MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1 plasmid pWCFS103

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006377	TTGAC	2	10	1231	1240	20 %	40 %	20 %	20 %	54307187
2	NC_006377	ATTTG	2	10	2459	2468	20 %	60 %	20 %	0 %	54307188
3	NC_006377	CTCAA	2	10	3078	3087	40 %	20 %	0 %	40 %	54307189
4	NC_006377	ACTTA	2	10	3408	3417	40 %	40 %	0 %	20 %	54307190
5	NC_006377	ATTCA	2	10	3497	3506	40 %	40 %	0 %	20 %	54307190
6	NC_006377	ATCTG	2	10	3917	3926	20 %	40 %	20 %	20 %	54307191
7	NC_006377	ATTTG	2	10	4315	4324	20 %	60 %	20 %	0 %	54307191
8	NC_006377	ATCGA	2	10	4603	4612	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_006377	TATTT	2	10	5334	5343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006377	AGTTG	2	10	5445	5454	20 %	40 %	40 %	0 %	54307193
11	NC_006377	ATTAT	2	10	6926	6935	40 %	60 %	0 %	0 %	54307196
12	NC_006377	CTGAT	2	10	7457	7466	20 %	40 %	20 %	20 %	54307196
13	NC_006377	CGTTT	2	10	9040	9049	0 %	60 %	20 %	20 %	54307197
14	NC_006377	CATTA	2	10	9544	9553	40 %	40 %	0 %	20 %	54307197
15	NC_006377	ATTAA	2	10	11856	11865	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006377	AAATT	2	10	11964	11973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006377	AAGCG	2	10	12275	12284	40 %	0 %	40 %	20 %	54307201
18	NC_006377	AAAAT	2	10	12393	12402	80 %	20 %	0 %	0 %	54307201
19	NC_006377	GTGCT	2	10	18667	18676	0 %	40 %	40 %	20 %	54307210
20	NC_006377	GGTTT	2	10	20007	20016	0 %	60 %	40 %	0 %	54307210
21	NC_006377	CTACG	2	10	21506	21515	20 %	20 %	20 %	40 %	54307213
22	NC_006377	TTGCC	2	10	21660	21669	0 %	40 %	20 %	40 %	54307214
23	NC_006377	TTTGG	2	10	22934	22943	0 %	60 %	40 %	0 %	54307215
24	NC_006377	GTTTA	2	10	24095	24104	20 %	60 %	20 %	0 %	54307215
25	NC_006377	ATTTT	2	10	31564	31573	20 %	80 %	0 %	0 %	54307225
26	NC_006377	CGTTA	2	10	34718	34727	20 %	40 %	20 %	20 %	54307227
27	NC_006377	CATGG	2	10	34829	34838	20 %	20 %	40 %	20 %	54307227
28	NC_006377	TCAGT	2	10	34981	34990	20 %	40 %	20 %	20 %	54307227

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.