MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila str. Paris

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006368	AATGCA	2	12	3807	3818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006368	TCGAAT	2	12	10659	10670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_006368	TCCGTG	2	12	30000	30011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006368	GTTTAT	2	12	31258	31269	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006368	TTTTTA	2	12	63243	63254	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006368	TTTGGT	2	12	70894	70905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006368	ATTCAT	2	12	75246	75257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_006368	TTAATA	2	12	145117	145128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006368	ACTGAA	2	12	190563	190574	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_006368	CGCCAT	2	12	192097	192108	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006368	TTTTAT	2	12	193991	194002	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006368	GATTTT	2	12	234313	234324	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006368	TCAACA	2	12	244728	244739	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006368	ATTTCA	2	12	253448	253459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_006368	TTATTT	2	12	269781	269792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006368	GTGCAT	2	12	271529	271540	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_006368	ACTATT	2	12	284248	284259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_006368	CATTTG	2	12	434895	434906	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006368	TGAAAT	2	12	436765	436776	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006368	ATTTAA	2	12	440754	440765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006368	TTTTGA	2	12	507698	507709	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006368	TTATTT	2	12	548080	548091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006368	CTTGGT	2	12	582627	582638	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_006368	GATTAA	2	12	583796	583807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006368	TTAAAT	2	12	584922	584933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006368	TAAAAT	2	12	599119	599130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006368	AATCAA	2	12	657612	657623	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_006368	TTTAAA	2	12	662812	662823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006368	CATTTG	2	12	677443	677454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_006368	TGAAAT	2	12	679313	679324	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006368	TAAAAT	2	12	687722	687733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006368	AAAAGG	2	12	741801	741812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006368	GATAGC	2	12	797853	797864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_006368	AAATGG	2	12	954329	954340	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006368	TAAAAA	2	12	963227	963238	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006368	TTTTTA	2	12	995093	995104	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006368	TCCTGT	2	12	1005853	1005864	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006368	GCCTGA	2	12	1006122	1006133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006368	AAAGAG	2	12	1076627	1076638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006368	TTTCGT	2	12	1093764	1093775	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_006368	AAGTGC	2	12	1095003	1095014	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_006368	AGAAAT	2	12	1095153	1095164	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006368	TTAAAA	2	12	1148233	1148244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006368	ATTTTT	2	12	1158568	1158579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006368	TTTTTG	2	12	1159992	1160003	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006368	ATTTTC	2	12	1169767	1169778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_006368	ATTTTA	2	12	1171576	1171587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006368	CTTGCA	2	12	1175575	1175586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006368	TATAAA	2	12	1177292	1177303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006368	CTTTAT	2	12	1202883	1202894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_006368	TCTTTT	2	12	1212669	1212680	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_006368	TCAACA	2	12	1213185	1213196	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006368	AATAAA	2	12	1233469	1233480	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006368	TGTTTT	2	12	1244246	1244257	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006368	GATTTA	2	12	1248961	1248972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006368	TTTTGG	2	12	1331690	1331701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006368	TTTTAT	2	12	1347196	1347207	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006368	GACTTT	2	12	1372045	1372056	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_006368	AATGAT	2	12	1424419	1424430	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006368	ATCATT	2	12	1425625	1425636	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_006368	AAATTG	2	12	1435072	1435083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006368	TAAAAA	2	12	1466669	1466680	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006368	TTAAAA	2	12	1470903	1470914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006368	TAAAAA	2	12	1474833	1474844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006368	TTTTTA	2	12	1478631	1478642	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006368	CAGTAC	2	12	1499085	1499096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006368	CAAAAT	2	12	1542636	1542647	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_006368	TTGATA	2	12	1563263	1563274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006368	TAATGC	2	12	1601221	1601232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_006368	GATATT	2	12	1622761	1622772	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006368	AAAATT	2	12	1661631	1661642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006368	TATTTT	2	12	1718520	1718531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006368	TTGACC	2	12	1737500	1737511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006368	AAATAA	2	12	1798939	1798950	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006368	AAAAAT	2	12	1823870	1823881	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006368	AGACTT	2	12	1841341	1841352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006368	TGGCCT	2	12	1989217	1989228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006368	AAAAAT	2	12	2007388	2007399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006368	TCAAAA	2	12	2044253	2044264	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_006368	TAAGCT	2	12	2073557	2073568	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_006368	ACTTTT	2	12	2082802	2082813	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_006368	TGTTAT	2	12	2100470	2100481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006368	TATAAT	2	12	2109071	2109082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006368	ATAAAT	2	12	2123143	2123154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006368	ACAATT	2	12	2128061	2128072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_006368	ATAAAA	2	12	2189731	2189742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006368	TGAATT	2	12	2198396	2198407	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006368	CAGCCC	2	12	2211868	2211879	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_006368	AAATTA	2	12	2215373	2215384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006368	TGTAAT	2	12	2234155	2234166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006368	TCAAGG	2	12	2259950	2259961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_006368	TTTTTA	2	12	2306306	2306317	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006368	TAAATA	2	12	2344258	2344269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006368	ATTCTG	2	12	2360478	2360489	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_006368	AATTTA	2	12	2369309	2369320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006368	TATTAA	2	12	2406933	2406944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006368	TTTATT	2	12	2410879	2410890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006368	CCAAGG	2	12	2474151	2474162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006368	TCAAGG	2	12	2496274	2496285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_006368	AAACAT	2	12	2505198	2505209	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_006368	TCAAAG	2	12	2519670	2519681	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_006368	AAATGA	2	12	2545092	2545103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006368	TAAAAA	2	12	2583984	2583995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006368	AAAGGA	2	12	2714679	2714690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006368	CAATAA	2	12	2715702	2715713	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_006368	GCAATT	2	12	2716208	2716219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_006368	TCATGC	2	12	2716605	2716616	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006368	AACATT	2	12	2745220	2745231	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_006368	TTTAAA	2	12	2751401	2751412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006368	TAAGCG	2	12	2767325	2767336	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_006368	CTTTTT	2	12	2780785	2780796	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_006368	TTTTTA	2	12	2788829	2788840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006368	AAAGAA	2	12	2805881	2805892	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006368	TATTCA	2	12	2822196	2822207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_006368	TTAGTC	2	12	2839868	2839879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_006368	TGAATT	2	12	2948511	2948522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006368	GACAGG	2	12	2950190	2950201	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_006368	TAAAAC	2	12	2951917	2951928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_006368	AGAAAC	2	12	2989557	2989568	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_006368	GAATAA	2	12	3050106	3050117	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006368	TATTTG	2	12	3082480	3082491	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006368	ATCAAG	2	12	3110976	3110987	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_006368	AAAATC	2	12	3134329	3134340	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_006368	AGGGTA	2	12	3134360	3134371	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006368	TTCTGA	2	12	3143154	3143165	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_006368	ATAAAA	2	12	3150428	3150439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006368	ATACTA	2	12	3163526	3163537	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_006368	TCCTTA	2	12	3172410	3172421	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006368	ATTTCA	2	12	3185934	3185945	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_006368	CAAATG	2	12	3187804	3187815	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_006368	AAACGT	2	12	3198777	3198788	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_006368	TTATTT	2	12	3229099	3229110	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006368	GCAATA	2	12	3247171	3247182	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_006368	TTATCT	2	12	3260238	3260249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_006368	CCTATT	2	12	3264136	3264147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006368	TCATTT	2	12	3266501	3266512	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_006368	CAAGGT	2	12	3285983	3285994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_006368	CAAGGT	2	12	3359189	3359200	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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141	NC_006368	AATTAT	2	12	3382048	3382059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006368	TTTTCT	2	12	3387128	3387139	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_006368	ATTATA	2	12	3391900	3391911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_006368	TTTAAA	2	12	3397853	3397864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006368	ATTTAT	2	12	3402588	3402599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006368	TAAAAA	2	12	3420944	3420955	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_006368	GCTCTT	2	12	3431666	3431677	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_006368	CTTATT	2	12	3465397	3465408	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.