MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila str. Lens

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006369	TCGAAT	2	12	10637	10648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006369	ATATGA	2	12	24555	24566	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006369	GTTTAT	2	12	32222	32233	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006369	TTAATA	2	12	137944	137955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006369	TTTTAT	2	12	181804	181815	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006369	AATACT	2	12	209697	209708	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006369	ATTTTC	2	12	217975	217986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_006369	TGTCGC	2	12	218566	218577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006369	GATTTT	2	12	232876	232887	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006369	TGAGAT	2	12	237097	237108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006369	TCAACA	2	12	242183	242194	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006369	AATTTA	2	12	252653	252664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006369	ATTTCA	2	12	256741	256752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_006369	GTATAA	2	12	261734	261745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006369	TTATTT	2	12	270728	270739	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006369	GTGCAT	2	12	272407	272418	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_006369	TAAAAT	2	12	343203	343214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006369	CATTTG	2	12	365845	365856	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006369	CATTTG	2	12	410810	410821	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_006369	TGAAAT	2	12	412680	412691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006369	AATTTA	2	12	416667	416678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006369	TTATTT	2	12	524119	524130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006369	CTTGGT	2	12	558694	558705	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_006369	ATTAAA	2	12	559861	559872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006369	ACCCAG	2	12	563877	563888	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006369	TAAAAT	2	12	575202	575213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006369	TCCTAA	2	12	601998	602009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006369	TTTTCA	2	12	605401	605412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_006369	GGCAAA	2	12	633202	633213	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_006369	AATCAA	2	12	641104	641115	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006369	GTAATT	2	12	642202	642213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006369	GCGATT	2	12	642662	642673	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_006369	TTTAAA	2	12	647237	647248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006369	CATTTG	2	12	661697	661708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_006369	TGAAAT	2	12	663567	663578	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006369	AAGATT	2	12	665013	665024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006369	TAAAAT	2	12	673652	673663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006369	TATTTT	2	12	928014	928025	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006369	TTTGTT	2	12	939357	939368	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006369	TCCTGT	2	12	981769	981780	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006369	GCCTGA	2	12	982038	982049	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006369	AAAGAG	2	12	1054013	1054024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006369	TTTCGT	2	12	1070895	1070906	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_006369	AAGTGC	2	12	1072136	1072147	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_006369	GAAATG	2	12	1072287	1072298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006369	TTAAAA	2	12	1123041	1123052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006369	ATTTTT	2	12	1133262	1133273	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006369	TTTTTG	2	12	1134686	1134697	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006369	ATTTTC	2	12	1143164	1143175	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_006369	ATTTTA	2	12	1144973	1144984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006369	ACCTGG	2	12	1180664	1180675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006369	CTTTAT	2	12	1192467	1192478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006369	TTATTG	2	12	1212735	1212746	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006369	AATAAA	2	12	1241217	1241228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006369	TGTTTT	2	12	1251967	1251978	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006369	TTTTAT	2	12	1356510	1356521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006369	TATTAA	2	12	1360688	1360699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006369	AGGGGA	2	12	1363981	1363992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006369	GACTTT	2	12	1377911	1377922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_006369	TTAGAT	2	12	1405348	1405359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006369	AATGAT	2	12	1428385	1428396	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006369	ATCATT	2	12	1429592	1429603	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_006369	AAATTG	2	12	1438985	1438996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006369	TAAAAA	2	12	1466385	1466396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006369	TTAAAA	2	12	1470619	1470630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006369	TTTTTA	2	12	1478344	1478355	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006369	CAGTAC	2	12	1497508	1497519	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006369	AATCAT	2	12	1498648	1498659	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_006369	CAAAAT	2	12	1540484	1540495	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_006369	ATTTTT	2	12	1586023	1586034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006369	TATGGA	2	12	1589835	1589846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006369	TAATTT	2	12	1664506	1664517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006369	CAATAT	2	12	1703331	1703342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_006369	GCATTA	2	12	1722904	1722915	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_006369	TCTTTA	2	12	1761893	1761904	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_006369	TTATTT	2	12	1764894	1764905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006369	AAAAAT	2	12	1803419	1803430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006369	AGACTT	2	12	1820543	1820554	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_006369	AAAAAT	2	12	1989954	1989965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006369	TCAAAA	2	12	2026803	2026814	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_006369	ACTTTT	2	12	2056016	2056027	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_006369	TATAAT	2	12	2080151	2080162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006369	TCAAAT	2	12	2091226	2091237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_006369	GTGCTG	2	12	2123100	2123111	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_006369	CTAGCA	2	12	2126908	2126919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_006369	TGACAA	2	12	2165261	2165272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_006369	ATTTGA	2	12	2175013	2175024	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006369	AAATTA	2	12	2187764	2187775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006369	AATTAT	2	12	2205480	2205491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006369	TGTAAT	2	12	2206666	2206677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006369	TTAATT	2	12	2243415	2243426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006369	AATAAA	2	12	2280583	2280594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006369	TTAATT	2	12	2292017	2292028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006369	AATTTA	2	12	2342134	2342145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006369	ACTTTG	2	12	2364994	2365005	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_006369	ATTTTA	2	12	2441152	2441163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006369	TCAAAG	2	12	2474771	2474782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_006369	AAATGA	2	12	2496172	2496183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006369	CTTTTT	2	12	2567108	2567119	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_006369	TTTTTA	2	12	2624168	2624179	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006369	AAAGAA	2	12	2641129	2641140	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006369	ACAAAT	2	12	2697918	2697929	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_006369	TGAATT	2	12	2782359	2782370	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006369	GTTGAA	2	12	2819815	2819826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006369	AGAAAC	2	12	2821581	2821592	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_006369	GTTAAA	2	12	2829171	2829182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006369	AACCCG	2	12	2861375	2861386	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_006369	ATACCG	2	12	2935363	2935374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006369	AGCAAG	2	12	2935959	2935970	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_006369	TATTTG	2	12	2942218	2942229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006369	ATCAAG	2	12	2970712	2970723	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_006369	AAAATC	2	12	2993960	2993971	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_006369	TTCTGA	2	12	3002785	3002796	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_006369	ATAAAA	2	12	3010056	3010067	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006369	TCCTTA	2	12	3030759	3030770	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006369	ATTTCA	2	12	3044279	3044290	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_006369	CAAATG	2	12	3046149	3046160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_006369	TTAGAT	2	12	3072037	3072048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006369	TTATTT	2	12	3087154	3087165	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006369	GCAATA	2	12	3105237	3105248	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_006369	CAAGGT	2	12	3137430	3137441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_006369	AAGAAA	2	12	3139040	3139051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006369	CAAGGT	2	12	3197282	3197293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_006369	AGAATA	2	12	3210247	3210258	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006369	ATTATA	2	12	3223963	3223974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006369	ATTAAA	2	12	3228495	3228506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006369	TTTCTT	2	12	3244483	3244494	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_006369	CTCATA	2	12	3251580	3251591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006369	TAAAAA	2	12	3269018	3269029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006369	CTTATT	2	12	3309504	3309515	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.