MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006363	GGGC	2	8	45	52	0 %	0 %	75 %	25 %	54027810
2	NC_006363	CACG	2	8	318	325	25 %	0 %	25 %	50 %	54027810
3	NC_006363	GCAG	2	8	920	927	25 %	0 %	50 %	25 %	54027811
4	NC_006363	GGGT	2	8	1761	1768	0 %	25 %	75 %	0 %	54027812
5	NC_006363	GGTG	2	8	1770	1777	0 %	25 %	75 %	0 %	54027812
6	NC_006363	GGCG	2	8	1880	1887	0 %	0 %	75 %	25 %	54027812
7	NC_006363	CGAG	3	12	1986	1997	25 %	0 %	50 %	25 %	54027812
8	NC_006363	CGAG	2	8	2458	2465	25 %	0 %	50 %	25 %	54027812
9	NC_006363	CCAG	2	8	3263	3270	25 %	0 %	25 %	50 %	54027812
10	NC_006363	CCAG	2	8	4139	4146	25 %	0 %	25 %	50 %	54027814
11	NC_006363	CCAT	2	8	4201	4208	25 %	25 %	0 %	50 %	54027814
12	NC_006363	GGCG	2	8	4537	4544	0 %	0 %	75 %	25 %	54027814
13	NC_006363	TGCC	2	8	4971	4978	0 %	25 %	25 %	50 %	54027815
14	NC_006363	CCGC	2	8	5055	5062	0 %	0 %	25 %	75 %	54027815
15	NC_006363	GGCC	2	8	5747	5754	0 %	0 %	50 %	50 %	54027816
16	NC_006363	GTGG	2	8	5795	5802	0 %	25 %	75 %	0 %	54027816
17	NC_006363	TGAG	2	8	6111	6118	25 %	25 %	50 %	0 %	54027817
18	NC_006363	GCGG	2	8	6127	6134	0 %	0 %	75 %	25 %	54027817
19	NC_006363	GACG	2	8	7230	7237	25 %	0 %	50 %	25 %	54027821
20	NC_006363	GGCG	2	8	7370	7377	0 %	0 %	75 %	25 %	54027821
21	NC_006363	CGAT	2	8	7475	7482	25 %	25 %	25 %	25 %	54027821
22	NC_006363	GCTG	2	8	7515	7522	0 %	25 %	50 %	25 %	54027821
23	NC_006363	GCGA	2	8	7831	7838	25 %	0 %	50 %	25 %	54027821
24	NC_006363	GGGC	2	8	8412	8419	0 %	0 %	75 %	25 %	54027821
25	NC_006363	CCAC	3	12	8912	8923	25 %	0 %	0 %	75 %	54027821
26	NC_006363	CCGC	2	8	8937	8944	0 %	0 %	25 %	75 %	54027821
27	NC_006363	GCGG	2	8	8949	8956	0 %	0 %	75 %	25 %	54027821
28	NC_006363	GGCG	2	8	9478	9485	0 %	0 %	75 %	25 %	54027822
29	NC_006363	CCGG	2	8	10574	10581	0 %	0 %	50 %	50 %	54027823
30	NC_006363	CGAC	2	8	10872	10879	25 %	0 %	25 %	50 %	54027823
31	NC_006363	GGCG	2	8	10938	10945	0 %	0 %	75 %	25 %	54027823
32	NC_006363	GGTG	2	8	11377	11384	0 %	25 %	75 %	0 %	54027823
33	NC_006363	CGAA	2	8	11509	11516	50 %	0 %	25 %	25 %	54027823
34	NC_006363	CCAC	2	8	11622	11629	25 %	0 %	0 %	75 %	54027823
35	NC_006363	CGAG	2	8	11809	11816	25 %	0 %	50 %	25 %	54027823
36	NC_006363	CCCG	2	8	12108	12115	0 %	0 %	25 %	75 %	54027823
37	NC_006363	GGGC	2	8	12972	12979	0 %	0 %	75 %	25 %	54027824
38	NC_006363	GGGC	2	8	13196	13203	0 %	0 %	75 %	25 %	54027824
39	NC_006363	CCAG	2	8	13690	13697	25 %	0 %	25 %	50 %	54027824
40	NC_006363	GCGG	2	8	13939	13946	0 %	0 %	75 %	25 %	54027824
41	NC_006363	GGCC	2	8	14051	14058	0 %	0 %	50 %	50 %	54027824
42	NC_006363	GACC	2	8	14195	14202	25 %	0 %	25 %	50 %	54027824
43	NC_006363	ACCG	2	8	14439	14446	25 %	0 %	25 %	50 %	54027824
44	NC_006363	CGGG	2	8	14654	14661	0 %	0 %	75 %	25 %	54027824
45	NC_006363	CGCC	2	8	14804	14811	0 %	0 %	25 %	75 %	54027824
46	NC_006363	CTCG	2	8	15157	15164	0 %	25 %	25 %	50 %	54027825
47	NC_006363	TGAG	2	8	16516	16523	25 %	25 %	50 %	0 %	54027827
48	NC_006363	GTCG	2	8	16806	16813	0 %	25 %	50 %	25 %	54027828
49	NC_006363	TCGG	2	8	16945	16952	0 %	25 %	50 %	25 %	54027828
50	NC_006363	CCCG	2	8	18729	18736	0 %	0 %	25 %	75 %	54027830
51	NC_006363	GGTC	2	8	19488	19495	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
52	NC_006363	TGCG	2	8	20327	20334	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
53	NC_006363	GGTG	2	8	20343	20350	0 %	25 %	75 %	0 %	54027831
54	NC_006363	TTCG	2	8	20428	20435	0 %	50 %	25 %	25 %	54027831
55	NC_006363	TGGC	2	8	20634	20641	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
56	NC_006363	GTTG	2	8	20664	20671	0 %	50 %	50 %	0 %	54027831
57	NC_006363	GTTG	2	8	20910	20917	0 %	50 %	50 %	0 %	54027831
58	NC_006363	CGGT	2	8	21044	21051	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
59	NC_006363	GTTC	2	8	21097	21104	0 %	50 %	25 %	25 %	54027831
60	NC_006363	CCGA	2	8	21194	21201	25 %	0 %	25 %	50 %	54027831
61	NC_006363	CGTT	2	8	21257	21264	0 %	50 %	25 %	25 %	54027831
62	NC_006363	TGGT	2	8	22244	22251	0 %	50 %	50 %	0 %	54027831
63	NC_006363	GCCC	2	8	22299	22306	0 %	0 %	25 %	75 %	54027831
64	NC_006363	CCCG	2	8	22539	22546	0 %	0 %	25 %	75 %	54027831
65	NC_006363	CAGC	2	8	23472	23479	25 %	0 %	25 %	50 %	54027831
66	NC_006363	CGGT	2	8	23969	23976	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
67	NC_006363	GATC	2	8	24126	24133	25 %	25 %	25 %	25 %	54027831
68	NC_006363	GGCT	2	8	25537	25544	0 %	25 %	50 %	25 %	54027834
69	NC_006363	TCGC	2	8	26041	26048	0 %	25 %	25 %	50 %	54027834
70	NC_006363	CCAC	2	8	26619	26626	25 %	0 %	0 %	75 %	54027836
71	NC_006363	CGCC	2	8	26752	26759	0 %	0 %	25 %	75 %	54027836
72	NC_006363	TGCC	2	8	27058	27065	0 %	25 %	25 %	50 %	54027836
73	NC_006363	CGTC	2	8	27166	27173	0 %	25 %	25 %	50 %	54027836
74	NC_006363	TCCG	2	8	27557	27564	0 %	25 %	25 %	50 %	54027837
75	NC_006363	CGCC	2	8	28394	28401	0 %	0 %	25 %	75 %	54027839
76	NC_006363	CGGT	2	8	28449	28456	0 %	25 %	50 %	25 %	54027839
77	NC_006363	CCGG	2	8	29122	29129	0 %	0 %	50 %	50 %	54027840
78	NC_006363	GCTC	2	8	29197	29204	0 %	25 %	25 %	50 %	54027840
79	NC_006363	CGGT	2	8	30252	30259	0 %	25 %	50 %	25 %	54027840
80	NC_006363	CCGG	2	8	31033	31040	0 %	0 %	50 %	50 %	54027840
81	NC_006363	TGAG	2	8	31734	31741	25 %	25 %	50 %	0 %	54027841
82	NC_006363	GGCG	2	8	31805	31812	0 %	0 %	75 %	25 %	54027841
83	NC_006363	GCCA	2	8	31993	32000	25 %	0 %	25 %	50 %	54027841
84	NC_006363	GGTC	2	8	32327	32334	0 %	25 %	50 %	25 %	54027841
85	NC_006363	GGAC	2	8	32477	32484	25 %	0 %	50 %	25 %	54027842
86	NC_006363	CCGC	2	8	33680	33687	0 %	0 %	25 %	75 %	54027842
87	NC_006363	GCCC	2	8	33783	33790	0 %	0 %	25 %	75 %	54027842
88	NC_006363	GGCC	2	8	35049	35056	0 %	0 %	50 %	50 %	54027845
89	NC_006363	CGCA	2	8	35145	35152	25 %	0 %	25 %	50 %	54027845
90	NC_006363	GGGC	2	8	35922	35929	0 %	0 %	75 %	25 %	54027846
91	NC_006363	TGGA	2	8	36058	36065	25 %	25 %	50 %	0 %	54027846
92	NC_006363	CCGT	2	8	37039	37046	0 %	25 %	25 %	50 %	54027848
93	NC_006363	GCCG	2	8	37136	37143	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
94	NC_006363	GCGG	2	8	37285	37292	0 %	0 %	75 %	25 %	54027848
95	NC_006363	CAGT	2	8	38107	38114	25 %	25 %	25 %	25 %	54027848
96	NC_006363	AGGC	2	8	39264	39271	25 %	0 %	50 %	25 %	54027848
97	NC_006363	CACC	2	8	40066	40073	25 %	0 %	0 %	75 %	54027849
98	NC_006363	ACCA	2	8	40265	40272	50 %	0 %	0 %	50 %	54027849
99	NC_006363	GCTG	2	8	40777	40784	0 %	25 %	50 %	25 %	54027849
100	NC_006363	ACCG	2	8	40802	40809	25 %	0 %	25 %	50 %	54027849
101	NC_006363	GACC	2	8	40840	40847	25 %	0 %	25 %	50 %	54027849
102	NC_006363	TCCT	2	8	42194	42201	0 %	50 %	0 %	50 %	54027850
103	NC_006363	CGCC	2	8	42738	42745	0 %	0 %	25 %	75 %	54027851
104	NC_006363	GGCC	2	8	43055	43062	0 %	0 %	50 %	50 %	54027851
105	NC_006363	CTGC	2	8	43476	43483	0 %	25 %	25 %	50 %	54027852
106	NC_006363	CAGC	2	8	43699	43706	25 %	0 %	25 %	50 %	54027852
107	NC_006363	ATCG	2	8	43795	43802	25 %	25 %	25 %	25 %	54027852
108	NC_006363	ACCA	2	8	43992	43999	50 %	0 %	0 %	50 %	54027853
109	NC_006363	TGCC	2	8	45008	45015	0 %	25 %	25 %	50 %	54027854
110	NC_006363	CAGC	2	8	45448	45455	25 %	0 %	25 %	50 %	54027854
111	NC_006363	CGAG	2	8	45489	45496	25 %	0 %	50 %	25 %	54027854
112	NC_006363	TGGC	2	8	45505	45512	0 %	25 %	50 %	25 %	54027854
113	NC_006363	ACCC	2	8	46043	46050	25 %	0 %	0 %	75 %	54027854
114	NC_006363	CTTG	2	8	46227	46234	0 %	50 %	25 %	25 %	54027854
115	NC_006363	ACGA	2	8	47552	47559	50 %	0 %	25 %	25 %	54027854
116	NC_006363	ACCG	2	8	47895	47902	25 %	0 %	25 %	50 %	54027855
117	NC_006363	GCCC	2	8	47969	47976	0 %	0 %	25 %	75 %	54027855
118	NC_006363	CGAC	2	8	49337	49344	25 %	0 %	25 %	50 %	54027857
119	NC_006363	GATC	2	8	49462	49469	25 %	25 %	25 %	25 %	54027857
120	NC_006363	TCAG	2	8	50734	50741	25 %	25 %	25 %	25 %	54027860
121	NC_006363	CCGC	2	8	51261	51268	0 %	0 %	25 %	75 %	54027860
122	NC_006363	GAGT	2	8	51559	51566	25 %	25 %	50 %	0 %	54027860
123	NC_006363	CCCG	2	8	52235	52242	0 %	0 %	25 %	75 %	54027861
124	NC_006363	CGGG	2	8	52314	52321	0 %	0 %	75 %	25 %	54027861
125	NC_006363	CCGG	2	8	53710	53717	0 %	0 %	50 %	50 %	54027863
126	NC_006363	GCGG	2	8	53880	53887	0 %	0 %	75 %	25 %	54027863
127	NC_006363	CAGG	2	8	53934	53941	25 %	0 %	50 %	25 %	54027863
128	NC_006363	CGAC	2	8	54439	54446	25 %	0 %	25 %	50 %	54027864
129	NC_006363	TCGG	2	8	54585	54592	0 %	25 %	50 %	25 %	54027864
130	NC_006363	GCCC	2	8	55075	55082	0 %	0 %	25 %	75 %	54027864
131	NC_006363	CCCG	2	8	55109	55116	0 %	0 %	25 %	75 %	54027864
132	NC_006363	AGCC	2	8	56667	56674	25 %	0 %	25 %	50 %	54027866
133	NC_006363	CGTT	2	8	56793	56800	0 %	50 %	25 %	25 %	54027866
134	NC_006363	CCGC	2	8	58593	58600	0 %	0 %	25 %	75 %	54027868
135	NC_006363	CACC	2	8	58913	58920	25 %	0 %	0 %	75 %	54027869
136	NC_006363	GGCC	2	8	59583	59590	0 %	0 %	50 %	50 %	54027869
137	NC_006363	ACCG	2	8	59635	59642	25 %	0 %	25 %	50 %	54027869
138	NC_006363	ACCC	2	8	59668	59675	25 %	0 %	0 %	75 %	54027869
139	NC_006363	CGCC	2	8	60097	60104	0 %	0 %	25 %	75 %	54027870
140	NC_006363	TGGC	2	8	60122	60129	0 %	25 %	50 %	25 %	54027870
141	NC_006363	CCAC	2	8	60414	60421	25 %	0 %	0 %	75 %	54027870
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143	NC_006363	AGCC	2	8	60709	60716	25 %	0 %	25 %	50 %	54027870
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.