MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila str. Lens

Total Repeats: 938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006369	ATGGCT	2	12	1383	1394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54292965
2	NC_006369	TGATAG	2	12	3386	3397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54292967
3	NC_006369	TATTCA	2	12	7833	7844	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54292969
4	NC_006369	CAATAA	2	12	9227	9238	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54292970
5	NC_006369	TTTATG	2	12	28263	28274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54292987
6	NC_006369	ACGGAC	2	12	28906	28917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54292987
7	NC_006369	TCCTGC	2	12	31606	31617	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	54292990
8	NC_006369	TTATTT	2	12	32852	32863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54292991
9	NC_006369	TTTTGA	2	12	48070	48081	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54293004
10	NC_006369	CTTAGT	2	12	53206	53217	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54293011
11	NC_006369	ATGGAT	2	12	53414	53425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54293012
12	NC_006369	TTGGAG	2	12	54429	54440	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54293012
13	NC_006369	CTCCTG	2	12	57580	57591	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	54293016
14	NC_006369	GGGTAT	2	12	60268	60279	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54293019
15	NC_006369	TGCAGC	2	12	66422	66433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54293025
16	NC_006369	TCAAAA	2	12	69941	69952	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54293026
17	NC_006369	GAAAAT	2	12	72583	72594	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54293028
18	NC_006369	ATTTCA	2	12	81197	81208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54293035
19	NC_006369	GGATTG	2	12	83896	83907	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54293036
20	NC_006369	AAAAGT	2	12	85528	85539	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54293037
21	NC_006369	ATGCTC	2	12	86649	86660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54293037
22	NC_006369	TTTGAA	2	12	91173	91184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54293041
23	NC_006369	CGATGA	2	12	91196	91207	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54293041
24	NC_006369	ATGGCA	2	12	99580	99591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54293048
25	NC_006369	AAACCA	2	12	100622	100633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54293048
26	NC_006369	ATGGTT	2	12	100994	101005	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	54293049
27	NC_006369	GGATTT	2	12	103404	103415	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	54293052
28	NC_006369	ATCCCG	2	12	109053	109064	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54293054
29	NC_006369	TTGCAA	2	12	112716	112727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54293057
30	NC_006369	ATTTAA	2	12	117569	117580	50 %	50 %	0 %	0 %	54293062
31	NC_006369	CAAATC	2	12	117584	117595	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	54293062
32	NC_006369	GTTTCT	2	12	120717	120728	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54293065
33	NC_006369	TTGCTT	2	12	120916	120927	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54293065
34	NC_006369	TAAGAA	2	12	125073	125084	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54293069
35	NC_006369	ATGACT	2	12	128566	128577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54293072
36	NC_006369	AGTTTT	2	12	129273	129284	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54293073
37	NC_006369	CAACAG	2	12	135034	135045	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54293075
38	NC_006369	CATTTC	2	12	137400	137411	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	54293077
39	NC_006369	TTTAAT	2	12	142377	142388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54293082
40	NC_006369	GGTTAT	2	12	145316	145327	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	54293086
41	NC_006369	CAGTTT	2	12	149891	149902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54293088
42	NC_006369	ATAAAT	2	12	160003	160014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54293097
43	NC_006369	TGTTTT	2	12	163354	163365	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	54293097
44	NC_006369	TTTGGG	2	12	164179	164190	0 %	50 %	50 %	0 %	54293097
45	NC_006369	AGTATA	2	12	170811	170822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54293101
46	NC_006369	TTTTAA	2	12	172156	172167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54293102
47	NC_006369	GAAAAA	2	12	172197	172208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	54293102
48	NC_006369	GCCATG	2	12	174564	174575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54293103
49	NC_006369	TGGTTT	2	12	180222	180233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54293106
50	NC_006369	TAAAAA	2	12	180593	180604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54293107
51	NC_006369	CAGTTA	2	12	181094	181105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54293108
52	NC_006369	TGAGGT	2	12	182271	182282	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54293109
53	NC_006369	ATATTG	2	12	183195	183206	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54293111
54	NC_006369	TATTTG	2	12	185804	185815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54293114
55	NC_006369	CCAATA	2	12	189622	189633	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	54293120
56	NC_006369	TGATTT	2	12	193368	193379	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54293123
57	NC_006369	ACCCAA	2	12	193801	193812	50 %	0 %	0 %	50 %	54293123
58	NC_006369	TGGACT	2	12	196189	196200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54293126
59	NC_006369	CATGCT	2	12	196487	196498	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54293126
60	NC_006369	AAAGAT	2	12	197673	197684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54293129
61	NC_006369	ACTATA	2	12	198226	198237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54293129
62	NC_006369	TAAAAA	2	12	198239	198250	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54293129
63	NC_006369	GCCTTT	2	12	199175	199186	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	54293130
64	NC_006369	ATATTT	2	12	202580	202591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54293133
65	NC_006369	ATTAAA	2	12	211246	211257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54293143
66	NC_006369	GTGCTG	2	12	213184	213195	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54293145
67	NC_006369	TGGAAA	2	12	213890	213901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	54293146
68	NC_006369	TTTTGC	2	12	220803	220814	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54293148
69	NC_006369	GTGCTG	2	12	226878	226889	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54293153
70	NC_006369	TGGAAA	2	12	228337	228348	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	54293155
71	NC_006369	GCTTCA	2	12	230340	230351	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54293158
72	NC_006369	AAAATC	2	12	230798	230809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54293158
73	NC_006369	ATCTTA	2	12	234935	234946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54293161
74	NC_006369	TGTTCT	2	12	236508	236519	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54293163
75	NC_006369	AGGAAA	2	12	240452	240463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54293168
76	NC_006369	GTAATC	2	12	249316	249327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54293175
77	NC_006369	ATAAGG	2	12	250503	250514	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	54293177
78	NC_006369	ATTAAT	2	12	256413	256424	50 %	50 %	0 %	0 %	54293183
79	NC_006369	GTTTTT	2	12	257036	257047	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	54293184
80	NC_006369	TATCAT	2	12	260872	260883	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54293189
81	NC_006369	TTTTGA	2	12	264855	264866	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54293192
82	NC_006369	CTTGGG	2	12	266120	266131	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54293193
83	NC_006369	TAAAAA	2	12	267657	267668	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54293195
84	NC_006369	AACGTG	2	12	278422	278433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54293202
85	NC_006369	AATTGA	2	12	278680	278691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54293202
86	NC_006369	ATTGAT	2	12	279110	279121	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54293202
87	NC_006369	CCCTTG	2	12	285258	285269	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	54293207
88	NC_006369	AGAACA	2	12	287470	287481	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	54293210
89	NC_006369	ATTCAA	2	12	295330	295341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54293215
90	NC_006369	ATTTTT	2	12	298967	298978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54293218
91	NC_006369	CTCCTA	2	12	299606	299617	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	54293219
92	NC_006369	GCTCAC	2	12	303936	303947	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54293225
93	NC_006369	ACATGT	2	12	307191	307202	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54293228
94	NC_006369	CCAAAA	2	12	308510	308521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54293228
95	NC_006369	TTGGGG	2	12	310412	310423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54293230
96	NC_006369	AAAATT	2	12	312720	312731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54293232
97	NC_006369	TGCCCA	2	12	320710	320721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54293236
98	NC_006369	ACTTCC	2	12	320833	320844	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	54293236
99	NC_006369	TTCTTT	2	12	322998	323009	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	54293240
100	NC_006369	GATATT	2	12	330587	330598	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54293243
101	NC_006369	TCCATG	2	12	334791	334802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54293246
102	NC_006369	TGTCTT	2	12	339068	339079	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54293250
103	NC_006369	TCTTTA	2	12	346660	346671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54293255
104	NC_006369	TTTAAT	2	12	347236	347247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54293256
105	NC_006369	TCCTGT	2	12	348202	348213	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	54293256
106	NC_006369	ATTTAA	2	12	352003	352014	50 %	50 %	0 %	0 %	54293260
107	NC_006369	TTTTTC	2	12	352178	352189	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	54293261
108	NC_006369	TCAGTG	2	12	357407	357418	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54293264
109	NC_006369	TTTATC	2	12	364894	364905	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54293271
110	NC_006369	ATCAAT	2	12	367584	367595	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54293274
111	NC_006369	ATAAAA	2	12	369507	369518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54293275
112	NC_006369	GAAAAA	2	12	372697	372708	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	54293279
113	NC_006369	CTATTG	2	12	374915	374926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54293279
114	NC_006369	TGGATG	2	12	377635	377646	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54293280
115	NC_006369	ATTTGT	2	12	379656	379667	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54293281
116	NC_006369	TGCCAT	2	12	380052	380063	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54293282
117	NC_006369	AATTCC	2	12	380191	380202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54293282
118	NC_006369	TCATAA	2	12	380984	380995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54293282
119	NC_006369	TTTTCT	2	12	380996	381007	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	54293282
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237	NC_006369	AGCTTA	2	12	855249	855260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54293700
238	NC_006369	TTTGGA	2	12	858731	858742	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	54293703
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339	NC_006369	TAGGAA	2	12	1182735	1182746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	54293995
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341	NC_006369	TAAAAA	2	12	1190140	1190151	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54294000
342	NC_006369	CAAAAT	2	12	1193117	1193128	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54294005
343	NC_006369	TCAATA	2	12	1200597	1200608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54294009
344	NC_006369	TAAAAG	2	12	1202258	1202269	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54294010
345	NC_006369	TTAAAG	2	12	1211750	1211761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54294021
346	NC_006369	TCAACA	2	12	1213095	1213106	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	54294024
347	NC_006369	AGTATT	2	12	1216649	1216660	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54294026
348	NC_006369	GGTTTT	2	12	1218015	1218026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54294028
349	NC_006369	TTTGAT	2	12	1221248	1221259	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54294034
350	NC_006369	TTCAAA	2	12	1230183	1230194	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54294042
351	NC_006369	CTAAAG	2	12	1234573	1234584	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54294046
352	NC_006369	TGGAAA	2	12	1235628	1235639	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	54294047
353	NC_006369	AGTTTT	2	12	1236666	1236677	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54294049
354	NC_006369	TTCAAA	2	12	1236893	1236904	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54294049
355	NC_006369	ATAGTG	2	12	1237578	1237589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54294049
356	NC_006369	TAACAT	2	12	1242229	1242240	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54294055
357	NC_006369	CAAGAT	2	12	1246869	1246880	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54294057
358	NC_006369	AATGAA	2	12	1250193	1250204	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54294059
359	NC_006369	TTTCCA	2	12	1254901	1254912	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	54294064
360	NC_006369	CAGTTC	2	12	1260021	1260032	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54294067
361	NC_006369	TCTTTC	2	12	1261721	1261732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54294068
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363	NC_006369	TTAATT	2	12	1268610	1268621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54294073
364	NC_006369	ATTGAT	2	12	1268786	1268797	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54294073
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368	NC_006369	TATTGA	2	12	1279610	1279621	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54294085
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370	NC_006369	TTGAAA	2	12	1286763	1286774	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54294090
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373	NC_006369	GTGAGA	2	12	1293160	1293171	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	54294095
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375	NC_006369	GCAATC	2	12	1297351	1297362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54294098
376	NC_006369	CCATTG	2	12	1299306	1299317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54294099
377	NC_006369	ACTGGA	2	12	1307949	1307960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54294109
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380	NC_006369	AATAAA	2	12	1318585	1318596	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54294116
381	NC_006369	ATTTAC	2	12	1321413	1321424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54294118
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383	NC_006369	GACTGG	2	12	1322135	1322146	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54294119
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387	NC_006369	AGATAA	2	12	1332501	1332512	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54294128
388	NC_006369	CCTGTG	2	12	1339346	1339357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54294132
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391	NC_006369	CCATTC	2	12	1350833	1350844	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	54294144
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400	NC_006369	GCAATA	2	12	1393807	1393818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54294186
401	NC_006369	AGTAAT	2	12	1396260	1396271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54294189
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420	NC_006369	CTTGTT	2	12	1478609	1478620	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54294256
421	NC_006369	GGCAAT	2	12	1482994	1483005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54294261
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424	NC_006369	GCATTG	2	12	1490211	1490222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54294266
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439	NC_006369	CAATGG	2	12	1540292	1540303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54294314
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442	NC_006369	GCAATG	2	12	1550716	1550727	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54294323
443	NC_006369	TTTTCA	2	12	1555065	1555076	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54294327
444	NC_006369	TATTGG	2	12	1557447	1557458	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	54294328
445	NC_006369	AACAGC	2	12	1561430	1561441	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54294331
446	NC_006369	ATTGCT	2	12	1566684	1566695	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54294336
447	NC_006369	ATGACT	2	12	1571569	1571580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54294339
448	NC_006369	CAGCGC	2	12	1573123	1573134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	54294340
449	NC_006369	TTATCG	2	12	1574188	1574199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54294341
450	NC_006369	AAATGT	2	12	1579173	1579184	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54294346
451	NC_006369	ATCCTG	2	12	1587773	1587784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54294353
452	NC_006369	GTGCTG	2	12	1591858	1591869	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54294356
453	NC_006369	TGGGTC	2	12	1595616	1595627	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54294359
454	NC_006369	TTGCCT	2	12	1597425	1597436	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	54294360
455	NC_006369	TATAAA	2	12	1597719	1597730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54294360
456	NC_006369	GTACAT	2	12	1602148	1602159	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54294367
457	NC_006369	ATCAAA	2	12	1602547	1602558	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54294368
458	NC_006369	TCAAAA	2	12	1604542	1604553	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54294369
459	NC_006369	TGTAAT	2	12	1606805	1606816	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54294372
460	NC_006369	TGTTAT	2	12	1608580	1608591	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54294373
461	NC_006369	TCATAT	2	12	1612442	1612453	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54294375
462	NC_006369	CTGAAG	2	12	1612471	1612482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54294375
463	NC_006369	AATTGC	2	12	1620362	1620373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54294384
464	NC_006369	TGCTGA	2	12	1621525	1621536	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54294385
465	NC_006369	ATCGAA	2	12	1622424	1622435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54294386
466	NC_006369	TAATGA	2	12	1626661	1626672	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54294390
467	NC_006369	TTGAGC	2	12	1650606	1650617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54294413
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469	NC_006369	CTGAAC	2	12	1664038	1664049	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54294425
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489	NC_006369	CTGCAT	2	12	1741238	1741249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54294494
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