MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006362	GACTG	2	10	10307	10316	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_006362	GGTTC	2	10	13503	13512	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_006362	CCGGA	2	10	23310	23319	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_006362	ATCGA	2	10	32343	32352	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006362	TGTCG	2	10	32903	32912	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006362	GGGAG	2	10	33027	33036	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006362	GAACT	2	10	34145	34154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_006362	TGTCG	3	15	34801	34815	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_006362	ACGGA	2	10	35006	35015	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006362	GAACC	2	10	35905	35914	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_006362	GCCCG	2	10	49733	49742	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_006362	GGGTG	2	10	54589	54598	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006362	CCGAC	2	10	57767	57776	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_006362	GTGCG	2	10	65485	65494	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_006362	CCGGC	2	10	81537	81546	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_006362	CAGGA	2	10	84106	84115	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_006362	CAACA	2	10	84985	84994	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_006362	CGGCG	2	10	88527	88536	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_006362	GGTCG	2	10	90460	90469	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_006362	CGCGC	2	10	96311	96320	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_006362	GGCCG	2	10	96977	96986	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_006362	GCGGT	2	10	99807	99816	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_006362	ACGGA	2	10	100388	100397	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_006362	GCGGA	2	10	104157	104166	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_006362	CCGGA	2	10	112513	112522	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_006362	GCAGC	2	10	113357	113366	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_006362	GTTGG	2	10	113478	113487	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006362	CCCTC	2	10	120788	120797	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_006362	CAGCA	2	10	124119	124128	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_006362	TGCAA	2	10	151820	151829	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006362	CCTGC	2	10	164555	164564	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_006362	CACTC	2	10	174635	174644	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_006362	CCACG	2	10	179548	179557	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.