MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG100

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006389	CACC	2	8	871	878	25 %	0 %	0 %	75 %	55376109
2	NC_006389	GGCA	2	8	1276	1283	25 %	0 %	50 %	25 %	55376109
3	NC_006389	GTGG	2	8	1409	1416	0 %	25 %	75 %	0 %	55376109
4	NC_006389	CTCG	2	8	3940	3947	0 %	25 %	25 %	50 %	55376111
5	NC_006389	CTCC	2	8	4792	4799	0 %	25 %	0 %	75 %	55376112
6	NC_006389	CAAA	2	8	5155	5162	75 %	0 %	0 %	25 %	55376113
7	NC_006389	TCAC	2	8	7826	7833	25 %	25 %	0 %	50 %	55376116
8	NC_006389	ACAA	2	8	8162	8169	75 %	0 %	0 %	25 %	55376116
9	NC_006389	CATG	2	8	8210	8217	25 %	25 %	25 %	25 %	55376116
10	NC_006389	AGAC	2	8	9392	9399	50 %	0 %	25 %	25 %	55376117
11	NC_006389	CAAC	2	8	11806	11813	50 %	0 %	0 %	50 %	55376122
12	NC_006389	AGCG	2	8	11835	11842	25 %	0 %	50 %	25 %	55376122
13	NC_006389	TCAC	2	8	11856	11863	25 %	25 %	0 %	50 %	55376122
14	NC_006389	GCCC	2	8	12236	12243	0 %	0 %	25 %	75 %	55376121
15	NC_006389	TCCA	2	8	13559	13566	25 %	25 %	0 %	50 %	55376123
16	NC_006389	GTCG	2	8	13912	13919	0 %	25 %	50 %	25 %	55376123
17	NC_006389	TCGG	2	8	16827	16834	0 %	25 %	50 %	25 %	55376126
18	NC_006389	TGGT	2	8	16851	16858	0 %	50 %	50 %	0 %	55376126
19	NC_006389	TCAA	2	8	17673	17680	50 %	25 %	0 %	25 %	55376127
20	NC_006389	AGCC	2	8	17698	17705	25 %	0 %	25 %	50 %	55376127
21	NC_006389	ACAG	2	8	18535	18542	50 %	0 %	25 %	25 %	55376128
22	NC_006389	GACA	2	8	18550	18557	50 %	0 %	25 %	25 %	55376128
23	NC_006389	GCAA	2	8	18671	18678	50 %	0 %	25 %	25 %	55376128
24	NC_006389	GTAC	2	8	19095	19102	25 %	25 %	25 %	25 %	55376129
25	NC_006389	GTCA	2	8	19717	19724	25 %	25 %	25 %	25 %	55376130
26	NC_006389	GTCG	2	8	19795	19802	0 %	25 %	50 %	25 %	55376130
27	NC_006389	TAAG	2	8	20018	20025	50 %	25 %	25 %	0 %	55376130
28	NC_006389	CGAA	2	8	20286	20293	50 %	0 %	25 %	25 %	55376130
29	NC_006389	GTTC	2	8	20300	20307	0 %	50 %	25 %	25 %	55376130
30	NC_006389	CAAA	2	8	20498	20505	75 %	0 %	0 %	25 %	55376130
31	NC_006389	AGCA	2	8	20605	20612	50 %	0 %	25 %	25 %	55376130
32	NC_006389	AACC	2	8	21204	21211	50 %	0 %	0 %	50 %	55376131
33	NC_006389	GAGT	2	8	21776	21783	25 %	25 %	50 %	0 %	55376131
34	NC_006389	GAAC	2	8	22058	22065	50 %	0 %	25 %	25 %	55376132
35	NC_006389	TCCG	2	8	22286	22293	0 %	25 %	25 %	50 %	55376132
36	NC_006389	TTCG	2	8	22539	22546	0 %	50 %	25 %	25 %	55376132
37	NC_006389	CTGG	2	8	23397	23404	0 %	25 %	50 %	25 %	55376132
38	NC_006389	AGTC	2	8	23764	23771	25 %	25 %	25 %	25 %	55376133
39	NC_006389	CGGC	2	8	24697	24704	0 %	0 %	50 %	50 %	55376133
40	NC_006389	CTGG	2	8	25731	25738	0 %	25 %	50 %	25 %	55376134
41	NC_006389	GCCC	2	8	26328	26335	0 %	0 %	25 %	75 %	55376137
42	NC_006389	CCGA	2	8	26610	26617	25 %	0 %	25 %	50 %	55376138
43	NC_006389	CCGG	2	8	26686	26693	0 %	0 %	50 %	50 %	55376138
44	NC_006389	GCTG	2	8	27068	27075	0 %	25 %	50 %	25 %	55376138
45	NC_006389	CGGT	2	8	27356	27363	0 %	25 %	50 %	25 %	55376140
46	NC_006389	ATCT	2	8	28079	28086	25 %	50 %	0 %	25 %	55376141
47	NC_006389	TGGC	2	8	28206	28213	0 %	25 %	50 %	25 %	55376141
48	NC_006389	TGCT	2	8	28263	28270	0 %	50 %	25 %	25 %	55376141
49	NC_006389	TGAC	2	8	28416	28423	25 %	25 %	25 %	25 %	55376141
50	NC_006389	CCGC	2	8	28908	28915	0 %	0 %	25 %	75 %	55376141
51	NC_006389	AGCA	2	8	30135	30142	50 %	0 %	25 %	25 %	55376142
52	NC_006389	GGAG	2	8	30374	30381	25 %	0 %	75 %	0 %	55376142
53	NC_006389	TGAT	2	8	30585	30592	25 %	50 %	25 %	0 %	55376142
54	NC_006389	AGCA	2	8	30705	30712	50 %	0 %	25 %	25 %	55376142
55	NC_006389	AAGC	2	8	31392	31399	50 %	0 %	25 %	25 %	55376142
56	NC_006389	TCAT	2	8	31834	31841	25 %	50 %	0 %	25 %	55376142
57	NC_006389	GCAC	2	8	32384	32391	25 %	0 %	25 %	50 %	55376142
58	NC_006389	AGGA	2	8	33135	33142	50 %	0 %	50 %	0 %	55376143

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.