MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006362	GCCG	2	8	6649	6656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006362	CTTC	2	8	10230	10237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006362	CGTC	2	8	13303	13310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006362	CGGG	2	8	21142	21149	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006362	GCCC	2	8	22957	22964	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_006362	GACC	2	8	23399	23406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006362	CTCG	2	8	23515	23522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006362	CCGT	2	8	23565	23572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006362	GCAG	2	8	23605	23612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006362	TGTC	2	8	24399	24406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006362	ACGA	2	8	27771	27778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006362	CCGG	2	8	27841	27848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006362	GGCG	2	8	28540	28547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006362	CCTG	2	8	33379	33386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006362	GATC	2	8	34023	34030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_006362	GGTG	2	8	34365	34372	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006362	GCCG	2	8	34839	34846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006362	GCAG	2	8	34981	34988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006362	GTCG	2	8	35117	35124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006362	CGGA	2	8	35374	35381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006362	CCGG	2	8	35685	35692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006362	CAAC	2	8	35872	35879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006362	TCGT	2	8	36296	36303	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006362	GGTG	2	8	36606	36613	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006362	CACC	2	8	36895	36902	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_006362	GCCC	2	8	47609	47616	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_006362	AGGG	2	8	51481	51488	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006362	GCGT	2	8	53704	53711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_006362	GTCC	2	8	57695	57702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006362	TCCT	2	8	59133	59140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006362	CGAC	2	8	59544	59551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006362	GTCG	2	8	61940	61947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006362	CTGG	2	8	63484	63491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006362	CGGC	2	8	65332	65339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_006362	TGAT	2	8	65364	65371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006362	CCGT	2	8	68525	68532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006362	CCGG	2	8	68579	68586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006362	CGGT	2	8	76841	76848	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006362	AGTG	2	8	77036	77043	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006362	TTCG	2	8	81394	81401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006362	GCTC	2	8	81572	81579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_006362	AGGT	2	8	84148	84155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006362	AGTC	2	8	84596	84603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006362	GCTC	2	8	84777	84784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006362	ATGT	2	8	85049	85056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006362	AAGC	2	8	85126	85133	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006362	CCGA	2	8	86616	86623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006362	CTAG	2	8	95038	95045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006362	CGGT	2	8	95242	95249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_006362	CCGA	2	8	96270	96277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006362	ACCG	2	8	96290	96297	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006362	GGGC	2	8	99701	99708	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_006362	AGCG	2	8	99745	99752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_006362	GCGA	2	8	100235	100242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006362	ATAC	2	8	100351	100358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_006362	CCGG	2	8	100649	100656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006362	CAGC	2	8	100927	100934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006362	CGGC	2	8	101180	101187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006362	GCGG	2	8	104380	104387	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_006362	CGCC	2	8	111129	111136	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_006362	CTTC	2	8	111891	111898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_006362	CCCG	2	8	111965	111972	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_006362	CGGG	2	8	111981	111988	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_006362	CCGC	2	8	112950	112957	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_006362	CGTT	2	8	113132	113139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_006362	GGGC	2	8	113154	113161	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_006362	CGCC	2	8	113228	113235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_006362	CGAA	2	8	113239	113246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_006362	CAGA	2	8	120701	120708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_006362	CGCC	2	8	120711	120718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_006362	ACAG	2	8	121676	121683	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006362	AGCG	2	8	121729	121736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006362	CCAG	2	8	123973	123980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006362	GCCG	2	8	124240	124247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006362	TCCT	2	8	125661	125668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006362	GCGG	2	8	125800	125807	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_006362	CTTC	2	8	127429	127436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006362	GGCA	2	8	147596	147603	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_006362	CCCT	2	8	151615	151622	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_006362	CGTC	2	8	153325	153332	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006362	GACG	2	8	153347	153354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_006362	GGCG	2	8	153759	153766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_006362	CGTT	2	8	154824	154831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_006362	GTCG	2	8	161402	161409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_006362	TCCT	2	8	168552	168559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006362	TACT	2	8	174676	174683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_006362	GTCG	2	8	180789	180796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_006362	GCCG	2	8	183126	183133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006362	GCCG	2	8	183628	183635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.