MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG100

Total Repeats: 331

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006389	ACT	2	6	166	171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376108
2	NC_006389	TAG	2	6	228	233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376108
3	NC_006389	ATT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376108
4	NC_006389	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376108
5	NC_006389	GAA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376108
6	NC_006389	GTT	2	6	398	403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376108
7	NC_006389	TTC	2	6	426	431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376108
8	NC_006389	GAA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376108
9	NC_006389	CTG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376108
10	NC_006389	AGC	2	6	686	691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376108
11	NC_006389	TCG	2	6	786	791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376108
12	NC_006389	GAA	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376108
13	NC_006389	TCT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376109
14	NC_006389	AAC	2	6	954	959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376109
15	NC_006389	CCA	2	6	981	986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376109
16	NC_006389	CGC	2	6	1011	1016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376109
17	NC_006389	CGA	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376109
18	NC_006389	CGC	2	6	1215	1220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376109
19	NC_006389	TGG	2	6	1295	1300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376109
20	NC_006389	CTC	2	6	1978	1983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376110
21	NC_006389	CGT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376111
22	NC_006389	GTA	2	6	3878	3883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376111
23	NC_006389	TCA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376111
24	NC_006389	CGA	2	6	3973	3978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376111
25	NC_006389	TCT	2	6	4038	4043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376111
26	NC_006389	ACA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376112
27	NC_006389	TCA	3	9	4311	4319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376112
28	NC_006389	TCG	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376112
29	NC_006389	TCG	2	6	4506	4511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376112
30	NC_006389	GAA	2	6	4573	4578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376112
31	NC_006389	GCA	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376112
32	NC_006389	GTT	2	6	4814	4819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376112
33	NC_006389	ATC	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376112
34	NC_006389	GGA	2	6	5166	5171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376113
35	NC_006389	TAC	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376113
36	NC_006389	TGA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376113
37	NC_006389	AGA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376113
38	NC_006389	CAT	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376113
39	NC_006389	AGC	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376113
40	NC_006389	GTC	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376113
41	NC_006389	GGA	2	6	5625	5630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376113
42	NC_006389	AAC	2	6	6013	6018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376114
43	NC_006389	GAA	2	6	6042	6047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376114
44	NC_006389	TCC	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376114
45	NC_006389	TCG	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376114
46	NC_006389	CGC	2	6	6232	6237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376114
47	NC_006389	GAA	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376114
48	NC_006389	GTC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
49	NC_006389	GCT	2	6	7100	7105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
50	NC_006389	TCG	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
51	NC_006389	TCG	2	6	7199	7204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
52	NC_006389	AAT	2	6	7231	7236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376115
53	NC_006389	CTG	2	6	7362	7367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
54	NC_006389	AAC	2	6	7702	7707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376116
55	NC_006389	CCG	2	6	7736	7741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376116
56	NC_006389	TCA	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376116
57	NC_006389	ATT	2	6	7816	7821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376116
58	NC_006389	GTT	2	6	7928	7933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376116
59	NC_006389	CGT	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376116
60	NC_006389	CGT	2	6	8152	8157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376116
61	NC_006389	TTG	2	6	8222	8227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376116
62	NC_006389	AGG	2	6	8371	8376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376116
63	NC_006389	TTG	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376116
64	NC_006389	CCA	2	6	8498	8503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376116
65	NC_006389	ACG	2	6	9129	9134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376117
66	NC_006389	TGA	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376117
67	NC_006389	CGG	2	6	9461	9466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376117
68	NC_006389	ACA	2	6	10387	10392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376118
69	NC_006389	GGA	2	6	10661	10666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376118
70	NC_006389	TGA	2	6	10766	10771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376118
71	NC_006389	GAT	2	6	10808	10813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376118
72	NC_006389	ACA	2	6	10819	10824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376118
73	NC_006389	CGA	2	6	11110	11115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376119
74	NC_006389	ACC	2	6	11145	11150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376119
75	NC_006389	CAG	2	6	11156	11161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376119
76	NC_006389	CCG	2	6	11166	11171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376119
77	NC_006389	CAG	2	6	11227	11232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376119
78	NC_006389	ATG	2	6	11256	11261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376119
79	NC_006389	CCA	2	6	11281	11286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376119
80	NC_006389	GAA	2	6	11303	11308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376119
81	NC_006389	CGT	2	6	11755	11760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376122
82	NC_006389	CCG	2	6	11815	11820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376122
83	NC_006389	CCT	2	6	11872	11877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376122
84	NC_006389	CGT	2	6	11914	11919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376122
85	NC_006389	CAG	2	6	11933	11938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376122
86	NC_006389	CGC	2	6	11972	11977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376122
87	NC_006389	CCG	2	6	12024	12029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376121
88	NC_006389	CAG	2	6	12140	12145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376121
89	NC_006389	CCA	2	6	12146	12151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376121
90	NC_006389	GAC	2	6	12163	12168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376121
91	NC_006389	CAC	2	6	12223	12228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376121
92	NC_006389	CGT	3	9	12493	12501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376123
93	NC_006389	CAT	2	6	12807	12812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376123
94	NC_006389	TCG	2	6	12816	12821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376123
95	NC_006389	GAG	2	6	12958	12963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376123
96	NC_006389	GTC	2	6	13013	13018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376123
97	NC_006389	TGC	2	6	13300	13305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376123
98	NC_006389	ACC	2	6	13317	13322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376123
99	NC_006389	ACG	2	6	13439	13444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376123
100	NC_006389	TCG	2	6	13526	13531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376123
101	NC_006389	TCG	2	6	13541	13546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376123
102	NC_006389	CGC	2	6	13584	13589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376123
103	NC_006389	GCC	3	9	13620	13628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376123
104	NC_006389	GGC	2	6	13644	13649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376123
105	NC_006389	TCG	2	6	13667	13672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376123
106	NC_006389	CGG	2	6	13788	13793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376123
107	NC_006389	GAT	2	6	13948	13953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376123
108	NC_006389	TCT	2	6	13971	13976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376123
109	NC_006389	GCA	2	6	14630	14635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376124
110	NC_006389	GCC	2	6	14637	14642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376124
111	NC_006389	CGA	2	6	14654	14659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376124
112	NC_006389	GAG	2	6	14679	14684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376124
113	NC_006389	GTG	2	6	14798	14803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376124
114	NC_006389	CCG	2	6	14809	14814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376124
115	NC_006389	GAG	2	6	14841	14846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376124
116	NC_006389	CGA	2	6	14915	14920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376124
117	NC_006389	TGA	2	6	15091	15096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376125
118	NC_006389	GCT	2	6	15151	15156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376125
119	NC_006389	CGT	2	6	15220	15225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376125
120	NC_006389	AGT	2	6	15234	15239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376125
121	NC_006389	CCT	2	6	16222	16227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376126
122	NC_006389	GTG	2	6	16410	16415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376126
123	NC_006389	TCG	2	6	16479	16484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
124	NC_006389	GCT	2	6	16495	16500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
125	NC_006389	TCG	2	6	16527	16532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
126	NC_006389	TTC	2	6	16625	16630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376126
127	NC_006389	ATC	2	6	16631	16636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376126
128	NC_006389	AAG	2	6	16683	16688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376126
129	NC_006389	GCC	2	6	16710	16715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376126
130	NC_006389	GTC	2	6	16727	16732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
131	NC_006389	GTC	2	6	16794	16799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
132	NC_006389	CTG	2	6	16805	16810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
133	NC_006389	TCG	2	6	16870	16875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
134	NC_006389	GCG	2	6	16931	16936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376126
135	NC_006389	GTC	2	6	16955	16960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
136	NC_006389	GTC	2	6	16964	16969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
137	NC_006389	TCG	3	9	17007	17015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
138	NC_006389	GCA	2	6	17071	17076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376126
139	NC_006389	GCT	2	6	17136	17141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
140	NC_006389	CGT	2	6	17167	17172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
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143	NC_006389	TTG	2	6	17610	17615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376127
144	NC_006389	ACG	2	6	17784	17789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376127
145	NC_006389	AAG	2	6	17838	17843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376127
146	NC_006389	CGT	2	6	17956	17961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376127
147	NC_006389	CAT	2	6	18004	18009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376127
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151	NC_006389	GTG	2	6	18393	18398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376127
152	NC_006389	GAC	2	6	18518	18523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376128
153	NC_006389	TCA	2	6	18579	18584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376128
154	NC_006389	ACG	2	6	18657	18662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376128
155	NC_006389	TGC	2	6	18988	18993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376129
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157	NC_006389	GTT	2	6	19029	19034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376129
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159	NC_006389	AGC	2	6	19745	19750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376130
160	NC_006389	TCC	2	6	19757	19762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376130
161	NC_006389	CGA	2	6	19803	19808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376130
162	NC_006389	TTG	3	9	19844	19852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376130
163	NC_006389	ATC	3	9	19870	19878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376130
164	NC_006389	TCG	2	6	19907	19912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376130
165	NC_006389	CAG	2	6	19990	19995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376130
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240	NC_006389	CGA	2	6	26154	26159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376137
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246	NC_006389	CGA	3	9	26487	26495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376137
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249	NC_006389	AGC	2	6	26640	26645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376138
250	NC_006389	CCG	2	6	26864	26869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376138
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252	NC_006389	TTG	2	6	26995	27000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376138
253	NC_006389	CCG	2	6	27008	27013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376138
254	NC_006389	GTC	2	6	27019	27024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376138
255	NC_006389	TCG	2	6	27087	27092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376138
256	NC_006389	GTC	2	6	27101	27106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376139
257	NC_006389	TCG	2	6	27111	27116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376139
258	NC_006389	CCG	2	6	27174	27179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376139
259	NC_006389	GGA	2	6	27252	27257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376140
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262	NC_006389	CGT	2	6	27390	27395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376140
263	NC_006389	GTG	2	6	27451	27456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376140
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271	NC_006389	ATA	2	6	28132	28137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376141
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273	NC_006389	AGC	2	6	28353	28358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376141
274	NC_006389	GTG	2	6	28408	28413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376141
275	NC_006389	TCT	2	6	28677	28682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376141
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282	NC_006389	CGG	2	6	29125	29130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376141
283	NC_006389	TCG	2	6	29136	29141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376141
284	NC_006389	GCC	2	6	29218	29223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376141
285	NC_006389	CCG	2	6	29249	29254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376141
286	NC_006389	GAC	2	6	29262	29267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376141
287	NC_006389	GCC	2	6	29268	29273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376141
288	NC_006389	ACG	2	6	29288	29293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376141
289	NC_006389	CCG	2	6	29335	29340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376141
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322	NC_006389	TTG	2	6	31926	31931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376142
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329	NC_006389	ATG	2	6	32528	32533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376142
330	NC_006389	AAG	2	6	32605	32610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376142
331	NC_006389	CGA	2	6	33208	33213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376143

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.