MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila str. Paris plasmid pLPP

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006365	AATTTT	2	12	1211	1222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006365	AAAGAA	2	12	4545	4556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	54295847
3	NC_006365	ATAAAA	2	12	9334	9345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54295852
4	NC_006365	TCATTT	2	12	9853	9864	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54295853
5	NC_006365	TTTGAT	2	12	14573	14584	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54295858
6	NC_006365	CTATTC	2	12	14830	14841	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	54295859
7	NC_006365	TGTCTT	2	12	19981	19992	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54295868
8	NC_006365	ACCAAT	2	12	22754	22765	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	54295871
9	NC_006365	CTCAAT	2	12	27844	27855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54295876
10	NC_006365	CCCAAA	2	12	28711	28722	50 %	0 %	0 %	50 %	54295876
11	NC_006365	TCCTAA	2	12	29890	29901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54295877
12	NC_006365	TTTGCT	2	12	32855	32866	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	54295880
13	NC_006365	CGGAAC	2	12	36729	36740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54295881
14	NC_006365	TGATTA	2	12	39217	39228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54295882
15	NC_006365	TGCTCA	2	12	40555	40566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54295882
16	NC_006365	TAATAG	2	12	45278	45289	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006365	GAATAT	2	12	45691	45702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54295889
18	NC_006365	TACCAA	2	12	50457	50468	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	54295894
19	NC_006365	GATAAA	2	12	59647	59658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54295905
20	NC_006365	GCACAT	2	12	64829	64840	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54295910
21	NC_006365	CATTGC	2	12	64924	64935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54295910
22	NC_006365	TCCTAA	2	12	71207	71218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54295917
23	NC_006365	GAAGAG	2	12	72687	72698	50 %	0 %	50 %	0 %	54295917
24	NC_006365	CAATAG	2	12	72988	72999	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54295917
25	NC_006365	GATTGC	2	12	74893	74904	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54295919
26	NC_006365	AAATAA	2	12	80713	80724	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54295924
27	NC_006365	GGGTAC	2	12	90816	90827	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54295938
28	NC_006365	TCAATT	2	12	93518	93529	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54295940
29	NC_006365	CCAGAT	2	12	94103	94114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54295941
30	NC_006365	GTCATT	2	12	111326	111337	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	54295959
31	NC_006365	AAATCA	2	12	112251	112262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_006365	AAAGGA	2	12	114216	114227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54295962
33	NC_006365	TGAGGC	2	12	119933	119944	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54295969
34	NC_006365	AGTTAA	2	12	122707	122718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54295972
35	NC_006365	TTTTGC	2	12	129361	129372	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_006365	TCTCTT	2	12	130316	130327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006365	TCAGGC	2	12	130684	130695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006365	ATCTAA	2	12	131328	131339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.