MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG100

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006389	CACC	2	8	871	878	25 %	0 %	0 %	75 %	55376109
2	NC_006389	GGCA	2	8	1276	1283	25 %	0 %	50 %	25 %	55376109
3	NC_006389	GTGG	2	8	1409	1416	0 %	25 %	75 %	0 %	55376109
4	NC_006389	GCAG	2	8	1597	1604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006389	TTGA	2	8	2725	2732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006389	ATCG	2	8	3688	3695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006389	CTGG	2	8	3768	3775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006389	CTCG	2	8	3940	3947	0 %	25 %	25 %	50 %	55376111
9	NC_006389	CTCC	2	8	4792	4799	0 %	25 %	0 %	75 %	55376112
10	NC_006389	CCCG	2	8	5123	5130	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_006389	CAAA	2	8	5155	5162	75 %	0 %	0 %	25 %	55376113
12	NC_006389	AGAT	2	8	5782	5789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006389	CTCG	2	8	6649	6656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006389	AAAC	2	8	6881	6888	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006389	TCGT	2	8	6902	6909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_006389	TCAC	2	8	7826	7833	25 %	25 %	0 %	50 %	55376116
17	NC_006389	ACAA	2	8	8162	8169	75 %	0 %	0 %	25 %	55376116
18	NC_006389	CATG	2	8	8210	8217	25 %	25 %	25 %	25 %	55376116
19	NC_006389	AACC	2	8	8663	8670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006389	TCCG	2	8	8928	8935	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006389	GTCG	2	8	9042	9049	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006389	AGAC	2	8	9392	9399	50 %	0 %	25 %	25 %	55376117
23	NC_006389	CCCT	2	8	11527	11534	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_006389	CAAC	2	8	11806	11813	50 %	0 %	0 %	50 %	55376122
25	NC_006389	AGCG	2	8	11835	11842	25 %	0 %	50 %	25 %	55376122
26	NC_006389	TCAC	2	8	11856	11863	25 %	25 %	0 %	50 %	55376122
27	NC_006389	GCCC	2	8	12236	12243	0 %	0 %	25 %	75 %	55376121
28	NC_006389	TCCA	2	8	13559	13566	25 %	25 %	0 %	50 %	55376123
29	NC_006389	GTCG	2	8	13912	13919	0 %	25 %	50 %	25 %	55376123
30	NC_006389	AGAA	2	8	14214	14221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006389	GGAA	2	8	15047	15054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006389	TGCG	2	8	15454	15461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006389	AGCA	2	8	15970	15977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006389	TCGG	2	8	16827	16834	0 %	25 %	50 %	25 %	55376126
35	NC_006389	TGGT	2	8	16851	16858	0 %	50 %	50 %	0 %	55376126
36	NC_006389	TCAA	2	8	17673	17680	50 %	25 %	0 %	25 %	55376127
37	NC_006389	AGCC	2	8	17698	17705	25 %	0 %	25 %	50 %	55376127
38	NC_006389	ACAG	2	8	18535	18542	50 %	0 %	25 %	25 %	55376128
39	NC_006389	GACA	2	8	18550	18557	50 %	0 %	25 %	25 %	55376128
40	NC_006389	GCAA	2	8	18671	18678	50 %	0 %	25 %	25 %	55376128
41	NC_006389	GTAC	2	8	19095	19102	25 %	25 %	25 %	25 %	55376129
42	NC_006389	GTCA	2	8	19717	19724	25 %	25 %	25 %	25 %	55376130
43	NC_006389	GTCG	2	8	19795	19802	0 %	25 %	50 %	25 %	55376130
44	NC_006389	TAAG	2	8	20018	20025	50 %	25 %	25 %	0 %	55376130
45	NC_006389	CGAA	2	8	20286	20293	50 %	0 %	25 %	25 %	55376130
46	NC_006389	GTTC	2	8	20300	20307	0 %	50 %	25 %	25 %	55376130
47	NC_006389	CAAA	2	8	20498	20505	75 %	0 %	0 %	25 %	55376130
48	NC_006389	AGCA	2	8	20605	20612	50 %	0 %	25 %	25 %	55376130
49	NC_006389	AGGT	2	8	20952	20959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006389	AACC	2	8	21204	21211	50 %	0 %	0 %	50 %	55376131
51	NC_006389	GAGT	2	8	21776	21783	25 %	25 %	50 %	0 %	55376131
52	NC_006389	GAAC	2	8	22058	22065	50 %	0 %	25 %	25 %	55376132
53	NC_006389	TCCG	2	8	22286	22293	0 %	25 %	25 %	50 %	55376132
54	NC_006389	TTCG	2	8	22539	22546	0 %	50 %	25 %	25 %	55376132
55	NC_006389	CTGG	2	8	23397	23404	0 %	25 %	50 %	25 %	55376132
56	NC_006389	AGTC	2	8	23499	23506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006389	AGTC	2	8	23764	23771	25 %	25 %	25 %	25 %	55376133
58	NC_006389	CGGC	2	8	24697	24704	0 %	0 %	50 %	50 %	55376133
59	NC_006389	TCGT	2	8	25158	25165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_006389	TCGT	2	8	25202	25209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_006389	GTTC	2	8	25336	25343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006389	CTGG	2	8	25731	25738	0 %	25 %	50 %	25 %	55376134
63	NC_006389	GCCC	2	8	26328	26335	0 %	0 %	25 %	75 %	55376137
64	NC_006389	CCGA	2	8	26610	26617	25 %	0 %	25 %	50 %	55376138
65	NC_006389	CCGG	2	8	26686	26693	0 %	0 %	50 %	50 %	55376138
66	NC_006389	GCTG	2	8	27068	27075	0 %	25 %	50 %	25 %	55376138
67	NC_006389	CGGT	2	8	27356	27363	0 %	25 %	50 %	25 %	55376140
68	NC_006389	ACTG	2	8	27603	27610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_006389	GTGC	2	8	27738	27745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_006389	ATCT	2	8	28079	28086	25 %	50 %	0 %	25 %	55376141
71	NC_006389	TGGC	2	8	28206	28213	0 %	25 %	50 %	25 %	55376141
72	NC_006389	TGCT	2	8	28263	28270	0 %	50 %	25 %	25 %	55376141
73	NC_006389	TGAC	2	8	28416	28423	25 %	25 %	25 %	25 %	55376141
74	NC_006389	CCGC	2	8	28908	28915	0 %	0 %	25 %	75 %	55376141
75	NC_006389	GTAT	2	8	29567	29574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006389	AATT	2	8	30087	30094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006389	AGCA	2	8	30135	30142	50 %	0 %	25 %	25 %	55376142
78	NC_006389	GGAG	2	8	30374	30381	25 %	0 %	75 %	0 %	55376142
79	NC_006389	TGAT	2	8	30585	30592	25 %	50 %	25 %	0 %	55376142
80	NC_006389	AGCA	2	8	30705	30712	50 %	0 %	25 %	25 %	55376142
81	NC_006389	AAGC	2	8	31392	31399	50 %	0 %	25 %	25 %	55376142
82	NC_006389	TCAT	2	8	31834	31841	25 %	50 %	0 %	25 %	55376142
83	NC_006389	GCAC	2	8	32384	32391	25 %	0 %	25 %	50 %	55376142
84	NC_006389	ACTG	2	8	32974	32981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_006389	AGGA	2	8	33135	33142	50 %	0 %	50 %	0 %	55376143

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.