MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila str. Paris plasmid pLPP

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006365	ACTCC	2	10	201	210	20 %	20 %	0 %	60 %	54295844
2	NC_006365	AAGCG	2	10	445	454	40 %	0 %	40 %	20 %	54295844
3	NC_006365	AACGT	2	10	2520	2529	40 %	20 %	20 %	20 %	54295846
4	NC_006365	GAAGA	2	10	3287	3296	60 %	0 %	40 %	0 %	54295846
5	NC_006365	TAAGC	2	10	4487	4496	40 %	20 %	20 %	20 %	54295847
6	NC_006365	TATCA	2	10	4802	4811	40 %	40 %	0 %	20 %	54295847
7	NC_006365	TATTT	2	10	5668	5677	20 %	80 %	0 %	0 %	54295849
8	NC_006365	TTAAT	2	10	6114	6123	40 %	60 %	0 %	0 %	54295849
9	NC_006365	CTTTT	2	10	7716	7725	0 %	80 %	0 %	20 %	54295850
10	NC_006365	TGATT	2	10	8255	8264	20 %	60 %	20 %	0 %	54295851
11	NC_006365	GGTAA	2	10	8487	8496	40 %	20 %	40 %	0 %	54295852
12	NC_006365	GATTC	2	10	9886	9895	20 %	40 %	20 %	20 %	54295853
13	NC_006365	CATAT	2	10	10160	10169	40 %	40 %	0 %	20 %	54295853
14	NC_006365	AGTGG	2	10	11266	11275	20 %	20 %	60 %	0 %	54295854
15	NC_006365	AAATC	2	10	13001	13010	60 %	20 %	0 %	20 %	54295856
16	NC_006365	GTAGG	2	10	14728	14737	20 %	20 %	60 %	0 %	54295859
17	NC_006365	AGTGG	2	10	15885	15894	20 %	20 %	60 %	0 %	54295861
18	NC_006365	TGCAA	2	10	17695	17704	40 %	20 %	20 %	20 %	54295863
19	NC_006365	CAAAG	2	10	19798	19807	60 %	0 %	20 %	20 %	54295867
20	NC_006365	TGGCT	2	10	20692	20701	0 %	40 %	40 %	20 %	54295869
21	NC_006365	GATGC	2	10	21488	21497	20 %	20 %	40 %	20 %	54295869
22	NC_006365	AAACC	2	10	21525	21534	60 %	0 %	0 %	40 %	54295869
23	NC_006365	TGCAA	2	10	28825	28834	40 %	20 %	20 %	20 %	54295876
24	NC_006365	AAATT	2	10	28938	28947	60 %	40 %	0 %	0 %	54295876
25	NC_006365	TGATG	2	10	30049	30058	20 %	40 %	40 %	0 %	54295877
26	NC_006365	AATGA	2	10	32540	32549	60 %	20 %	20 %	0 %	54295880
27	NC_006365	GCGCT	2	10	35885	35894	0 %	20 %	40 %	40 %	54295881
28	NC_006365	CACAC	2	10	37814	37823	40 %	0 %	0 %	60 %	54295882
29	NC_006365	TGGGT	2	10	40075	40084	0 %	40 %	60 %	0 %	54295882
30	NC_006365	AATTA	2	10	42871	42880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006365	TTTGA	2	10	43167	43176	20 %	60 %	20 %	0 %	54295883
32	NC_006365	TTATT	2	10	44223	44232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006365	TTATA	2	10	44633	44642	40 %	60 %	0 %	0 %	54295886
34	NC_006365	ATAAA	2	10	44952	44961	80 %	20 %	0 %	0 %	54295887
35	NC_006365	TTGCA	2	10	45144	45153	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_006365	ATTTC	2	10	46856	46865	20 %	60 %	0 %	20 %	54295891
37	NC_006365	CAATC	2	10	47090	47099	40 %	20 %	0 %	40 %	54295891
38	NC_006365	AAAGG	2	10	47300	47309	60 %	0 %	40 %	0 %	54295891
39	NC_006365	GTTAC	2	10	47585	47594	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_006365	TATAA	2	10	47656	47665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006365	AAGAA	2	10	48276	48285	80 %	0 %	20 %	0 %	54295892
42	NC_006365	TGCGA	2	10	48758	48767	20 %	20 %	40 %	20 %	54295893
43	NC_006365	AAGTT	2	10	50036	50045	40 %	40 %	20 %	0 %	54295894
44	NC_006365	CTTCG	2	10	51759	51768	0 %	40 %	20 %	40 %	54295894
45	NC_006365	AAAAT	2	10	52202	52211	80 %	20 %	0 %	0 %	54295894
46	NC_006365	GATTG	2	10	52425	52434	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006365	AATCA	2	10	53297	53306	60 %	20 %	0 %	20 %	54295896
48	NC_006365	AAATC	2	10	54131	54140	60 %	20 %	0 %	20 %	54295896
49	NC_006365	TTTAA	2	10	54957	54966	40 %	60 %	0 %	0 %	54295897
50	NC_006365	TCATT	2	10	55266	55275	20 %	60 %	0 %	20 %	54295897
51	NC_006365	CAATC	2	10	56215	56224	40 %	20 %	0 %	40 %	54295898
52	NC_006365	TTTCA	2	10	56659	56668	20 %	60 %	0 %	20 %	54295899
53	NC_006365	AAAAT	2	10	57045	57054	80 %	20 %	0 %	0 %	54295899
54	NC_006365	TCGTT	2	10	57937	57946	0 %	60 %	20 %	20 %	54295902
55	NC_006365	TACAC	2	10	58740	58749	40 %	20 %	0 %	40 %	54295904
56	NC_006365	TTATT	2	10	59082	59091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006365	TTATG	2	10	59798	59807	20 %	60 %	20 %	0 %	54295905
58	NC_006365	TTTGC	2	10	61055	61064	0 %	60 %	20 %	20 %	54295907
59	NC_006365	ATCAA	2	10	61262	61271	60 %	20 %	0 %	20 %	54295907
60	NC_006365	TTAAA	2	10	62801	62810	60 %	40 %	0 %	0 %	54295909
61	NC_006365	TATTT	2	10	63967	63976	20 %	80 %	0 %	0 %	54295910
62	NC_006365	AAAGA	2	10	64185	64194	80 %	0 %	20 %	0 %	54295910
63	NC_006365	TTGTT	2	10	64203	64212	0 %	80 %	20 %	0 %	54295910
64	NC_006365	AGGCA	2	10	64396	64405	40 %	0 %	40 %	20 %	54295910
65	NC_006365	GAATT	2	10	64488	64497	40 %	40 %	20 %	0 %	54295910
66	NC_006365	TGGCT	2	10	66188	66197	0 %	40 %	40 %	20 %	54295912
67	NC_006365	TCCAT	2	10	69663	69672	20 %	40 %	0 %	40 %	54295916
68	NC_006365	AAACA	2	10	69852	69861	80 %	0 %	0 %	20 %	54295916
69	NC_006365	CATGG	2	10	70028	70037	20 %	20 %	40 %	20 %	54295916
70	NC_006365	ATTTA	2	10	71000	71009	40 %	60 %	0 %	0 %	54295917
71	NC_006365	AAAAG	2	10	73475	73484	80 %	0 %	20 %	0 %	54295917
72	NC_006365	GATTT	2	10	77422	77431	20 %	60 %	20 %	0 %	54295921
73	NC_006365	TACGT	2	10	78352	78361	20 %	40 %	20 %	20 %	54295921
74	NC_006365	CATTA	2	10	79323	79332	40 %	40 %	0 %	20 %	54295922
75	NC_006365	ATTTT	2	10	83029	83038	20 %	80 %	0 %	0 %	54295926
76	NC_006365	ATAAA	2	10	83360	83369	80 %	20 %	0 %	0 %	54295926
77	NC_006365	ATCTA	2	10	84897	84906	40 %	40 %	0 %	20 %	54295930
78	NC_006365	TATTT	2	10	85263	85272	20 %	80 %	0 %	0 %	54295930
79	NC_006365	AACCA	2	10	85743	85752	60 %	0 %	0 %	40 %	54295931
80	NC_006365	TCTTT	2	10	89167	89176	0 %	80 %	0 %	20 %	54295935
81	NC_006365	AATTA	2	10	89751	89760	60 %	40 %	0 %	0 %	54295936
82	NC_006365	GATTT	2	10	92897	92906	20 %	60 %	20 %	0 %	54295939
83	NC_006365	CTATT	2	10	98891	98900	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_006365	ATTGT	2	10	99097	99106	20 %	60 %	20 %	0 %	54295946
85	NC_006365	CATGC	2	10	101642	101651	20 %	20 %	20 %	40 %	54295949
86	NC_006365	CTCTT	2	10	102366	102375	0 %	60 %	0 %	40 %	54295951
87	NC_006365	TTGGA	2	10	103730	103739	20 %	40 %	40 %	0 %	54295952
88	NC_006365	TGATT	2	10	104931	104940	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006365	ATTCC	2	10	105103	105112	20 %	40 %	0 %	40 %	54295953
90	NC_006365	TTTGC	2	10	106816	106825	0 %	60 %	20 %	20 %	54295955
91	NC_006365	AAAAT	2	10	107878	107887	80 %	20 %	0 %	0 %	54295956
92	NC_006365	TCATT	2	10	109197	109206	20 %	60 %	0 %	20 %	54295957
93	NC_006365	TCAAT	2	10	110656	110665	40 %	40 %	0 %	20 %	54295958
94	NC_006365	AAATA	2	10	111520	111529	80 %	20 %	0 %	0 %	54295959
95	NC_006365	AACCA	2	10	113772	113781	60 %	0 %	0 %	40 %	54295961
96	NC_006365	TTTTC	2	10	113983	113992	0 %	80 %	0 %	20 %	54295961
97	NC_006365	GAACA	2	10	114137	114146	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_006365	TTGCT	2	10	114294	114303	0 %	60 %	20 %	20 %	54295962
99	NC_006365	AAATG	2	10	114411	114420	60 %	20 %	20 %	0 %	54295962
100	NC_006365	CATCA	2	10	116928	116937	40 %	20 %	0 %	40 %	54295965
101	NC_006365	TTTTG	2	10	119373	119382	0 %	80 %	20 %	0 %	54295969
102	NC_006365	TAAAA	2	10	119899	119908	80 %	20 %	0 %	0 %	54295969
103	NC_006365	TATTT	2	10	120458	120467	20 %	80 %	0 %	0 %	54295970
104	NC_006365	ATTGT	2	10	122392	122401	20 %	60 %	20 %	0 %	54295972
105	NC_006365	ACTAA	2	10	122939	122948	60 %	20 %	0 %	20 %	54295972
106	NC_006365	CCATC	2	10	124489	124498	20 %	20 %	0 %	60 %	54295975
107	NC_006365	TCCAA	2	10	127678	127687	40 %	20 %	0 %	40 %	54295979
108	NC_006365	TCATT	2	10	128785	128794	20 %	60 %	0 %	20 %	54295980
109	NC_006365	TTTTC	2	10	128812	128821	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_006365	CCGCC	2	10	130994	131003	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.