MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006366	GAAGG	2	10	1124	1133	40 %	0 %	60 %	0 %	54292908
2	NC_006366	CAGTA	2	10	1146	1155	40 %	20 %	20 %	20 %	54292908
3	NC_006366	TTTGG	2	10	2394	2403	0 %	60 %	40 %	0 %	54292909
4	NC_006366	AGGAT	2	10	3021	3030	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006366	ATATT	2	10	3926	3935	40 %	60 %	0 %	0 %	54292910
6	NC_006366	AAATC	2	10	10443	10452	60 %	20 %	0 %	20 %	54292916
7	NC_006366	TTCCA	2	10	12297	12306	20 %	40 %	0 %	40 %	54292919
8	NC_006366	CTTTA	2	10	14738	14747	20 %	60 %	0 %	20 %	54292924
9	NC_006366	GAAGA	2	10	16480	16489	60 %	0 %	40 %	0 %	54292925
10	NC_006366	AGCCA	2	10	17701	17710	40 %	0 %	20 %	40 %	54292926
11	NC_006366	ACAGC	2	10	19669	19678	40 %	0 %	20 %	40 %	54292927
12	NC_006366	TGTTA	2	10	21400	21409	20 %	60 %	20 %	0 %	54292930
13	NC_006366	CTGAA	2	10	24679	24688	40 %	20 %	20 %	20 %	54292933
14	NC_006366	CTGAA	2	10	25116	25125	40 %	20 %	20 %	20 %	54292934
15	NC_006366	AAGGT	2	10	25503	25512	40 %	20 %	40 %	0 %	54292934
16	NC_006366	TGGCG	2	10	26982	26991	0 %	20 %	60 %	20 %	54292935
17	NC_006366	TGGTT	2	10	27408	27417	0 %	60 %	40 %	0 %	54292935
18	NC_006366	ACGAG	2	10	28530	28539	40 %	0 %	40 %	20 %	54292935
19	NC_006366	GCTAT	2	10	29089	29098	20 %	40 %	20 %	20 %	54292936
20	NC_006366	CTTTG	2	10	29988	29997	0 %	60 %	20 %	20 %	54292937
21	NC_006366	TTTTA	2	10	30000	30009	20 %	80 %	0 %	0 %	54292937
22	NC_006366	TATCC	2	10	31195	31204	20 %	40 %	0 %	40 %	54292937
23	NC_006366	ACTCA	2	10	31266	31275	40 %	20 %	0 %	40 %	54292937
24	NC_006366	TACTG	2	10	32239	32248	20 %	40 %	20 %	20 %	54292938
25	NC_006366	TTACC	2	10	32792	32801	20 %	40 %	0 %	40 %	54292938
26	NC_006366	ATCCC	2	10	33970	33979	20 %	20 %	0 %	60 %	54292938
27	NC_006366	TGTTT	2	10	34989	34998	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006366	ACCCT	2	10	35815	35824	20 %	20 %	0 %	60 %	54292941
29	NC_006366	CCAGT	2	10	37064	37073	20 %	20 %	20 %	40 %	54292943
30	NC_006366	AGCGA	2	10	38090	38099	40 %	0 %	40 %	20 %	54292944
31	NC_006366	GAATT	2	10	39378	39387	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006366	AGATG	2	10	39463	39472	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006366	TCATT	2	10	39670	39679	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_006366	AATTT	2	10	43032	43041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006366	TTGCT	2	10	44514	44523	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_006366	GTGGC	2	10	48194	48203	0 %	20 %	60 %	20 %	54292954
37	NC_006366	TCTCA	2	10	49257	49266	20 %	40 %	0 %	40 %	54292955
38	NC_006366	TGGGA	2	10	50314	50323	20 %	20 %	60 %	0 %	54292956
39	NC_006366	TGGAA	2	10	51048	51057	40 %	20 %	40 %	0 %	54292957
40	NC_006366	ATTAA	2	10	51073	51082	60 %	40 %	0 %	0 %	54292957
41	NC_006366	ATTGA	2	10	55123	55132	40 %	40 %	20 %	0 %	54292959
42	NC_006366	ATAAG	2	10	56397	56406	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006366	TTCAG	2	10	56863	56872	20 %	40 %	20 %	20 %	54292961

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.