MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG200

Total Repeats: 502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006390	CAC	2	6	31	36	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_006390	TCG	2	6	42	47	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006390	CGC	2	6	70	75	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_006390	AGG	2	6	441	446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376145
5	NC_006390	CCG	2	6	447	452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376145
6	NC_006390	CGA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376145
7	NC_006390	CCA	2	6	557	562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376145
8	NC_006390	GTG	2	6	607	612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376145
9	NC_006390	CCG	2	6	618	623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376145
10	NC_006390	GAG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376145
11	NC_006390	CGA	2	6	724	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376145
12	NC_006390	GTA	3	9	758	766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006390	CGG	2	6	780	785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006390	TGA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006390	GCT	2	6	963	968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006390	CGT	2	6	1032	1037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006390	CAG	2	6	1058	1063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006390	GAG	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376146
19	NC_006390	CCA	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376146
20	NC_006390	GAA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376146
21	NC_006390	AGC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376146
22	NC_006390	TGT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376146
23	NC_006390	CGG	2	6	1584	1589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006390	CTG	2	6	1730	1735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376147
25	NC_006390	GAA	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376147
26	NC_006390	CGA	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376147
27	NC_006390	AAG	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376147
28	NC_006390	ACA	2	6	2018	2023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376147
29	NC_006390	GCA	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376147
30	NC_006390	CTC	2	6	2173	2178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376147
31	NC_006390	CGA	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376147
32	NC_006390	GTG	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376147
33	NC_006390	GGT	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376147
34	NC_006390	CGC	2	6	2235	2240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376147
35	NC_006390	GAG	2	6	2269	2274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376147
36	NC_006390	CTG	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006390	TCC	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376148
38	NC_006390	TGC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376148
39	NC_006390	ACG	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376148
40	NC_006390	CTT	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376148
41	NC_006390	TGG	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376148
42	NC_006390	TCT	2	6	2665	2670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376148
43	NC_006390	ACG	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376148
44	NC_006390	GTA	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376149
45	NC_006390	GTC	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
46	NC_006390	GTT	2	6	2787	2792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376149
47	NC_006390	CTG	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
48	NC_006390	TGC	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
49	NC_006390	GCT	2	6	2982	2987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
50	NC_006390	GTA	2	6	3082	3087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006390	TAA	2	6	3103	3108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006390	TGC	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006390	TGC	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376150
54	NC_006390	CAC	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376150
55	NC_006390	CGA	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376150
56	NC_006390	CAA	2	6	3347	3352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376150
57	NC_006390	CTT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376150
58	NC_006390	TAC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006390	TCA	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006390	AGA	2	6	3592	3597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006390	CAC	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
62	NC_006390	CAG	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
63	NC_006390	CAC	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
64	NC_006390	CGA	2	6	3885	3890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
65	NC_006390	CGA	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
66	NC_006390	CAG	2	6	3972	3977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
67	NC_006390	GTC	2	6	4195	4200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376151
68	NC_006390	TGA	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376151
69	NC_006390	ACC	3	9	4243	4251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
70	NC_006390	CGA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
71	NC_006390	CAC	2	6	4290	4295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
72	NC_006390	GAC	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
73	NC_006390	AGG	2	6	4469	4474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376151
74	NC_006390	CGT	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376151
75	NC_006390	CGA	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
76	NC_006390	CTC	2	6	4690	4695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376151
77	NC_006390	GAT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376152
78	NC_006390	TCG	3	9	4868	4876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376152
79	NC_006390	GAT	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376152
80	NC_006390	GAT	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376152
81	NC_006390	AGC	2	6	4986	4991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
82	NC_006390	TCG	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376152
83	NC_006390	CGA	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
84	NC_006390	GTT	2	6	5107	5112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376152
85	NC_006390	GAC	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
86	NC_006390	GAA	2	6	5272	5277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376152
87	NC_006390	CGA	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
88	NC_006390	CAG	2	6	5342	5347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
89	NC_006390	GAC	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
90	NC_006390	TAC	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376152
91	NC_006390	CGG	2	6	5606	5611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376153
92	NC_006390	TAG	2	6	5755	5760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006390	AAC	2	6	5830	5835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006390	GCT	2	6	5854	5859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376154
95	NC_006390	TGA	2	6	5934	5939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376154
96	NC_006390	TGG	2	6	5970	5975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376154
97	NC_006390	ATC	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376154
98	NC_006390	AGT	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376154
99	NC_006390	CAG	2	6	6452	6457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376155
100	NC_006390	TCT	2	6	6499	6504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376155
101	NC_006390	TGA	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376155
102	NC_006390	TCG	2	6	6547	6552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376155
103	NC_006390	TCC	2	6	6769	6774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376155
104	NC_006390	CTG	2	6	6777	6782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376155
105	NC_006390	CCA	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_006390	TGA	2	6	7051	7056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006390	CTT	2	6	7132	7137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006390	CGA	2	6	7340	7345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376156
109	NC_006390	TCT	2	6	7367	7372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376156
110	NC_006390	TCG	2	6	7441	7446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376156
111	NC_006390	TCA	2	6	7450	7455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376156
112	NC_006390	CTC	2	6	7468	7473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376156
113	NC_006390	TTC	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376156
114	NC_006390	GTC	2	6	7581	7586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376156
115	NC_006390	TCG	2	6	7624	7629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376156
116	NC_006390	TCG	2	6	7633	7638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376156
117	NC_006390	GCC	2	6	7680	7685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376157
118	NC_006390	CGT	2	6	7702	7707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
119	NC_006390	GCT	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
120	NC_006390	GAT	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376157
121	NC_006390	TGC	2	6	7821	7826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
122	NC_006390	TCG	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
123	NC_006390	TGG	2	6	8021	8026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376157
124	NC_006390	ATC	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376157
125	NC_006390	TCG	2	6	8163	8168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
126	NC_006390	ACG	2	6	8175	8180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376157
127	NC_006390	CCG	2	6	8334	8339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376157
128	NC_006390	TCG	2	6	8356	8361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376157
129	NC_006390	GTT	2	6	8589	8594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376158
130	NC_006390	TGA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376158
131	NC_006390	TGC	2	6	8841	8846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376158
132	NC_006390	GAT	2	6	8854	8859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376158
133	NC_006390	AAC	2	6	8910	8915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376158
134	NC_006390	CAA	2	6	8925	8930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376158
135	NC_006390	ACA	2	6	8954	8959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376158
136	NC_006390	AGC	2	6	8968	8973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376158
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138	NC_006390	AGT	2	6	9040	9045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376158
139	NC_006390	TAC	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006390	CTT	2	6	9303	9308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_006390	CCG	2	6	9327	9332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_006390	CTG	2	6	9454	9459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_006390	GTT	2	6	9551	9556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376159
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147	NC_006390	TGG	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376159
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151	NC_006390	TGA	2	6	9838	9843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376159
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155	NC_006390	GGC	2	6	10132	10137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_006390	CTG	2	6	10193	10198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_006390	CAG	2	6	10257	10262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_006390	GTA	2	6	10335	10340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376160
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160	NC_006390	AAG	2	6	10554	10559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_006390	ATA	2	6	10614	10619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_006390	TTG	2	6	10725	10730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_006390	CTT	2	6	10825	10830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376161
165	NC_006390	CTT	2	6	10879	10884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376161
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174	NC_006390	TGT	2	6	11461	11466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376161
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257	NC_006390	CTC	2	6	16433	16438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376165
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262	NC_006390	GGC	2	6	16861	16866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376165
263	NC_006390	GCA	2	6	16939	16944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376165
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265	NC_006390	CAG	2	6	16961	16966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376165
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278	NC_006390	TCT	2	6	17733	17738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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