MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG300

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006391	CG	4	8	87	94	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006391	AG	3	6	1093	1098	50 %	0 %	50 %	0 %	55376188
3	NC_006391	CA	3	6	1104	1109	50 %	0 %	0 %	50 %	55376188
4	NC_006391	CA	3	6	1570	1575	50 %	0 %	0 %	50 %	55376188
5	NC_006391	AT	3	6	1827	1832	50 %	50 %	0 %	0 %	55376188
6	NC_006391	CA	3	6	2010	2015	50 %	0 %	0 %	50 %	55376188
7	NC_006391	TC	3	6	2706	2711	0 %	50 %	0 %	50 %	55376188
8	NC_006391	CG	3	6	3600	3605	0 %	0 %	50 %	50 %	55376188
9	NC_006391	CG	3	6	4049	4054	0 %	0 %	50 %	50 %	55376188
10	NC_006391	GC	3	6	4585	4590	0 %	0 %	50 %	50 %	55376189
11	NC_006391	AC	3	6	5507	5512	50 %	0 %	0 %	50 %	55376191
12	NC_006391	AT	3	6	5968	5973	50 %	50 %	0 %	0 %	55376193
13	NC_006391	GC	3	6	6106	6111	0 %	0 %	50 %	50 %	55376193
14	NC_006391	CG	3	6	6275	6280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006391	TC	3	6	6315	6320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006391	AC	3	6	8546	8551	50 %	0 %	0 %	50 %	55376195
17	NC_006391	TA	3	6	9048	9053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006391	CA	3	6	9270	9275	50 %	0 %	0 %	50 %	55376196
19	NC_006391	AG	3	6	10491	10496	50 %	0 %	50 %	0 %	55376198
20	NC_006391	CG	3	6	11430	11435	0 %	0 %	50 %	50 %	55376199
21	NC_006391	AT	3	6	11889	11894	50 %	50 %	0 %	0 %	55376199
22	NC_006391	AG	3	6	12084	12089	50 %	0 %	50 %	0 %	55376199
23	NC_006391	AT	3	6	12475	12480	50 %	50 %	0 %	0 %	55376199
24	NC_006391	AC	3	6	13271	13276	50 %	0 %	0 %	50 %	55376201
25	NC_006391	CA	3	6	13387	13392	50 %	0 %	0 %	50 %	55376201
26	NC_006391	AG	3	6	13651	13656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006391	AC	3	6	14533	14538	50 %	0 %	0 %	50 %	55376203
28	NC_006391	TG	3	6	14903	14908	0 %	50 %	50 %	0 %	55376204
29	NC_006391	CG	3	6	15280	15285	0 %	0 %	50 %	50 %	55376205
30	NC_006391	GA	3	6	15392	15397	50 %	0 %	50 %	0 %	55376205
31	NC_006391	GC	3	6	15659	15664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006391	TG	3	6	15758	15763	0 %	50 %	50 %	0 %	55376207
33	NC_006391	CG	3	6	15821	15826	0 %	0 %	50 %	50 %	55376207
34	NC_006391	AC	3	6	16268	16273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_006391	AG	3	6	16500	16505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006391	AG	3	6	16635	16640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006391	CG	3	6	16870	16875	0 %	0 %	50 %	50 %	55376209
38	NC_006391	GA	3	6	17645	17650	50 %	0 %	50 %	0 %	55376209
39	NC_006391	TG	3	6	18545	18550	0 %	50 %	50 %	0 %	55376209
40	NC_006391	CG	3	6	19324	19329	0 %	0 %	50 %	50 %	55376209
41	NC_006391	AG	3	6	19602	19607	50 %	0 %	50 %	0 %	55376209
42	NC_006391	GA	3	6	24849	24854	50 %	0 %	50 %	0 %	55376211
43	NC_006391	GA	3	6	25087	25092	50 %	0 %	50 %	0 %	55376212
44	NC_006391	GT	4	8	25420	25427	0 %	50 %	50 %	0 %	55376212
45	NC_006391	AG	3	6	26268	26273	50 %	0 %	50 %	0 %	55376212
46	NC_006391	TC	3	6	26646	26651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006391	TG	3	6	26955	26960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006391	TA	3	6	27004	27009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006391	AC	3	6	27322	27327	50 %	0 %	0 %	50 %	55376213
50	NC_006391	AG	3	6	28380	28385	50 %	0 %	50 %	0 %	55376214
51	NC_006391	TC	3	6	28455	28460	0 %	50 %	0 %	50 %	55376214
52	NC_006391	TC	3	6	28836	28841	0 %	50 %	0 %	50 %	55376215
53	NC_006391	CG	4	8	29182	29189	0 %	0 %	50 %	50 %	55376216
54	NC_006391	GC	3	6	32778	32783	0 %	0 %	50 %	50 %	55376222
55	NC_006391	GC	3	6	34485	34490	0 %	0 %	50 %	50 %	55376223
56	NC_006391	GC	3	6	35342	35347	0 %	0 %	50 %	50 %	55376224
57	NC_006391	GA	3	6	35769	35774	50 %	0 %	50 %	0 %	55376225
58	NC_006391	CG	3	6	35903	35908	0 %	0 %	50 %	50 %	55376225
59	NC_006391	CA	3	6	36250	36255	50 %	0 %	0 %	50 %	55376226
60	NC_006391	CG	3	6	37548	37553	0 %	0 %	50 %	50 %	55376226
61	NC_006391	GT	3	6	38121	38126	0 %	50 %	50 %	0 %	55376227
62	NC_006391	CG	3	6	39215	39220	0 %	0 %	50 %	50 %	55376227
63	NC_006391	GC	3	6	39419	39424	0 %	0 %	50 %	50 %	55376227

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.