MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006363	CGCGG	2	10	2202	2211	0 %	0 %	60 %	40 %	54027812
2	NC_006363	GGGTG	2	10	3069	3078	0 %	20 %	80 %	0 %	54027812
3	NC_006363	GGTGT	2	10	6316	6325	0 %	40 %	60 %	0 %	54027818
4	NC_006363	TGGTG	2	10	6348	6357	0 %	40 %	60 %	0 %	54027818
5	NC_006363	CCGCG	2	10	8883	8892	0 %	0 %	40 %	60 %	54027821
6	NC_006363	GCTTC	2	10	9258	9267	0 %	40 %	20 %	40 %	54027822
7	NC_006363	GGCGA	2	10	9447	9456	20 %	0 %	60 %	20 %	54027822
8	NC_006363	CCGCC	2	10	10740	10749	0 %	0 %	20 %	80 %	54027823
9	NC_006363	ACCGC	2	10	11793	11802	20 %	0 %	20 %	60 %	54027823
10	NC_006363	CCCGG	2	10	13104	13113	0 %	0 %	40 %	60 %	54027824
11	NC_006363	AGCCC	2	10	14519	14528	20 %	0 %	20 %	60 %	54027824
12	NC_006363	ACCGC	2	10	14641	14650	20 %	0 %	20 %	60 %	54027824
13	NC_006363	CCGAC	2	10	14882	14891	20 %	0 %	20 %	60 %	54027824
14	NC_006363	GCTCG	2	10	15673	15682	0 %	20 %	40 %	40 %	54027826
15	NC_006363	AGCGA	2	10	19356	19365	40 %	0 %	40 %	20 %	54027831
16	NC_006363	GTTGG	2	10	20393	20402	0 %	40 %	60 %	0 %	54027831
17	NC_006363	ACCCC	2	10	22920	22929	20 %	0 %	0 %	80 %	54027831
18	NC_006363	CCGGT	2	10	24548	24557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_006363	CTGGC	2	10	25330	25339	0 %	20 %	40 %	40 %	54027834
20	NC_006363	TCCGC	2	10	27327	27336	0 %	20 %	20 %	60 %	54027837
21	NC_006363	GATCA	2	10	27353	27362	40 %	20 %	20 %	20 %	54027837
22	NC_006363	GGGCC	2	10	28436	28445	0 %	0 %	60 %	40 %	54027839
23	NC_006363	CCGAC	2	10	29670	29679	20 %	0 %	20 %	60 %	54027840
24	NC_006363	CCTGG	2	10	30592	30601	0 %	20 %	40 %	40 %	54027840
25	NC_006363	GCGCC	2	10	31501	31510	0 %	0 %	40 %	60 %	54027840
26	NC_006363	GTGAG	2	10	31943	31952	20 %	20 %	60 %	0 %	54027841
27	NC_006363	CGTGC	2	10	32357	32366	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_006363	GCCGC	2	10	33853	33862	0 %	0 %	40 %	60 %	54027842
29	NC_006363	CCACC	2	10	34153	34162	20 %	0 %	0 %	80 %	54027843
30	NC_006363	CGACG	2	10	34398	34407	20 %	0 %	40 %	40 %	54027844
31	NC_006363	CACGG	2	10	35382	35391	20 %	0 %	40 %	40 %	54027845
32	NC_006363	CGGGG	2	10	36272	36281	0 %	0 %	80 %	20 %	54027847
33	NC_006363	GGTGG	2	10	36285	36294	0 %	20 %	80 %	0 %	54027847
34	NC_006363	GGGAG	2	10	36562	36571	20 %	0 %	80 %	0 %	54027847
35	NC_006363	CGGTC	2	10	37256	37265	0 %	20 %	40 %	40 %	54027848
36	NC_006363	CGATC	2	10	37298	37307	20 %	20 %	20 %	40 %	54027848
37	NC_006363	GATCA	2	10	39233	39242	40 %	20 %	20 %	20 %	54027848
38	NC_006363	GTGCG	2	10	40787	40796	0 %	20 %	60 %	20 %	54027849
39	NC_006363	CCGCA	2	10	43079	43088	20 %	0 %	20 %	60 %	54027851
40	NC_006363	CCCCA	2	10	43577	43586	20 %	0 %	0 %	80 %	54027852
41	NC_006363	CACGC	2	10	43938	43947	20 %	0 %	20 %	60 %	54027853
42	NC_006363	ACGCG	2	10	44014	44023	20 %	0 %	40 %	40 %	54027853
43	NC_006363	CCTGG	2	10	45987	45996	0 %	20 %	40 %	40 %	54027854
44	NC_006363	CTGAC	2	10	47652	47661	20 %	20 %	20 %	40 %	54027854
45	NC_006363	GGCCG	2	10	49819	49828	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_006363	CCGGC	2	10	54722	54731	0 %	0 %	40 %	60 %	54027864
47	NC_006363	GCGCC	2	10	54961	54970	0 %	0 %	40 %	60 %	54027864
48	NC_006363	GGCCC	2	10	55827	55836	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_006363	CTCAG	2	10	55889	55898	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_006363	GGTGT	2	10	56954	56963	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006363	CGGGG	2	10	57408	57417	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
52	NC_006363	GGCCG	2	10	58882	58891	0 %	0 %	60 %	40 %	54027869
53	NC_006363	CTCCG	2	10	59825	59834	0 %	20 %	20 %	60 %	54027870
54	NC_006363	CTCGA	2	10	59933	59942	20 %	20 %	20 %	40 %	54027870
55	NC_006363	TGCGG	2	10	61353	61362	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_006363	TCGGT	2	10	62481	62490	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_006363	TGCGG	2	10	63841	63850	0 %	20 %	60 %	20 %	54027876
58	NC_006363	CGCGG	2	10	64452	64461	0 %	0 %	60 %	40 %	54027876
59	NC_006363	CGGCG	2	10	65157	65166	0 %	0 %	60 %	40 %	54027876
60	NC_006363	GTCTC	2	10	65300	65309	0 %	40 %	20 %	40 %	54027876
61	NC_006363	CGGGC	2	10	65456	65465	0 %	0 %	60 %	40 %	54027877
62	NC_006363	ACGTC	2	10	67897	67906	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_006363	CCTGG	2	10	67930	67939	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_006363	CGGGC	2	10	68220	68229	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_006363	GTCGG	2	10	68473	68482	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_006363	GGACG	2	10	68881	68890	20 %	0 %	60 %	20 %	54027882
67	NC_006363	GCCGG	2	10	70620	70629	0 %	0 %	60 %	40 %	54027886
68	NC_006363	CCCGG	2	10	71455	71464	0 %	0 %	40 %	60 %	54027887
69	NC_006363	TGCGG	2	10	72347	72356	0 %	20 %	60 %	20 %	54027887
70	NC_006363	CCCAG	2	10	72855	72864	20 %	0 %	20 %	60 %	54027887
71	NC_006363	CCGCG	2	10	73052	73061	0 %	0 %	40 %	60 %	54027888
72	NC_006363	AGCCG	2	10	74524	74533	20 %	0 %	40 %	40 %	54027890
73	NC_006363	GCGCC	2	10	76858	76867	0 %	0 %	40 %	60 %	54027894
74	NC_006363	GCAGC	2	10	77405	77414	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_006363	GTTGG	2	10	77526	77535	0 %	40 %	60 %	0 %	54027895
76	NC_006363	ACCGG	2	10	78448	78457	20 %	0 %	40 %	40 %	54027895
77	NC_006363	CGACC	2	10	79980	79989	20 %	0 %	20 %	60 %	54027897
78	NC_006363	ACCTG	2	10	80342	80351	20 %	20 %	20 %	40 %	54027897
79	NC_006363	GCGCC	2	10	81875	81884	0 %	0 %	40 %	60 %	54027899
80	NC_006363	GCGCT	2	10	85503	85512	0 %	20 %	40 %	40 %	54027901
81	NC_006363	GCCGT	2	10	86523	86532	0 %	20 %	40 %	40 %	54027902

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.