	10434	10439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376197
121	NC_006391	AGT	2	6	10478	10483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376198
122	NC_006391	GTT	2	6	10497	10502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376198
123	NC_006391	CAT	2	6	10664	10669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376198
124	NC_006391	CGA	2	6	10736	10741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376198
125	NC_006391	CGG	2	6	11244	11249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376199
126	NC_006391	CGT	2	6	11291	11296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376199
127	NC_006391	CGG	2	6	11310	11315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376199
128	NC_006391	CGT	2	6	11316	11321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376199
129	NC_006391	CGG	2	6	11330	11335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376199
130	NC_006391	GGC	2	6	11361	11366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376199
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254	NC_006391	GAT	3	9	24020	24028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376211
255	NC_006391	GTC	2	6	24071	24076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376211
256	NC_006391	GTG	2	6	24102	24107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376211
257	NC_006391	GAC	2	6	24167	24172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376211
258	NC_006391	CTG	2	6	24321	24326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376211
259	NC_006391	GAT	2	6	24341	24346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376211
260	NC_006391	CCA	2	6	24361	24366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376211
261	NC_006391	CTG	2	6	24414	24419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376211
262	NC_006391	GAT	2	6	24437	24442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376211
263	NC_006391	GTC	2	6	24461	24466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376211
264	NC_006391	GAC	2	6	24467	24472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376211
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269	NC_006391	GTG	2	6	25095	25100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376212
270	NC_006391	GTC	2	6	25117	25122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
271	NC_006391	CTT	2	6	25158	25163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376212
272	NC_006391	GTC	2	6	25256	25261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
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274	NC_006391	GTC	2	6	25619	25624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
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277	NC_006391	CGA	2	6	25692	25697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376212
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279	NC_006391	TGT	2	6	25896	25901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376212
280	NC_006391	CGA	2	6	25923	25928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376212
281	NC_006391	GAC	2	6	25981	25986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376212
282	NC_006391	CGG	2	6	26029	26034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376212
283	NC_006391	CTT	2	6	26080	26085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376212
284	NC_006391	GAA	2	6	26092	26097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376212
285	NC_006391	TCG	2	6	26225	26230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
286	NC_006391	TCG	2	6	26315	26320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
287	NC_006391	AGG	2	6	27164	27169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376213
288	NC_006391	GAC	2	6	27179	27184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376213
289	NC_006391	ATC	2	6	27214	27219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376213
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291	NC_006391	TCG	2	6	27238	27243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376213
292	NC_006391	ACG	2	6	27295	27300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376213
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322	NC_006391	CTG	2	6	28600	28605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376215
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341	NC_006391	TCG	2	6	30218	30223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
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370	NC_006391	TTG	2	6	32110	32115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376221
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375	NC_006391	CGG	2	6	32385	32390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376221
376	NC_006391	TCG	2	6	32400	32405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376221
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378	NC_006391	CTG	2	6	32438	32443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376221
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382	NC_006391	GAC	2	6	32692	32697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376222
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