MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1 plasmid pWCFS102

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006376	CAG	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307233
2	NC_006376	TTG	2	6	367	372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307233
3	NC_006376	GAC	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307233
4	NC_006376	ATG	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307233
5	NC_006376	GTT	2	6	862	867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006376	CTA	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006376	TCA	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006376	TCA	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307234
9	NC_006376	TTC	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307234
10	NC_006376	CAA	2	6	1027	1032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307234
11	NC_006376	TCA	2	6	1065	1070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307234
12	NC_006376	TAA	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307234
13	NC_006376	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307234
14	NC_006376	TTC	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307234
15	NC_006376	TTC	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307234
16	NC_006376	ACC	2	6	1382	1387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307234
17	NC_006376	TCC	2	6	1400	1405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_006376	ATT	2	6	1469	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006376	CAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006376	TGA	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307235
21	NC_006376	GGC	2	6	1868	1873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54307235
22	NC_006376	TGT	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006376	TAC	2	6	2039	2044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006376	CAA	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006376	CAA	2	6	2145	2150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006376	AGA	2	6	2358	2363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.