MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG200

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006390	GT	3	6	1867	1872	0 %	50 %	50 %	0 %	55376147
2	NC_006390	CG	3	6	2068	2073	0 %	0 %	50 %	50 %	55376147
3	NC_006390	TG	3	6	2958	2963	0 %	50 %	50 %	0 %	55376149
4	NC_006390	TG	3	6	3286	3291	0 %	50 %	50 %	0 %	55376150
5	NC_006390	TC	3	6	3320	3325	0 %	50 %	0 %	50 %	55376150
6	NC_006390	TG	3	6	3599	3604	0 %	50 %	50 %	0 %	55376151
7	NC_006390	TG	3	6	5999	6004	0 %	50 %	50 %	0 %	55376154
8	NC_006390	TG	3	6	8169	8174	0 %	50 %	50 %	0 %	55376157
9	NC_006390	TC	3	6	9000	9005	0 %	50 %	0 %	50 %	55376158
10	NC_006390	CT	3	6	10447	10452	0 %	50 %	0 %	50 %	55376160
11	NC_006390	TC	3	6	10455	10460	0 %	50 %	0 %	50 %	55376160
12	NC_006390	GA	3	6	10782	10787	50 %	0 %	50 %	0 %	55376161
13	NC_006390	GA	3	6	10834	10839	50 %	0 %	50 %	0 %	55376161
14	NC_006390	TC	3	6	11571	11576	0 %	50 %	0 %	50 %	55376161
15	NC_006390	AT	3	6	12361	12366	50 %	50 %	0 %	0 %	55376162
16	NC_006390	CA	3	6	12693	12698	50 %	0 %	0 %	50 %	55376162
17	NC_006390	AG	3	6	12809	12814	50 %	0 %	50 %	0 %	55376162
18	NC_006390	TC	3	6	15418	15423	0 %	50 %	0 %	50 %	55376165
19	NC_006390	TC	4	8	16437	16444	0 %	50 %	0 %	50 %	55376165
20	NC_006390	CG	3	6	16706	16711	0 %	0 %	50 %	50 %	55376165
21	NC_006390	CT	3	6	16775	16780	0 %	50 %	0 %	50 %	55376165
22	NC_006390	CG	3	6	16978	16983	0 %	0 %	50 %	50 %	55376165
23	NC_006390	GA	3	6	17062	17067	50 %	0 %	50 %	0 %	55376165
24	NC_006390	AG	3	6	17422	17427	50 %	0 %	50 %	0 %	55376165
25	NC_006390	CA	3	6	18281	18286	50 %	0 %	0 %	50 %	55376167
26	NC_006390	TG	3	6	18489	18494	0 %	50 %	50 %	0 %	55376168
27	NC_006390	TG	3	6	18604	18609	0 %	50 %	50 %	0 %	55376168
28	NC_006390	AC	3	6	19084	19089	50 %	0 %	0 %	50 %	55376169
29	NC_006390	CA	3	6	19414	19419	50 %	0 %	0 %	50 %	55376170
30	NC_006390	CG	3	6	19795	19800	0 %	0 %	50 %	50 %	55376171
31	NC_006390	GT	4	8	20015	20022	0 %	50 %	50 %	0 %	55376171
32	NC_006390	GA	3	6	21962	21967	50 %	0 %	50 %	0 %	55376174
33	NC_006390	GT	3	6	22917	22922	0 %	50 %	50 %	0 %	55376175
34	NC_006390	GA	3	6	23356	23361	50 %	0 %	50 %	0 %	55376176
35	NC_006390	TC	3	6	23834	23839	0 %	50 %	0 %	50 %	55376176
36	NC_006390	CT	3	6	24276	24281	0 %	50 %	0 %	50 %	55376176
37	NC_006390	TG	3	6	24782	24787	0 %	50 %	50 %	0 %	55376176
38	NC_006390	TG	3	6	25495	25500	0 %	50 %	50 %	0 %	55376176
39	NC_006390	TC	3	6	25531	25536	0 %	50 %	0 %	50 %	55376176
40	NC_006390	AC	3	6	26789	26794	50 %	0 %	0 %	50 %	55376178
41	NC_006390	AC	3	6	27201	27206	50 %	0 %	0 %	50 %	55376178
42	NC_006390	AT	3	6	28120	28125	50 %	50 %	0 %	0 %	55376179
43	NC_006390	GT	3	6	28916	28921	0 %	50 %	50 %	0 %	55376180
44	NC_006390	CG	4	8	31596	31603	0 %	0 %	50 %	50 %	55376185
45	NC_006390	AC	3	6	32427	32432	50 %	0 %	0 %	50 %	55376186

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.