MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG100

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006389	AC	3	6	1387	1392	50 %	0 %	0 %	50 %	55376109
2	NC_006389	TC	3	6	1438	1443	0 %	50 %	0 %	50 %	55376109
3	NC_006389	AG	3	6	2350	2355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006389	AT	3	6	2708	2713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006389	AG	3	6	2806	2811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006389	CT	3	6	3225	3230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006389	GA	3	6	3401	3406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006389	AT	3	6	3717	3722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006389	TG	3	6	3796	3801	0 %	50 %	50 %	0 %	55376111
10	NC_006389	AT	3	6	4284	4289	50 %	50 %	0 %	0 %	55376112
11	NC_006389	TC	3	6	4679	4684	0 %	50 %	0 %	50 %	55376112
12	NC_006389	AG	3	6	4907	4912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006389	CT	3	6	5557	5562	0 %	50 %	0 %	50 %	55376113
14	NC_006389	TC	3	6	5712	5717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006389	CT	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006389	GT	3	6	5952	5957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006389	TG	3	6	7719	7724	0 %	50 %	50 %	0 %	55376116
18	NC_006389	TC	3	6	8471	8476	0 %	50 %	0 %	50 %	55376116
19	NC_006389	TC	3	6	8709	8714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006389	CG	3	6	9299	9304	0 %	0 %	50 %	50 %	55376117
21	NC_006389	AC	3	6	9531	9536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006389	TG	3	6	9792	9797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006389	TA	3	6	9836	9841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006389	GT	3	6	10038	10043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006389	CA	3	6	10780	10785	50 %	0 %	0 %	50 %	55376118
26	NC_006389	CA	3	6	11634	11639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006389	CG	4	8	12335	12342	0 %	0 %	50 %	50 %	55376121
28	NC_006389	AC	3	6	13166	13171	50 %	0 %	0 %	50 %	55376123
29	NC_006389	CA	3	6	14270	14275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006389	CT	3	6	14442	14447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006389	AG	3	6	15802	15807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006389	TC	3	6	15837	15842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_006389	TG	3	6	16059	16064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006389	CA	3	6	16375	16380	50 %	0 %	0 %	50 %	55376126
35	NC_006389	AG	3	6	18571	18576	50 %	0 %	50 %	0 %	55376128
36	NC_006389	AT	3	6	18927	18932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006389	AT	3	6	19206	19211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006389	AC	5	10	19286	19295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006389	GT	3	6	19379	19384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006389	CT	3	6	19385	19390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006389	GT	5	10	19508	19517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006389	GA	3	6	19751	19756	50 %	0 %	50 %	0 %	55376130
43	NC_006389	GA	3	6	19829	19834	50 %	0 %	50 %	0 %	55376130
44	NC_006389	GC	3	6	20031	20036	0 %	0 %	50 %	50 %	55376130
45	NC_006389	GA	3	6	20354	20359	50 %	0 %	50 %	0 %	55376130
46	NC_006389	CG	3	6	20454	20459	0 %	0 %	50 %	50 %	55376130
47	NC_006389	AT	3	6	20689	20694	50 %	50 %	0 %	0 %	55376130
48	NC_006389	CA	3	6	21408	21413	50 %	0 %	0 %	50 %	55376131
49	NC_006389	CA	3	6	21448	21453	50 %	0 %	0 %	50 %	55376131
50	NC_006389	TA	3	6	21982	21987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006389	GA	3	6	22433	22438	50 %	0 %	50 %	0 %	55376132
52	NC_006389	GA	3	6	24221	24226	50 %	0 %	50 %	0 %	55376133
53	NC_006389	AT	3	6	24760	24765	50 %	50 %	0 %	0 %	55376133
54	NC_006389	CA	3	6	24931	24936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_006389	GT	3	6	24945	24950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006389	AC	4	8	24974	24981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006389	GT	3	6	24989	24994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006389	GC	4	8	25702	25709	0 %	0 %	50 %	50 %	55376134
59	NC_006389	AC	3	6	27168	27173	50 %	0 %	0 %	50 %	55376139
60	NC_006389	CA	3	6	27408	27413	50 %	0 %	0 %	50 %	55376140
61	NC_006389	CG	3	6	27790	27795	0 %	0 %	50 %	50 %	55376141
62	NC_006389	GA	3	6	29318	29323	50 %	0 %	50 %	0 %	55376141
63	NC_006389	TC	3	6	31640	31645	0 %	50 %	0 %	50 %	55376142
64	NC_006389	TA	3	6	31655	31660	50 %	50 %	0 %	0 %	55376142
65	NC_006389	TC	3	6	31713	31718	0 %	50 %	0 %	50 %	55376142
66	NC_006389	TC	3	6	31800	31805	0 %	50 %	0 %	50 %	55376142
67	NC_006389	GA	3	6	32244	32249	50 %	0 %	50 %	0 %	55376142
68	NC_006389	AT	3	6	32704	32709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006389	TC	3	6	32942	32947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.