MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG100

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006389	CTGAG	2	10	256	265	20 %	20 %	40 %	20 %	55376108
2	NC_006389	GTCTG	2	10	1197	1206	0 %	40 %	40 %	20 %	55376109
3	NC_006389	GTGTC	2	10	1477	1486	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_006389	GACCG	2	10	2975	2984	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_006389	GGGCC	2	10	4468	4477	0 %	0 %	60 %	40 %	55376112
6	NC_006389	GGATC	2	10	8064	8073	20 %	20 %	40 %	20 %	55376116
7	NC_006389	ATTCT	2	10	8676	8685	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_006389	GGGTA	2	10	10070	10079	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006389	ACGGA	2	10	10339	10348	40 %	0 %	40 %	20 %	55376118
10	NC_006389	ACTCA	2	10	10424	10433	40 %	20 %	0 %	40 %	55376118
11	NC_006389	GGGGT	2	10	10517	10526	0 %	20 %	80 %	0 %	55376118
12	NC_006389	CCAAC	2	10	11439	11448	40 %	0 %	0 %	60 %	55376120
13	NC_006389	TCGCT	2	10	12459	12468	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_006389	CGGAC	2	10	15925	15934	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_006389	GAGCA	2	10	18399	18408	40 %	0 %	40 %	20 %	55376127
16	NC_006389	TGTAG	2	10	19409	19418	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006389	CAGAT	2	10	20342	20351	40 %	20 %	20 %	20 %	55376130
18	NC_006389	CCGAG	2	10	21710	21719	20 %	0 %	40 %	40 %	55376131
19	NC_006389	ATCTC	2	10	23519	23528	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_006389	TCATC	2	10	24137	24146	20 %	40 %	0 %	40 %	55376133
21	NC_006389	ATTTT	2	10	24665	24674	20 %	80 %	0 %	0 %	55376133
22	NC_006389	TCCAG	2	10	24869	24878	20 %	20 %	20 %	40 %	55376133
23	NC_006389	GGGTG	2	10	24995	25004	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006389	GCCCA	2	10	26647	26656	20 %	0 %	20 %	60 %	55376138
25	NC_006389	GCCGG	2	10	27878	27887	0 %	0 %	60 %	40 %	55376141
26	NC_006389	ACCGA	2	10	28883	28892	40 %	0 %	20 %	40 %	55376141
27	NC_006389	TTCGG	2	10	31109	31118	0 %	40 %	40 %	20 %	55376142

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.