MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 473

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006362	GGA	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006362	ACC	2	6	1900	1905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_006362	GCA	2	6	1934	1939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006362	GGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006362	CGG	2	6	4913	4918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006362	GGC	2	6	4948	4953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006362	GCG	2	6	5842	5847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006362	GTC	2	6	5962	5967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006362	GCT	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006362	TCT	2	6	6506	6511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006362	CTT	2	6	6580	6585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006362	GGC	2	6	6606	6611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006362	AGT	2	6	7381	7386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006362	ATT	2	6	10294	10299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006362	CAA	2	6	10317	10322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006362	GAC	2	6	12122	12127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006362	GAC	2	6	13220	13225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006362	ATC	2	6	13234	13239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006362	TCA	2	6	13266	13271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006362	CAC	2	6	13289	13294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_006362	CCG	2	6	13356	13361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_006362	GGT	2	6	13406	13411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006362	CCG	2	6	13416	13421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_006362	ATC	2	6	13531	13536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006362	GAG	2	6	20272	20277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006362	TGC	2	6	20280	20285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006362	ACC	2	6	21018	21023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_006362	CGG	2	6	21035	21040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006362	CCG	2	6	21044	21049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_006362	CGG	2	6	21059	21064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006362	GAT	2	6	21094	21099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006362	CAG	2	6	21119	21124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006362	GCG	2	6	21174	21179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006362	GGC	2	6	22879	22884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006362	GCC	2	6	22911	22916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_006362	GCG	2	6	23005	23010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006362	GTG	2	6	23065	23070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006362	CCA	2	6	23233	23238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_006362	TCG	2	6	23247	23252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006362	TGG	3	9	23253	23261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006362	CGG	2	6	23278	23283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006362	GTG	2	6	23300	23305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006362	CAG	2	6	23381	23386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006362	ACG	2	6	23416	23421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006362	TGC	3	9	23427	23435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006362	AGG	2	6	23551	23556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006362	CTC	2	6	23624	23629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_006362	ATC	2	6	23688	23693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006362	CGA	3	9	23728	23736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006362	TGG	3	9	23802	23810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006362	TGG	2	6	23836	23841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006362	CGA	2	6	23860	23865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006362	TGG	2	6	23979	23984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006362	GGC	2	6	23991	23996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006362	GCT	2	6	23997	24002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006362	CGC	2	6	24003	24008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_006362	TGC	2	6	24011	24016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006362	TGC	2	6	24063	24068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006362	TGC	2	6	24191	24196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006362	GCA	2	6	24219	24224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006362	TGC	2	6	24227	24232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006362	TTG	2	6	24254	24259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006362	CCG	2	6	24304	24309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_006362	CGC	2	6	24438	24443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_006362	TGC	2	6	27004	27009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006362	GTA	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006362	ACA	2	6	27737	27742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006362	GCC	2	6	27793	27798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_006362	AGA	2	6	27884	27889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006362	CGG	2	6	27934	27939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006362	GCG	2	6	27948	27953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006362	TCA	2	6	28366	28371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006362	CCT	2	6	28379	28384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_006362	CCT	2	6	28422	28427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_006362	CCT	2	6	28432	28437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_006362	ACG	2	6	28462	28467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006362	GTG	2	6	28527	28532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006362	CTG	2	6	28576	28581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006362	GCT	2	6	28593	28598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006362	CGG	2	6	28683	28688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006362	GCA	2	6	28704	28709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006362	GCC	2	6	28765	28770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_006362	CCA	3	9	32144	32152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_006362	GAT	2	6	32222	32227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006362	GCC	2	6	32452	32457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_006362	CGG	2	6	32509	32514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006362	CTC	2	6	32854	32859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_006362	TGG	2	6	33078	33083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006362	GCC	2	6	33134	33139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_006362	GAT	2	6	33150	33155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006362	CGT	2	6	33227	33232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006362	TGC	2	6	33279	33284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006362	ACA	2	6	33327	33332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006362	GCC	3	9	33466	33474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_006362	TGG	2	6	33621	33626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006362	CCG	2	6	33749	33754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_006362	ACT	2	6	33755	33760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006362	AAG	2	6	33888	33893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006362	CGA	2	6	33984	33989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006362	CGA	2	6	34006	34011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006362	CGT	2	6	34045	34050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006362	TGG	2	6	34107	34112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006362	GGC	2	6	34204	34209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006362	CCG	2	6	34218	34223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_006362	CGC	2	6	34228	34233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_006362	TCA	2	6	34257	34262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006362	AGT	2	6	34274	34279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006362	CGC	2	6	34382	34387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_006362	TGC	2	6	34418	34423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006362	GAC	2	6	34459	34464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006362	CGG	2	6	34480	34485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006362	GCC	2	6	34512	34517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_006362	GAT	2	6	34593	34598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006362	CCA	2	6	34655	34660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_006362	TGA	2	6	34694	34699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006362	CAT	2	6	34762	34767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006362	GCT	2	6	34962	34967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006362	TGC	2	6	35022	35027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006362	AGG	2	6	35061	35066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006362	CAT	3	9	35181	35189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006362	GTC	2	6	35268	35273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006362	CCG	2	6	35301	35306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_006362	AAG	2	6	35460	35465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006362	GCT	5	15	35560	35574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006362	CGT	2	6	35575	35580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006362	TGA	3	9	35595	35603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006362	ATG	2	6	35609	35614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006362	GGC	2	6	35615	35620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006362	CGG	2	6	35629	35634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006362	ACG	2	6	35637	35642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006362	CAC	2	6	35751	35756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_006362	CGG	2	6	35768	35773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_006362	ACG	2	6	35803	35808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006362	CTG	2	6	35818	35823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006362	CGC	2	6	35880	35885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_006362	CGC	2	6	35928	35933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_006362	ACG	2	6	35935	35940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_006362	CAC	2	6	35976	35981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_006362	GCT	2	6	35998	36003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_006362	GCC	2	6	48998	49003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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412	NC_006362	GCA	2	6	128460	128465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_006362	CCG	2	6	179463	179468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.