MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006366	ATA	2	6	208	213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006366	CTG	2	6	2826	2831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006366	TAT	2	6	2909	2914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006366	AAT	2	6	2922	2927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006366	TTA	2	6	2956	2961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006366	AAT	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006366	TTA	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006366	TAT	2	6	5685	5690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006366	TAT	2	6	5697	5702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006366	ATT	3	9	5804	5812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006366	GCT	2	6	8339	8344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006366	GTT	2	6	8373	8378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006366	CAC	2	6	8390	8395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_006366	ATG	2	6	11892	11897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006366	AAT	2	6	12149	12154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006366	AGA	2	6	12159	12164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006366	TAA	2	6	12398	12403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006366	ATA	2	6	12460	12465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006366	TAA	2	6	13250	13255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006366	GGA	2	6	13623	13628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006366	TTG	2	6	16594	16599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006366	GTT	2	6	16684	16689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006366	TGA	2	6	16727	16732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006366	CAA	2	6	16741	16746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006366	ATG	2	6	16761	16766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006366	ATA	2	6	16777	16782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006366	GGA	2	6	16850	16855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006366	AGG	2	6	34415	34420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006366	ATT	2	6	34838	34843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006366	ATG	2	6	34952	34957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006366	TGT	2	6	35086	35091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006366	AAG	2	6	35117	35122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006366	TGA	2	6	35181	35186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006366	TAT	2	6	35928	35933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006366	ATA	2	6	36255	36260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006366	TTA	2	6	36419	36424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006366	AAC	2	6	36703	36708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006366	ACT	2	6	37865	37870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006366	TGA	3	9	37881	37889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006366	GCT	2	6	37900	37905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006366	TGT	2	6	38135	38140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006366	AGT	2	6	38213	38218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006366	AGG	2	6	38275	38280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006366	ATT	2	6	38336	38341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006366	TTA	3	9	38455	38463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006366	GAG	2	6	38550	38555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006366	TTA	2	6	38643	38648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006366	CTA	2	6	39391	39396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006366	AAC	2	6	39474	39479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006366	TAT	2	6	39525	39530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006366	CAA	2	6	39602	39607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006366	AAT	2	6	39613	39618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006366	GTT	2	6	39699	39704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006366	GCC	2	6	41395	41400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_006366	ATC	2	6	41981	41986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006366	TCA	2	6	41987	41992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006366	TAT	2	6	42016	42021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006366	ATT	2	6	42034	42039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006366	TAA	2	6	42125	42130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006366	TAT	2	6	42846	42851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006366	AAT	2	6	42869	42874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006366	AAC	2	6	42920	42925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006366	TCA	2	6	42946	42951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006366	GTA	2	6	42953	42958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006366	ATT	2	6	42997	43002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006366	TCA	2	6	43022	43027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006366	TGC	2	6	43241	43246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006366	ATA	2	6	43269	43274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006366	AGA	2	6	43364	43369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006366	CGG	2	6	43687	43692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006366	GCT	2	6	43823	43828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006366	TGC	2	6	43980	43985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006366	CGG	2	6	44106	44111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006366	TGC	2	6	44167	44172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006366	CCG	2	6	44203	44208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_006366	CTA	2	6	44281	44286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006366	ATT	2	6	44333	44338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006366	TGG	2	6	44640	44645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006366	GCT	2	6	44700	44705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006366	CAC	2	6	44827	44832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_006366	ATT	2	6	44952	44957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006366	TTC	2	6	45114	45119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006366	ATG	2	6	45287	45292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006366	ACC	2	6	45702	45707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_006366	ATT	2	6	46208	46213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006366	TAC	2	6	46269	46274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006366	ATT	2	6	46392	46397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006366	AAT	2	6	46630	46635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006366	ATA	2	6	54906	54911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006366	TTA	2	6	54915	54920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006366	ATA	2	6	54921	54926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006366	AAT	2	6	54935	54940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006366	TAT	2	6	54982	54987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006366	CAA	2	6	55058	55063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006366	TAG	2	6	55371	55376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006366	GAT	2	6	56460	56465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006366	GGC	2	6	56574	56579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006366	ATG	3	9	56683	56691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006366	TGC	2	6	56753	56758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006366	TAA	2	6	56773	56778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006366	ATT	2	6	58697	58702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006366	AAT	2	6	59430	59435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006366	ATC	2	6	59607	59612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006366	ATA	2	6	59646	59651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006366	CAA	2	6	59715	59720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.