MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006363	CG	4	8	243	250	0 %	0 %	50 %	50 %	54027810
2	NC_006363	CA	3	6	476	481	50 %	0 %	0 %	50 %	54027810
3	NC_006363	GC	3	6	903	908	0 %	0 %	50 %	50 %	54027811
4	NC_006363	AG	3	6	1487	1492	50 %	0 %	50 %	0 %	54027811
5	NC_006363	GC	3	6	2640	2645	0 %	0 %	50 %	50 %	54027812
6	NC_006363	GC	4	8	2840	2847	0 %	0 %	50 %	50 %	54027812
7	NC_006363	GC	3	6	2939	2944	0 %	0 %	50 %	50 %	54027812
8	NC_006363	GC	3	6	3351	3356	0 %	0 %	50 %	50 %	54027812
9	NC_006363	TA	3	6	3926	3931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006363	CA	3	6	3978	3983	50 %	0 %	0 %	50 %	54027814
11	NC_006363	GC	3	6	4281	4286	0 %	0 %	50 %	50 %	54027814
12	NC_006363	CG	3	6	5070	5075	0 %	0 %	50 %	50 %	54027815
13	NC_006363	CG	3	6	6215	6220	0 %	0 %	50 %	50 %	54027817
14	NC_006363	GC	3	6	7575	7580	0 %	0 %	50 %	50 %	54027821
15	NC_006363	CG	3	6	8214	8219	0 %	0 %	50 %	50 %	54027821
16	NC_006363	GC	3	6	10234	10239	0 %	0 %	50 %	50 %	54027823
17	NC_006363	GC	3	6	10588	10593	0 %	0 %	50 %	50 %	54027823
18	NC_006363	AC	3	6	10878	10883	50 %	0 %	0 %	50 %	54027823
19	NC_006363	GC	3	6	11015	11020	0 %	0 %	50 %	50 %	54027823
20	NC_006363	CG	3	6	11327	11332	0 %	0 %	50 %	50 %	54027823
21	NC_006363	CG	3	6	11936	11941	0 %	0 %	50 %	50 %	54027823
22	NC_006363	CG	3	6	12235	12240	0 %	0 %	50 %	50 %	54027823
23	NC_006363	GC	3	6	13207	13212	0 %	0 %	50 %	50 %	54027824
24	NC_006363	GC	3	6	13646	13651	0 %	0 %	50 %	50 %	54027824
25	NC_006363	CG	3	6	13781	13786	0 %	0 %	50 %	50 %	54027824
26	NC_006363	TG	3	6	16657	16662	0 %	50 %	50 %	0 %	54027828
27	NC_006363	GC	3	6	17994	17999	0 %	0 %	50 %	50 %	54027829
28	NC_006363	GC	3	6	18493	18498	0 %	0 %	50 %	50 %	54027830
29	NC_006363	GC	3	6	22135	22140	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
30	NC_006363	GC	3	6	22400	22405	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
31	NC_006363	GC	3	6	23388	23393	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
32	NC_006363	CG	3	6	23657	23662	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
33	NC_006363	CG	3	6	24795	24800	0 %	0 %	50 %	50 %	54027833
34	NC_006363	GC	3	6	26192	26197	0 %	0 %	50 %	50 %	54027835
35	NC_006363	AC	3	6	26541	26546	50 %	0 %	0 %	50 %	54027835
36	NC_006363	CG	3	6	26708	26713	0 %	0 %	50 %	50 %	54027836
37	NC_006363	CG	3	6	26891	26896	0 %	0 %	50 %	50 %	54027836
38	NC_006363	CG	4	8	27622	27629	0 %	0 %	50 %	50 %	54027837
39	NC_006363	CA	3	6	27661	27666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006363	CG	3	6	28206	28211	0 %	0 %	50 %	50 %	54027839
41	NC_006363	CG	3	6	28978	28983	0 %	0 %	50 %	50 %	54027840
42	NC_006363	GC	3	6	29700	29705	0 %	0 %	50 %	50 %	54027840
43	NC_006363	GC	3	6	29740	29745	0 %	0 %	50 %	50 %	54027840
44	NC_006363	GC	3	6	30634	30639	0 %	0 %	50 %	50 %	54027840
45	NC_006363	CG	3	6	30738	30743	0 %	0 %	50 %	50 %	54027840
46	NC_006363	CG	4	8	31044	31051	0 %	0 %	50 %	50 %	54027840
47	NC_006363	GC	3	6	31394	31399	0 %	0 %	50 %	50 %	54027840
48	NC_006363	GC	4	8	32179	32186	0 %	0 %	50 %	50 %	54027841
49	NC_006363	AC	3	6	32654	32659	50 %	0 %	0 %	50 %	54027842
50	NC_006363	CG	4	8	32804	32811	0 %	0 %	50 %	50 %	54027842
51	NC_006363	AC	3	6	34212	34217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006363	AC	3	6	34243	34248	50 %	0 %	0 %	50 %	54027844
53	NC_006363	AC	3	6	34258	34263	50 %	0 %	0 %	50 %	54027844
54	NC_006363	AC	3	6	34739	34744	50 %	0 %	0 %	50 %	54027844
55	NC_006363	CA	3	6	34748	34753	50 %	0 %	0 %	50 %	54027844
56	NC_006363	CG	3	6	34994	34999	0 %	0 %	50 %	50 %	54027845
57	NC_006363	CG	3	6	35996	36001	0 %	0 %	50 %	50 %	54027846
58	NC_006363	GC	3	6	37315	37320	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
59	NC_006363	GC	3	6	37359	37364	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
60	NC_006363	GC	3	6	37709	37714	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
61	NC_006363	GC	3	6	38179	38184	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
62	NC_006363	CG	3	6	38563	38568	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
63	NC_006363	GC	3	6	38626	38631	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
64	NC_006363	CG	3	6	38929	38934	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
65	NC_006363	GC	3	6	39616	39621	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
66	NC_006363	GC	3	6	43655	43660	0 %	0 %	50 %	50 %	54027852
67	NC_006363	CG	3	6	43862	43867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_006363	GC	3	6	45070	45075	0 %	0 %	50 %	50 %	54027854
69	NC_006363	CG	3	6	46361	46366	0 %	0 %	50 %	50 %	54027854
70	NC_006363	CA	3	6	46396	46401	50 %	0 %	0 %	50 %	54027854
71	NC_006363	GC	3	6	46403	46408	0 %	0 %	50 %	50 %	54027854
72	NC_006363	CG	3	6	46605	46610	0 %	0 %	50 %	50 %	54027854
73	NC_006363	GA	3	6	47197	47202	50 %	0 %	50 %	0 %	54027854
74	NC_006363	GA	3	6	47449	47454	50 %	0 %	50 %	0 %	54027854
75	NC_006363	GC	3	6	48311	48316	0 %	0 %	50 %	50 %	54027855
76	NC_006363	GA	3	6	48347	48352	50 %	0 %	50 %	0 %	54027855
77	NC_006363	GA	3	6	48798	48803	50 %	0 %	50 %	0 %	54027856
78	NC_006363	GC	3	6	50494	50499	0 %	0 %	50 %	50 %	54027859
79	NC_006363	TG	3	6	51038	51043	0 %	50 %	50 %	0 %	54027860
80	NC_006363	CG	3	6	51365	51370	0 %	0 %	50 %	50 %	54027860
81	NC_006363	GC	4	8	51719	51726	0 %	0 %	50 %	50 %	54027860
82	NC_006363	CG	3	6	52129	52134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_006363	CG	3	6	52329	52334	0 %	0 %	50 %	50 %	54027861
84	NC_006363	TG	3	6	52566	52571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006363	TC	3	6	52850	52855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006363	GT	3	6	53554	53559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006363	CG	3	6	53778	53783	0 %	0 %	50 %	50 %	54027863
88	NC_006363	GC	3	6	53814	53819	0 %	0 %	50 %	50 %	54027863
89	NC_006363	GC	3	6	57987	57992	0 %	0 %	50 %	50 %	54027867
90	NC_006363	GA	3	6	58280	58285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006363	TG	3	6	58351	58356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006363	CG	3	6	58435	58440	0 %	0 %	50 %	50 %	54027868
93	NC_006363	GC	3	6	59037	59042	0 %	0 %	50 %	50 %	54027869
94	NC_006363	GC	3	6	59151	59156	0 %	0 %	50 %	50 %	54027869
95	NC_006363	GC	3	6	61393	61398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_006363	CG	3	6	61513	61518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_006363	CG	3	6	62252	62257	0 %	0 %	50 %	50 %	54027873
98	NC_006363	GC	4	8	62380	62387	0 %	0 %	50 %	50 %	54027873
99	NC_006363	CG	3	6	62520	62525	0 %	0 %	50 %	50 %	54027874
100	NC_006363	GC	3	6	62596	62601	0 %	0 %	50 %	50 %	54027874
101	NC_006363	GC	3	6	63811	63816	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
102	NC_006363	GC	4	8	63943	63950	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
103	NC_006363	CG	3	6	64192	64197	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
104	NC_006363	GC	3	6	64224	64229	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
105	NC_006363	GC	3	6	64265	64270	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
106	NC_006363	GC	3	6	64494	64499	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
107	NC_006363	GT	3	6	64894	64899	0 %	50 %	50 %	0 %	54027876
108	NC_006363	CT	3	6	65088	65093	0 %	50 %	0 %	50 %	54027876
109	NC_006363	GC	3	6	65095	65100	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
110	NC_006363	AC	3	6	65150	65155	50 %	0 %	0 %	50 %	54027876
111	NC_006363	CA	3	6	65665	65670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_006363	GT	3	6	66594	66599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006363	CG	3	6	67171	67176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_006363	GC	3	6	67228	67233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_006363	GC	3	6	67319	67324	0 %	0 %	50 %	50 %	54027881
116	NC_006363	GC	3	6	67889	67894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_006363	CG	4	8	68182	68189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006363	CG	3	6	69127	69132	0 %	0 %	50 %	50 %	54027883
119	NC_006363	GC	3	6	69800	69805	0 %	0 %	50 %	50 %	54027884
120	NC_006363	CG	3	6	70614	70619	0 %	0 %	50 %	50 %	54027886
121	NC_006363	GC	3	6	71852	71857	0 %	0 %	50 %	50 %	54027887
122	NC_006363	GC	3	6	71951	71956	0 %	0 %	50 %	50 %	54027887
123	NC_006363	CG	3	6	72436	72441	0 %	0 %	50 %	50 %	54027887
124	NC_006363	CG	3	6	72564	72569	0 %	0 %	50 %	50 %	54027887
125	NC_006363	GT	3	6	72786	72791	0 %	50 %	50 %	0 %	54027887
126	NC_006363	CA	4	8	72799	72806	50 %	0 %	0 %	50 %	54027887
127	NC_006363	GC	3	6	74434	74439	0 %	0 %	50 %	50 %	54027890
128	NC_006363	GC	3	6	74582	74587	0 %	0 %	50 %	50 %	54027890
129	NC_006363	GC	3	6	74833	74838	0 %	0 %	50 %	50 %	54027890
130	NC_006363	GC	3	6	75093	75098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_006363	CA	3	6	75103	75108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_006363	GC	3	6	75233	75238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006363	CT	3	6	75533	75538	0 %	50 %	0 %	50 %	54027891
134	NC_006363	CG	3	6	76419	76424	0 %	0 %	50 %	50 %	54027893
135	NC_006363	GC	3	6	76522	76527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_006363	CG	3	6	76957	76962	0 %	0 %	50 %	50 %	54027894
137	NC_006363	GC	3	6	76999	77004	0 %	0 %	50 %	50 %	54027894
138	NC_006363	GC	3	6	77161	77166	0 %	0 %	50 %	50 %	54027894
139	NC_006363	CG	3	6	77633	77638	0 %	0 %	50 %	50 %	54027895
140	NC_006363	CG	3	6	78277	78282	0 %	0 %	50 %	50 %	54027895
141	NC_006363	GT	3	6	79089	79094	0 %	50 %	50 %	0 %	54027897
142	NC_006363	CG	3	6	80125	80130	0 %	0 %	50 %	50 %	54027897
143	NC_006363	CG	3	6	81072	81077	0 %	0 %	50 %	50 %	54027899
144	NC_006363	CG	3	6	81484	81489	0 %	0 %	50 %	50 %	54027899
145	NC_006363	GC	3	6	81861	81866	0 %	0 %	50 %	50 %	54027899
146	NC_006363	CG	3	6	82249	82254	0 %	0 %	50 %	50 %	54027899
147	NC_006363	CG	3	6	82660	82665	0 %	0 %	50 %	50 %	54027899
148	NC_006363	TC	3	6	83047	83052	0 %	50 %	0 %	50 %	54027900
149	NC_006363	CA	3	6	83734	83739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_006363	CG	5	10	83972	83981	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
151	NC_006363	CG	4	8	83996	84003	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
152	NC_006363	CG	3	6	84008	84013	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
153	NC_006363	CG	5	10	84039	84048	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
154	NC_006363	CG	5	10	84062	84071	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
155	NC_006363	CG	4	8	84096	84103	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
156	NC_006363	CG	4	8	84107	84114	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
157	NC_006363	GC	4	8	84119	84126	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
158	NC_006363	CG	4	8	84139	84146	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
159	NC_006363	CG	4	8	84169	84176	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
160	NC_006363	GC	3	6	84189	84194	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
161	NC_006363	CG	5	10	84218	84227	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
162	NC_006363	CG	3	6	84233	84238	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
163	NC_006363	CG	3	6	84255	84260	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
164	NC_006363	GT	3	6	84280	84285	0 %	50 %	50 %	0 %	54027901
165	NC_006363	GC	3	6	84291	84296	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
166	NC_006363	GC	3	6	84340	84345	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
167	NC_006363	CG	4	8	84364	84371	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
168	NC_006363	CG	3	6	84398	84403	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
169	NC_006363	CG	5	10	84419	84428	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
170	NC_006363	CG	3	6	84467	84472	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
171	NC_006363	CG	4	8	84488	84495	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
172	NC_006363	CG	3	6	84498	84503	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
173	NC_006363	CG	4	8	84511	84518	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
174	NC_006363	CG	3	6	84524	84529	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
175	NC_006363	GC	3	6	84546	84551	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
176	NC_006363	CG	4	8	84565	84572	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
177	NC_006363	CG	4	8	84584	84591	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
178	NC_006363	CG	5	10	84610	84619	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
179	NC_006363	CG	4	8	84667	84674	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
180	NC_006363	CG	3	6	84686	84691	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
181	NC_006363	GC	3	6	84879	84884	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
182	NC_006363	GC	4	8	85724	85731	0 %	0 %	50 %	50 %	54027902
183	NC_006363	GC	5	10	85736	85745	0 %	0 %	50 %	50 %	54027902
184	NC_006363	GC	3	6	85855	85860	0 %	0 %	50 %	50 %	54027902
185	NC_006363	CG	3	6	85924	85929	0 %	0 %	50 %	50 %	54027902
186	NC_006363	CG	3	6	86428	86433	0 %	0 %	50 %	50 %	54027902
187	NC_006363	CG	3	6	86584	86589	0 %	0 %	50 %	50 %	54027902

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.