MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006363	CCGT	2	8	4694	4701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006363	GGAG	2	8	5606	5613	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006363	TGCG	2	8	12874	12881	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_006363	CCCG	2	8	15530	15537	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_006363	GCCT	2	8	17640	17647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006363	GCCC	2	8	27636	27643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_006363	CGGG	2	8	27681	27688	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006363	TGGT	2	8	28594	28601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006363	GAAC	2	8	34811	34818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006363	CTGG	2	8	44525	44532	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006363	CAGC	2	8	44923	44930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_006363	GGCT	2	8	51827	51834	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006363	GTTC	2	8	51987	51994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006363	ACCA	2	8	52014	52021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006363	GCTC	2	8	52058	52065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006363	CCTT	2	8	53454	53461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006363	CAGG	2	8	53611	53618	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006363	TCAT	2	8	55343	55350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006363	CCGA	2	8	55848	55855	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006363	GCCT	2	8	56227	56234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006363	CCTG	2	8	56920	56927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006363	CAGG	2	8	57142	57149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_006363	CCCG	2	8	57229	57236	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_006363	CCGG	2	8	57275	57282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006363	CGTC	2	8	60860	60867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006363	CACC	2	8	61175	61182	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_006363	TCCT	2	8	61245	61252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006363	GGAA	2	8	61258	61265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006363	GGTC	2	8	61304	61311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006363	CCAT	2	8	61471	61478	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006363	GTCC	2	8	65393	65400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006363	CGAG	2	8	67260	67267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006363	CCCG	2	8	68008	68015	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_006363	ACGG	2	8	68043	68050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_006363	CCGG	2	8	68942	68949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_006363	TCCC	2	8	74979	74986	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_006363	TCGC	2	8	76546	76553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006363	AGCG	2	8	80805	80812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006363	GCTC	2	8	83517	83524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006363	ACCG	2	8	83546	83553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.