MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG200

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006390	TTCC	2	8	1114	1121	0 %	50 %	0 %	50 %	55376146
2	NC_006390	GAAC	2	8	2010	2017	50 %	0 %	25 %	25 %	55376147
3	NC_006390	CAGA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	55376148
4	NC_006390	GTCG	2	8	2833	2840	0 %	25 %	50 %	25 %	55376149
5	NC_006390	GTCG	2	8	2933	2940	0 %	25 %	50 %	25 %	55376149
6	NC_006390	CACT	2	8	3250	3257	25 %	25 %	0 %	50 %	55376150
7	NC_006390	GATA	2	8	3383	3390	50 %	25 %	25 %	0 %	55376150
8	NC_006390	ATCT	2	8	3408	3415	25 %	50 %	0 %	25 %	55376150
9	NC_006390	CACT	2	8	4160	4167	25 %	25 %	0 %	50 %	55376151
10	NC_006390	CCCG	2	8	5013	5020	0 %	0 %	25 %	75 %	55376152
11	NC_006390	GTGG	2	8	5924	5931	0 %	25 %	75 %	0 %	55376154
12	NC_006390	GTCG	2	8	6251	6258	0 %	25 %	50 %	25 %	55376154
13	NC_006390	CACT	2	8	6388	6395	25 %	25 %	0 %	50 %	55376155
14	NC_006390	CAGT	2	8	6539	6546	25 %	25 %	25 %	25 %	55376155
15	NC_006390	GGGT	2	8	6719	6726	0 %	25 %	75 %	0 %	55376155
16	NC_006390	TTCT	2	8	7482	7489	0 %	75 %	0 %	25 %	55376156
17	NC_006390	GGTG	2	8	8269	8276	0 %	25 %	75 %	0 %	55376157
18	NC_006390	ACGC	2	8	8516	8523	25 %	0 %	25 %	50 %	55376158
19	NC_006390	CTGA	2	8	9087	9094	25 %	25 %	25 %	25 %	55376158
20	NC_006390	TGGT	2	8	11893	11900	0 %	50 %	50 %	0 %	55376162
21	NC_006390	GCCA	2	8	12299	12306	25 %	0 %	25 %	50 %	55376162
22	NC_006390	CGGA	2	8	14138	14145	25 %	0 %	50 %	25 %	55376164
23	NC_006390	CAGC	2	8	14890	14897	25 %	0 %	25 %	50 %	55376165
24	NC_006390	GCAA	2	8	15055	15062	50 %	0 %	25 %	25 %	55376165
25	NC_006390	AGCA	2	8	15608	15615	50 %	0 %	25 %	25 %	55376165
26	NC_006390	GTCG	2	8	15950	15957	0 %	25 %	50 %	25 %	55376165
27	NC_006390	TCCA	2	8	16085	16092	25 %	25 %	0 %	50 %	55376165
28	NC_006390	CTGC	2	8	16528	16535	0 %	25 %	25 %	50 %	55376165
29	NC_006390	AGCC	2	8	16624	16631	25 %	0 %	25 %	50 %	55376165
30	NC_006390	GCAA	2	8	16839	16846	50 %	0 %	25 %	25 %	55376165
31	NC_006390	GAGT	2	8	16920	16927	25 %	25 %	50 %	0 %	55376165
32	NC_006390	CACG	2	8	17080	17087	25 %	0 %	25 %	50 %	55376165
33	NC_006390	ATGA	2	8	17161	17168	50 %	25 %	25 %	0 %	55376165
34	NC_006390	CGCC	2	8	17336	17343	0 %	0 %	25 %	75 %	55376165
35	NC_006390	CGCC	2	8	18777	18784	0 %	0 %	25 %	75 %	55376168
36	NC_006390	TTCG	2	8	19040	19047	0 %	50 %	25 %	25 %	55376169
37	NC_006390	AGCG	2	8	19165	19172	25 %	0 %	50 %	25 %	55376169
38	NC_006390	CGGT	2	8	19362	19369	0 %	25 %	50 %	25 %	55376170
39	NC_006390	ATAA	2	8	20550	20557	75 %	25 %	0 %	0 %	55376172
40	NC_006390	CCGC	2	8	20781	20788	0 %	0 %	25 %	75 %	55376173
41	NC_006390	GACG	2	8	20887	20894	25 %	0 %	50 %	25 %	55376173
42	NC_006390	GCTC	2	8	22051	22058	0 %	25 %	25 %	50 %	55376174
43	NC_006390	CGAG	2	8	22703	22710	25 %	0 %	50 %	25 %	55376175
44	NC_006390	GTCA	2	8	23465	23472	25 %	25 %	25 %	25 %	55376176
45	NC_006390	GCGG	2	8	23618	23625	0 %	0 %	75 %	25 %	55376176
46	NC_006390	AGTC	2	8	24292	24299	25 %	25 %	25 %	25 %	55376176
47	NC_006390	CAGA	2	8	24942	24949	50 %	0 %	25 %	25 %	55376176
48	NC_006390	CTAT	2	8	25057	25064	25 %	50 %	0 %	25 %	55376176
49	NC_006390	CGAG	2	8	25141	25148	25 %	0 %	50 %	25 %	55376176
50	NC_006390	GCTC	2	8	25246	25253	0 %	25 %	25 %	50 %	55376176
51	NC_006390	CGGG	2	8	25582	25589	0 %	0 %	75 %	25 %	55376176
52	NC_006390	TTGA	2	8	25764	25771	25 %	50 %	25 %	0 %	55376176
53	NC_006390	TCAC	2	8	26376	26383	25 %	25 %	0 %	50 %	55376178
54	NC_006390	CAGA	2	8	26804	26811	50 %	0 %	25 %	25 %	55376178
55	NC_006390	CCGA	2	8	27152	27159	25 %	0 %	25 %	50 %	55376178
56	NC_006390	AATG	2	8	28089	28096	50 %	25 %	25 %	0 %	55376179
57	NC_006390	TGGT	2	8	28167	28174	0 %	50 %	50 %	0 %	55376180
58	NC_006390	TCGC	2	8	28672	28679	0 %	25 %	25 %	50 %	55376180
59	NC_006390	GCGG	2	8	29612	29619	0 %	0 %	75 %	25 %	55376181
60	NC_006390	CCGA	2	8	30098	30105	25 %	0 %	25 %	50 %	55376181
61	NC_006390	CAAC	2	8	31067	31074	50 %	0 %	0 %	50 %	55376184
62	NC_006390	AGCG	2	8	31096	31103	25 %	0 %	50 %	25 %	55376184
63	NC_006390	TCAC	2	8	31117	31124	25 %	25 %	0 %	50 %	55376184
64	NC_006390	GCCC	2	8	31497	31504	0 %	0 %	25 %	75 %	55376185
65	NC_006390	TCCA	2	8	32820	32827	25 %	25 %	0 %	50 %	55376186
66	NC_006390	GTCG	2	8	33173	33180	0 %	25 %	50 %	25 %	55376186

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.