MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila str. Paris

Total Repeats: 1002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006368	AATGGC	2	12	1382	1393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54295984
2	NC_006368	TGATAG	2	12	3386	3397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54295986
3	NC_006368	TATTCA	2	12	7855	7866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54295988
4	NC_006368	CAATAA	2	12	9249	9260	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54295989
5	NC_006368	CAAAGA	2	12	17298	17309	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	54295996
6	NC_006368	TTTATG	2	12	27281	27292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54296005
7	NC_006368	TTTTGC	2	12	29357	29368	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54296006
8	NC_006368	TTATTT	2	12	31888	31899	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54296009
9	NC_006368	TTTTGA	2	12	48875	48886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54296024
10	NC_006368	TAGATT	2	12	51738	51749	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54296028
11	NC_006368	TTGTGC	2	12	52878	52889	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	54296029
12	NC_006368	CTTAGT	2	12	55129	55140	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54296032
13	NC_006368	ATGGAT	2	12	55337	55348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54296033
14	NC_006368	TTGGAG	2	12	56352	56363	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54296033
15	NC_006368	CTCCTG	2	12	59472	59483	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	54296037
16	NC_006368	TCACTG	2	12	60341	60352	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54296038
17	NC_006368	TTTCTT	2	12	60756	60767	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	54296039
18	NC_006368	GGGTAT	2	12	62160	62171	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54296040
19	NC_006368	TGCAGC	2	12	65818	65829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54296045
20	NC_006368	GCCATT	2	12	67281	67292	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54296047
21	NC_006368	TATACT	2	12	67388	67399	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54296047
22	NC_006368	ATCTTT	2	12	70106	70117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54296050
23	NC_006368	ATAGAT	2	12	70700	70711	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54296050
24	NC_006368	TTATAT	2	12	75921	75932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54296057
25	NC_006368	TGAGCG	2	12	76637	76648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54296058
26	NC_006368	GACAAA	2	12	76839	76850	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	54296058
27	NC_006368	GAATCA	2	12	77327	77338	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54296059
28	NC_006368	TTGATA	2	12	79275	79286	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54296059
29	NC_006368	CAGAGC	2	12	82358	82369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54296061
30	NC_006368	TTGGCT	2	12	82427	82438	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	54296061
31	NC_006368	GGATTG	2	12	85832	85843	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54296067
32	NC_006368	AAAAGT	2	12	87464	87475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54296068
33	NC_006368	ATGCTC	2	12	88585	88596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54296068
34	NC_006368	TTTTGA	2	12	93103	93114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54296072
35	NC_006368	CGATGA	2	12	93133	93144	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296072
36	NC_006368	CAACGC	2	12	100557	100568	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	54296079
37	NC_006368	AAACCA	2	12	105242	105253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54296082
38	NC_006368	GGATTT	2	12	108025	108036	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	54296086
39	NC_006368	ATCCCG	2	12	113674	113685	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54296088
40	NC_006368	TTGCAA	2	12	117337	117348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54296091
41	NC_006368	ATATGA	2	12	123578	123589	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54296095
42	NC_006368	GTTTCT	2	12	125331	125342	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54296097
43	NC_006368	TTGCTT	2	12	125530	125541	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54296097
44	NC_006368	TAAGAA	2	12	129708	129719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54296101
45	NC_006368	AGGAAA	2	12	132135	132146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54296104
46	NC_006368	ATGACT	2	12	133202	133213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54296104
47	NC_006368	AGTTTT	2	12	133909	133920	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54296105
48	NC_006368	CAACAG	2	12	142207	142218	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54296109
49	NC_006368	CATTTC	2	12	144573	144584	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	54296111
50	NC_006368	TTTAAT	2	12	149550	149561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54296116
51	NC_006368	GGTTAT	2	12	152573	152584	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	54296120
52	NC_006368	AAAAAT	2	12	155286	155297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54296121
53	NC_006368	CAGTTT	2	12	157152	157163	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54296122
54	NC_006368	ATAAAT	2	12	167261	167272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54296131
55	NC_006368	ATTTTT	2	12	167642	167653	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54296131
56	NC_006368	CTCTTT	2	12	172088	172099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54296131
57	NC_006368	AGTATA	2	12	178069	178080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54296135
58	NC_006368	TTTTAA	2	12	179413	179424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54296136
59	NC_006368	GAAAAA	2	12	179454	179465	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	54296136
60	NC_006368	GCCATG	2	12	181821	181832	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54296137
61	NC_006368	TTAAAA	2	12	184999	185010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54296138
62	NC_006368	TTTGAA	2	12	185841	185852	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54296138
63	NC_006368	CTCTTG	2	12	186949	186960	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	54296138
64	NC_006368	GAAAAT	2	12	187838	187849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54296138
65	NC_006368	GCCAAA	2	12	189651	189662	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54296141
66	NC_006368	ACAAGA	2	12	195425	195436	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	54296145
67	NC_006368	TATTTG	2	12	198003	198014	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54296148
68	NC_006368	ACCCAA	2	12	206000	206011	50 %	0 %	0 %	50 %	54296157
69	NC_006368	TGAGCT	2	12	207946	207957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54296159
70	NC_006368	CTTTGC	2	12	208589	208600	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	54296160
71	NC_006368	TTTAAT	2	12	213155	213166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54296164
72	NC_006368	CAAACG	2	12	216624	216635	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54296170
73	NC_006368	ATAGAT	2	12	224515	224526	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54296175
74	NC_006368	TGTTCT	2	12	241423	241434	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54296189
75	NC_006368	AGGAAA	2	12	242997	243008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54296191
76	NC_006368	GTAATC	2	12	247364	247375	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54296195
77	NC_006368	ATAAGG	2	12	248553	248564	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	54296197
78	NC_006368	ATTAAT	2	12	253120	253131	50 %	50 %	0 %	0 %	54296202
79	NC_006368	TGACTT	2	12	255376	255387	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54296205
80	NC_006368	TATCAT	2	12	258243	258254	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54296209
81	NC_006368	GGGGAT	2	12	262178	262189	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	54296212
82	NC_006368	CTTGGG	2	12	263491	263502	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54296213
83	NC_006368	AATTGA	2	12	279851	279862	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54296226
84	NC_006368	ATTGAT	2	12	280281	280292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54296226
85	NC_006368	TCACTG	2	12	288295	288306	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54296231
86	NC_006368	TAGCGA	2	12	288449	288460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296231
87	NC_006368	TTATAC	2	12	289903	289914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54296232
88	NC_006368	CCCTTG	2	12	292280	292291	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	54296234
89	NC_006368	AGAACA	2	12	294492	294503	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	54296237
90	NC_006368	TTCTAC	2	12	295175	295186	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	54296237
91	NC_006368	ATTCAA	2	12	302349	302360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54296241
92	NC_006368	ATTTTT	2	12	305986	305997	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54296244
93	NC_006368	CTCCTA	2	12	306625	306636	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	54296245
94	NC_006368	GCTCAC	2	12	310956	310967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54296251
95	NC_006368	ACATGT	2	12	314211	314222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54296254
96	NC_006368	CCAAAA	2	12	315530	315541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54296254
97	NC_006368	ATTGGG	2	12	317431	317442	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54296256
98	NC_006368	AGCAAG	2	12	317681	317692	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	54296256
99	NC_006368	AAAATT	2	12	319740	319751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54296258
100	NC_006368	TGTCAT	2	12	322131	322142	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54296260
101	NC_006368	AAAAGC	2	12	323026	323037	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	54296260
102	NC_006368	TTATCA	2	12	328554	328565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54296265
103	NC_006368	TGCCCA	2	12	337164	337175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54296272
104	NC_006368	ACTTCC	2	12	337287	337298	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	54296272
105	NC_006368	AATGAA	2	12	340073	340084	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54296274
106	NC_006368	CACTTT	2	12	341725	341736	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	54296275
107	NC_006368	AGGGTC	2	12	359586	359597	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54296286
108	NC_006368	TCTTTA	2	12	364363	364374	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54296290
109	NC_006368	TCCTGT	2	12	365905	365916	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	54296291
110	NC_006368	ATTTAA	2	12	370221	370232	50 %	50 %	0 %	0 %	54296296
111	NC_006368	TTTTTC	2	12	370396	370407	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	54296297
112	NC_006368	GATACC	2	12	372107	372118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54296298
113	NC_006368	TCAGTG	2	12	375626	375637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54296300
114	NC_006368	TTTATC	2	12	386208	386219	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54296312
115	NC_006368	ATCAAT	2	12	388919	388930	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54296315
116	NC_006368	TGAAAA	2	12	390251	390262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54296315
117	NC_006368	ATAAAA	2	12	390842	390853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54296316
118	NC_006368	GAAAAA	2	12	394028	394039	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	54296320
119	NC_006368	TGGATG	2	12	398914	398925	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54296321
120	NC_006368	TGCCAT	2	12	401334	401345	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54296324
121	NC_006368	AATTCC	2	12	401473	401484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54296324
122	NC_006368	TCATAA	2	12	402266	402277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54296324
123	NC_006368	TGTGTC	2	12	406068	406079	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	54296327
124	NC_006368	TTTAAT	2	12	407167	407178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54296328
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156	NC_006368	GCAAGA	2	12	508635	508646	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	54296430
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230	NC_006368	ATGCGA	2	12	758172	758183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
231	NC_006368	ATGCGA	2	12	758721	758732	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
232	NC_006368	ATGCGA	2	12	759270	759281	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
233	NC_006368	ATGCGA	2	12	759819	759830	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
234	NC_006368	ATGCGA	2	12	763662	763673	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
235	NC_006368	ATGCGA	2	12	764760	764771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
236	NC_006368	ATGCGA	2	12	765309	765320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
237	NC_006368	ATGCGA	2	12	765858	765869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
238	NC_006368	ATGCGA	2	12	766956	766967	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
239	NC_006368	ATGCGA	2	12	767505	767516	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
240	NC_006368	ATGCGA	2	12	768054	768065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
241	NC_006368	ATGCGA	2	12	768603	768614	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
242	NC_006368	ATGCGA	2	12	769152	769163	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
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245	NC_006368	ATGCGA	2	12	770799	770810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54296668
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339	NC_006368	AAAACT	2	12	1098381	1098392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54296952
340	NC_006368	TATTTT	2	12	1103092	1103103	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54296955
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342	NC_006368	CTATTT	2	12	1110285	1110296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54296961
343	NC_006368	TTTCCA	2	12	1110798	1110809	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	54296961
344	NC_006368	TTCCTT	2	12	1111930	1111941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54296961
345	NC_006368	ATCCTG	2	12	1119848	1119859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54296967
346	NC_006368	ATCTGC	2	12	1122096	1122107	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54296968
347	NC_006368	AATGTC	2	12	1122645	1122656	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54296969
348	NC_006368	AAAAAG	2	12	1123018	1123029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	54296969
349	NC_006368	AGAGCA	2	12	1125137	1125148	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	54296971
350	NC_006368	TCCAAT	2	12	1127781	1127792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54296974
351	NC_006368	GTTGAT	2	12	1129002	1129013	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	54296974
352	NC_006368	GCACTG	2	12	1129623	1129634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54296975
353	NC_006368	AGGCAA	2	12	1138367	1138378	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	54296979
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355	NC_006368	GCTATG	2	12	1141211	1141222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54296981
356	NC_006368	GTAGGG	2	12	1142968	1142979	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	54296982
357	NC_006368	GGAAGA	2	12	1146793	1146804	50 %	0 %	50 %	0 %	54296984
358	NC_006368	TTTATA	2	12	1148536	1148547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54296985
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360	NC_006368	TTTGGT	2	12	1154182	1154193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54296989
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362	NC_006368	TCTTGG	2	12	1159368	1159379	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	54296992
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367	NC_006368	GCTTGT	2	12	1185464	1185475	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	54297018
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375	NC_006368	GATCCT	2	12	1205432	1205443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54297047
376	NC_006368	GCTGAT	2	12	1227959	1227970	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54297063
377	NC_006368	CTAAAG	2	12	1228757	1228768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54297064
378	NC_006368	ATAGTG	2	12	1230490	1230501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54297064
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380	NC_006368	AACAGC	2	12	1239909	1239920	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54297072
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440	NC_006368	AATATT	2	12	1454343	1454354	50 %	50 %	0 %	0 %	54297260
441	NC_006368	TTAATG	2	12	1467053	1467064	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54297267
442	NC_006368	AATTTA	2	12	1475268	1475279	50 %	50 %	0 %	0 %	54297277
443	NC_006368	CTTGTT	2	12	1478896	1478907	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54297279
444	NC_006368	GGCAAT	2	12	1483282	1483293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54297284
445	NC_006368	TTAATT	2	12	1484625	1484636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54297284
446	NC_006368	AATGAC	2	12	1488220	1488231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54297288
447	NC_006368	ACTCAC	2	12	1492272	1492283	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	54297290
448	NC_006368	ATCCTT	2	12	1492356	1492367	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	54297291
449	NC_006368	CATTGG	2	12	1494855	1494866	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54297293
450	NC_006368	TCTTTA	2	12	1503494	1503505	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54297304
451	NC_006368	AATGAA	2	12	1509302	1509313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54297311
452	NC_006368	CTGTTG	2	12	1510919	1510930	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	54297313
453	NC_006368	TTTTTA	2	12	1511794	1511805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54297314
454	NC_006368	AAATTA	2	12	1517881	1517892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54297318
455	NC_006368	GGTTCC	2	12	1520022	1520033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54297320
456	NC_006368	GGTACA	2	12	1521474	1521485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54297321
457	NC_006368	GCTCAA	2	12	1523869	1523880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54297324
458	NC_006368	TGGCAT	2	12	1526730	1526741	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54297326
459	NC_006368	TTTGAA	2	12	1528505	1528516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54297327
460	NC_006368	GGCAAA	2	12	1529163	1529174	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	54297327
461	NC_006368	TAAAAC	2	12	1539593	1539604	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54297336
462	NC_006368	CTTGGC	2	12	1541400	1541411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54297336
463	NC_006368	CAATGG	2	12	1542444	1542455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54297338
464	NC_006368	ATAATC	2	12	1545330	1545341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54297342
465	NC_006368	AACGCT	2	12	1548850	1548861	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54297346
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468	NC_006368	ATGGTG	2	12	1562417	1562428	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54297359
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489	NC_006368	GGGTGA	2	12	1626550	1626561	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	54297414
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491	NC_006368	TCCAAA	2	12	1633855	1633866	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	54297419
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493	NC_006368	AGAAAT	2	12	1637952	1637963	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54297422
494	NC_006368	TTGCTC	2	12	1644528	1644539	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	54297428
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497	NC_006368	TTGATC	2	12	1654163	1654174	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54297436
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499	NC_006368	TTGTTC	2	12	1670565	1670576	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54297451
500	NC_006368	AGCTCA	2	12	1675288	1675299	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54297456

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