MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1 plasmid pWCFS103

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006377	A	6	6	679	684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006377	A	6	6	712	717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006377	T	6	6	743	748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006377	T	6	6	828	833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006377	A	6	6	850	855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006377	T	7	7	1215	1221	0 %	100 %	0 %	0 %	54307187
7	NC_006377	A	6	6	1456	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006377	T	7	7	1769	1775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006377	A	7	7	2154	2160	100 %	0 %	0 %	0 %	54307188
10	NC_006377	A	7	7	2371	2377	100 %	0 %	0 %	0 %	54307188
11	NC_006377	A	7	7	2802	2808	100 %	0 %	0 %	0 %	54307188
12	NC_006377	A	6	6	3039	3044	100 %	0 %	0 %	0 %	54307189
13	NC_006377	A	6	6	3110	3115	100 %	0 %	0 %	0 %	54307189
14	NC_006377	T	7	7	3117	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	54307189
15	NC_006377	A	6	6	3286	3291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006377	A	6	6	3421	3426	100 %	0 %	0 %	0 %	54307190
17	NC_006377	T	6	6	4283	4288	0 %	100 %	0 %	0 %	54307191
18	NC_006377	A	6	6	4437	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006377	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006377	A	6	6	4996	5001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006377	T	6	6	5052	5057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006377	A	6	6	5278	5283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006377	A	7	7	6062	6068	100 %	0 %	0 %	0 %	54307194
24	NC_006377	T	6	6	6550	6555	0 %	100 %	0 %	0 %	54307196
25	NC_006377	A	6	6	7060	7065	100 %	0 %	0 %	0 %	54307196
26	NC_006377	A	7	7	7308	7314	100 %	0 %	0 %	0 %	54307196
27	NC_006377	T	6	6	8303	8308	0 %	100 %	0 %	0 %	54307197
28	NC_006377	A	7	7	8697	8703	100 %	0 %	0 %	0 %	54307197
29	NC_006377	T	6	6	8850	8855	0 %	100 %	0 %	0 %	54307197
30	NC_006377	A	7	7	9474	9480	100 %	0 %	0 %	0 %	54307197
31	NC_006377	A	7	7	10125	10131	100 %	0 %	0 %	0 %	54307199
32	NC_006377	A	6	6	11437	11442	100 %	0 %	0 %	0 %	54307200
33	NC_006377	A	6	6	11467	11472	100 %	0 %	0 %	0 %	54307200
34	NC_006377	T	6	6	11953	11958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006377	T	6	6	12477	12482	0 %	100 %	0 %	0 %	54307202
36	NC_006377	T	6	6	12566	12571	0 %	100 %	0 %	0 %	54307202
37	NC_006377	T	6	6	12613	12618	0 %	100 %	0 %	0 %	54307202
38	NC_006377	T	6	6	12853	12858	0 %	100 %	0 %	0 %	54307202
39	NC_006377	T	6	6	13657	13662	0 %	100 %	0 %	0 %	54307203
40	NC_006377	T	7	7	13949	13955	0 %	100 %	0 %	0 %	54307203
41	NC_006377	T	7	7	14099	14105	0 %	100 %	0 %	0 %	54307203
42	NC_006377	T	6	6	14197	14202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006377	T	6	6	14809	14814	0 %	100 %	0 %	0 %	54307206
44	NC_006377	T	7	7	16804	16810	0 %	100 %	0 %	0 %	54307206
45	NC_006377	T	7	7	17265	17271	0 %	100 %	0 %	0 %	54307207
46	NC_006377	T	7	7	17289	17295	0 %	100 %	0 %	0 %	54307207
47	NC_006377	A	6	6	18114	18119	100 %	0 %	0 %	0 %	54307208
48	NC_006377	T	6	6	18184	18189	0 %	100 %	0 %	0 %	54307209
49	NC_006377	T	7	7	18391	18397	0 %	100 %	0 %	0 %	54307209
50	NC_006377	T	6	6	18542	18547	0 %	100 %	0 %	0 %	54307209
51	NC_006377	T	6	6	18655	18660	0 %	100 %	0 %	0 %	54307210
52	NC_006377	T	6	6	19717	19722	0 %	100 %	0 %	0 %	54307210
53	NC_006377	T	6	6	20777	20782	0 %	100 %	0 %	0 %	54307212
54	NC_006377	A	6	6	25106	25111	100 %	0 %	0 %	0 %	54307216
55	NC_006377	T	6	6	25250	25255	0 %	100 %	0 %	0 %	54307216
56	NC_006377	T	6	6	25845	25850	0 %	100 %	0 %	0 %	54307216
57	NC_006377	T	6	6	26073	26078	0 %	100 %	0 %	0 %	54307216
58	NC_006377	A	6	6	27774	27779	100 %	0 %	0 %	0 %	54307220
59	NC_006377	T	7	7	28256	28262	0 %	100 %	0 %	0 %	54307221
60	NC_006377	T	8	8	28507	28514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006377	T	6	6	29520	29525	0 %	100 %	0 %	0 %	54307222
62	NC_006377	T	7	7	29965	29971	0 %	100 %	0 %	0 %	54307222
63	NC_006377	T	6	6	30023	30028	0 %	100 %	0 %	0 %	54307222
64	NC_006377	A	6	6	30908	30913	100 %	0 %	0 %	0 %	54307223
65	NC_006377	A	7	7	30923	30929	100 %	0 %	0 %	0 %	54307223
66	NC_006377	A	6	6	31137	31142	100 %	0 %	0 %	0 %	54307224
67	NC_006377	A	6	6	31342	31347	100 %	0 %	0 %	0 %	54307224
68	NC_006377	T	6	6	31393	31398	0 %	100 %	0 %	0 %	54307225
69	NC_006377	T	6	6	31895	31900	0 %	100 %	0 %	0 %	54307226
70	NC_006377	T	6	6	31910	31915	0 %	100 %	0 %	0 %	54307226
71	NC_006377	T	6	6	32343	32348	0 %	100 %	0 %	0 %	54307226
72	NC_006377	T	6	6	32379	32384	0 %	100 %	0 %	0 %	54307226
73	NC_006377	T	6	6	32481	32486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006377	T	6	6	32620	32625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006377	A	6	6	33080	33085	100 %	0 %	0 %	0 %	54307227
76	NC_006377	A	6	6	33096	33101	100 %	0 %	0 %	0 %	54307227
77	NC_006377	A	9	9	33575	33583	100 %	0 %	0 %	0 %	54307227
78	NC_006377	A	6	6	33971	33976	100 %	0 %	0 %	0 %	54307227
79	NC_006377	A	6	6	34246	34251	100 %	0 %	0 %	0 %	54307227
80	NC_006377	A	6	6	34299	34304	100 %	0 %	0 %	0 %	54307227
81	NC_006377	A	6	6	34658	34663	100 %	0 %	0 %	0 %	54307227
82	NC_006377	C	6	6	34728	34733	0 %	0 %	0 %	100 %	54307227
83	NC_006377	A	6	6	35714	35719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006377	T	6	6	35750	35755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.